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豫皖閩浙4省溪蟹并殖吸蟲囊蚴核糖體ITS2和線粒體CO1基因序列分析

發(fā)布時間:2020-12-20 14:04
  目的分析我國豫皖閩浙4省5地區(qū)溪蟹并殖吸蟲囊蚴核糖體內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)2 (ITS2)和線粒體細胞色素c氧化酶亞基I (CO1)基因序列,鑒定并殖吸蟲囊蚴蟲種。方法 2018年10月至2019年9月,于安徽省休寧縣藍田鎮(zhèn)、浙江省永嘉縣、河南省濟源市邵原鎮(zhèn)、福建省政和縣及漳州市等5個調(diào)查點采集溪蟹,分離溪蟹中并殖吸蟲,提取囊蚴基因組DNA,PCR擴增核糖體ITS2和線粒體C01基因,測序。采用DNA Star拼接各基因測序結(jié)果,并進行各序列間的比對,同時與GenBankTM中并殖吸蟲基因進行BLAST比對。基于ITS2、CO1序列,以肝片吸蟲為外群,采用鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。結(jié)果安徽省休寧縣藍田鎮(zhèn)、浙江省永嘉縣、河南省濟源市邵原鎮(zhèn)、福建省政和縣及漳州市等5個調(diào)查點的溪蟹并殖吸蟲囊蚴陽性率分別為82%(49/60)、41%(29/70)、55%(41/74)、65%(41/63)和45%(32/71)。ITS2、CO1擴增長度依次約為500 bp、450 bp。安徽省休寧縣藍田鎮(zhèn)和浙江省永嘉縣溪蟹并殖吸蟲囊蚴ITS2、CO1與衛(wèi)氏并殖吸蟲(KC417492.1,AF219379.2)的相似性最高... 

【文章來源】:中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2020年01期 北大核心

【文章頁數(shù)】:8 頁

【部分圖文】:

豫皖閩浙4省溪蟹并殖吸蟲囊蚴核糖體ITS2和線粒體CO1基因序列分析


豫皖閩浙4省5地區(qū)溪蟹并殖吸蟲囊蚴形態(tài)(×10)

序列,吸蟲,基因,囊蚴


并殖吸蟲ITS2、CO1基因PCR擴增結(jié)果

序列,吸蟲,囊蚴,進化樹


安徽省休寧縣藍田鎮(zhèn)和浙江省永嘉縣溪蟹并殖吸蟲囊蚴ITS2、CO1與衛(wèi)氏并殖吸蟲的相似性均最高(96%~100%),構(gòu)建的系統(tǒng)進化樹也聚為一支,且兩地基因遺傳距離最近,表明兩調(diào)查點獲取的并殖吸蟲囊蚴屬于衛(wèi)氏并殖吸蟲,該結(jié)論與之前報告相同[27-28]。河南省濟源市邵原鎮(zhèn)溪蟹并殖吸蟲囊蚴ITS2、CO1與斯氏并殖吸蟲的相似性最高(95%~100%),構(gòu)建的系統(tǒng)進化樹也聚為一支,表明該調(diào)查點為斯氏并殖吸蟲。福建省政和縣溪蟹并殖吸蟲囊蚴ITS2、CO1序列進化關(guān)系存在明顯差異,ITS2與斯氏并殖吸蟲的相似性最高(98%~100%),但與斯氏并殖吸蟲、宮崎并殖吸蟲聚為一大支,且兩蟲種分支不明顯;而CO1與宮崎并殖吸蟲基因相似性最高(91%~94%),構(gòu)建的系統(tǒng)進化樹也聚為一支。有研究認為宮崎并殖吸蟲是斯氏并殖吸蟲的一個亞種,遺傳距離非常接近[29],僅用核糖體ITS2序列分析不能鑒別,而線粒體CO1具有進化速率快,承受的環(huán)境選擇壓力較小,相對分子質(zhì)量小、母系遺傳、易于分析,能夠為并殖吸蟲的種內(nèi)遺傳提供更豐富的信息,所以CO1更適合于并殖吸蟲的分類鑒定及系統(tǒng)發(fā)育研究[30-31]。因此,福建省政和縣采集的溪蟹中分離的囊蚴為宮崎并殖吸蟲,本研究結(jié)果進一步證明了該結(jié)論。福建省漳州市采集的囊蚴核糖體ITS2與衛(wèi)氏并殖吸蟲的相似性最高(100%),而CO1與三平正并殖吸蟲的相似性最高(97%~99%),盡管相似性有差異,但在兩者構(gòu)建的系統(tǒng)進化樹中均與三平正并殖吸蟲聚為一支,此結(jié)果進一步說明CO1更適合于區(qū)分亞種關(guān)系,福建省漳州市獲取的囊蚴屬于三平正并殖吸蟲,該結(jié)論與蔡茂榮等[24]的研究結(jié)果一致。圖4 豫皖閩浙4省5地區(qū)并殖吸蟲囊蚴CO1基因序列系統(tǒng)進化樹分析

【參考文獻】:
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本文編號:2927996

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