2019年底暴發(fā)的新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)疫情對全球人類健康構(gòu)成了嚴(yán)重威脅。為研究其病原(SARS-Co V-2)與禽冠狀病毒之間的關(guān)系,將兩者進(jìn)行了基因序列比對、遺傳進(jìn)化分析、蛋白結(jié)構(gòu)比較及交叉血清學(xué)檢測。結(jié)果顯示:SARS-Co V-2與禽冠狀病毒的基因組序列相似性僅為44.7%～50.7%,遺傳進(jìn)化距離較遠(yuǎn);兩者S蛋白空間結(jié)構(gòu)相似度低;SARS-Co V-2 S蛋白與禽冠狀病毒陽性血清無交叉反應(yīng)。表明這兩種病毒在基因和蛋白水平均存在較大差異。研究提示:這兩種冠狀病毒可能很難突破人類與禽類的種間屏障實(shí)現(xiàn)跨種傳播,SARS-CoV-2通過感染家禽并進(jìn)一步威脅公共衛(wèi)生安全的風(fēng)險(xiǎn)甚小。
【部分圖文】：

將SARS-CoV-2 S蛋白（PDB:6VSB）與SARS-CoV S蛋白（PDB:5XLR）和IBV S蛋白（PDB:6CV0）的結(jié)構(gòu)（單體）進(jìn)行疊加聯(lián)配比較（見圖2）。結(jié)果可見IBV S蛋白單體胞外區(qū)大體空間結(jié)構(gòu)與其他冠狀病毒相似：由受體結(jié)合的S1頭部區(qū)與膜融合的S2莖部區(qū)組成，但SARS-CoV-2和SARS-CoV的結(jié)構(gòu)疊加相似性（RMSD=1.546?）明顯高于SARS-CoV-2和IBV(RMSD=4.989?），上述結(jié)果從蛋白結(jié)構(gòu)層面說明IBV與SARS-CoV-2的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。2.3 血清學(xué)交叉檢測結(jié)果

將選擇的4株SARS-CoV-2與不同冠狀病毒進(jìn)行全基因組比對與遺傳進(jìn)化分析，結(jié)果顯示SARS-CoV-2與蝙蝠源冠狀病毒和SARS-CoV顯著聚類，與MERS-CoV相對較遠(yuǎn)，但同屬于β冠狀病毒屬。SARS-CoV-2與各種禽源冠狀病毒間的進(jìn)化關(guān)系最遠(yuǎn)（見圖1）。將SARS-CoV-2與雞、鵝、鴨、鴿、火雞等不同禽源冠狀病毒的全基因組序列進(jìn)行核苷酸相似性分析。結(jié)果顯示，4株SARS-CoV-2相似性高于99.9%，而與禽源冠狀病毒的相似性僅為44.7%～50.7%。進(jìn)一步對病毒S蛋白的氨基酸序列進(jìn)行比對，發(fā)現(xiàn)SARS-CoV-2與禽源冠狀病毒的相似性僅為20.4%～24.7%，兩種冠狀病毒全基因組核苷酸與S蛋白氨基酸序列的同源性均低，從基因?qū)用嫣崾具@兩類病毒相互間可能很難突破人類與禽類的種間屏障實(shí)現(xiàn)跨種傳播。
【相似文獻(xiàn)】

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本文編號：2887190