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溶液順磁弛豫增強研究RNA的結(jié)構(gòu)及其動態(tài)變化

發(fā)布時間:2020-12-20 07:01
  RNA是以DNA為模板轉(zhuǎn)錄形成的一條單鏈分子。它既是信息分子,又是功能分子,除了作為遺傳物質(zhì)傳遞信息外,RNA在基因表達、信號傳導(dǎo)等生命活動中也有著重要的催化和調(diào)控作用。結(jié)構(gòu)的多樣性決定了功能的多樣性。然而,以PDB中蛋白質(zhì)已有的結(jié)構(gòu)數(shù)量為基準(zhǔn),RNA的結(jié)構(gòu)還不足1%,這與RNA結(jié)構(gòu)柔性所導(dǎo)致的研究方法缺乏直接相關(guān)。另一方面,隨著生物學(xué)的發(fā)展,結(jié)構(gòu)研究已經(jīng)不再局限于靜態(tài)結(jié)構(gòu),對于柔性單鏈的RNA而言,動態(tài)結(jié)構(gòu)研究也極為重要。因此,研究RNA的結(jié)構(gòu)及其動態(tài)變化意義重大。RNA結(jié)構(gòu)研究的常用方法有X射線晶體衍射、核磁共振和冷凍電鏡等。由于RNA較為動態(tài)不易結(jié)晶且分子量相對較小的特性,采用X射線晶體衍射或冷凍電鏡方法均無法獲得高分辨率的結(jié)構(gòu),而核磁共振方法不僅可以在近生理條件的溶液中進行實驗,還可以通過測定動態(tài)變化過程中的相關(guān)參數(shù)來觀察結(jié)構(gòu)變化。溶液順磁弛豫增強(sPRE)是一種能夠獲取40?范圍內(nèi)長程距離信息的核磁共振方法。與傳統(tǒng)PRE相比,sPRE是將順磁探針均勻地分布在溶液中,避免了探針標(biāo)記引起的結(jié)構(gòu)變化,尤其適用于難以實現(xiàn)標(biāo)記的RNA分子。因此,本論文擬采用sPRE方法來研究RNA的... 

【文章來源】:華中科技大學(xué)湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:65 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

溶液順磁弛豫增強研究RNA的結(jié)構(gòu)及其動態(tài)變化


堿基化學(xué)結(jié)構(gòu)

示意圖,扭轉(zhuǎn)角,主鏈,示意圖


6圖 1.2 RNA 主鏈扭轉(zhuǎn)角示意圖 高級結(jié)構(gòu)說,RNA 多為單鏈結(jié)構(gòu),但在某些區(qū)域也會形成特殊的高級結(jié)級結(jié)構(gòu)主要是由部分單鏈回折形成的局部雙螺旋,包括:發(fā)夾結(jié)多分支環(huán)結(jié)構(gòu)等[6]。RNA 的四種堿基之間也符合互補配對原則三個氫鍵,A 與 U 之間形成兩個氫鍵,因此 G-C 含量高的 RN除了經(jīng)典的 Watson-Crick 配對外,RNA 中還包含許多其他類:hoogsten 配對[7]。

示意圖,二級結(jié)構(gòu),示意圖,晶體衍射


圖 1.3 RNA 二級結(jié)構(gòu)示意圖三級結(jié)構(gòu)是在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進一步扭曲折疊而成[8],包構(gòu)。圖 1.4 RNA 三級結(jié)構(gòu)示意圖(a)假結(jié)結(jié)構(gòu) (b)三鏈結(jié)構(gòu)構(gòu)研究的常用方法晶體衍射晶體衍射(X-ray diffraction crystallography, XRD)是基于衍射的波長與晶格層面間距相近的特性,采用 X 射線照射晶體時,

【參考文獻】:
期刊論文
[1]拉莫爾進動對磁性的影響[J]. 張小龍.  科教文匯(下旬刊). 2011(10)
[2]順磁弛豫增強技術(shù)與蛋白質(zhì)瞬態(tài)結(jié)構(gòu)[J]. 劉主,唐淳.  波譜學(xué)雜志. 2011(03)



本文編號:2927431

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