福爾馬林固定石蠟包埋(Formalin-fixed and paraffin-embedding,FFPE)是最常見(jiàn)的臨床組織保存技術(shù),FFPE組織具有標(biāo)準(zhǔn)化的制備流程、易于存儲(chǔ)、標(biāo)本量大、包含較完整的臨床回顧性信息等特點(diǎn),而成為疾病生物標(biāo)志物發(fā)掘的良好載體。近年來(lái),基于臨床FFPE組織的特點(diǎn),發(fā)展了系列蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,包括樣本制備、消解、分離到蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定等多個(gè)領(lǐng)域,總體呈現(xiàn)出微量、高靈敏度、高通量的技術(shù)特點(diǎn),并已成功用于腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)等臨床蛋白質(zhì)組研究。該綜述將對(duì)FFPE組織切片樣本的蛋白質(zhì)組學(xué)方法,以及其在腫瘤研究中的應(yīng)用進(jìn)行概述,從而為臨床精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)的研究提供借鑒思路。
【部分圖文】：

2 FFPE組織切片樣本制備過(guò)程中的化學(xué)修飾在組織固定過(guò)程中,甲醛可與多種蛋白質(zhì)氨基酸殘基發(fā)生反應(yīng)或交聯(lián)[1,4]。Metz等[4]基于質(zhì)譜技術(shù),發(fā)現(xiàn)了蛋白質(zhì)與甲醛的交聯(lián)規(guī)則:第一階段,蛋白質(zhì)分子上的伯胺基和甲醛的醛基之間形成胺基-羥甲基加合物(圖1,反應(yīng)[1]);然后分子內(nèi)消除1個(gè)水分子產(chǎn)生席夫堿(圖1,反應(yīng)[2])。第二階段,蛋白質(zhì)中氨基酸(如酪氨酸)上的親核基團(tuán)進(jìn)攻席夫堿的亞甲基碳產(chǎn)生交聯(lián)(圖1,反應(yīng)[3])。此外,在福爾馬林溶液中,甲醛可迅速水合形成亞甲基二醇,蛋白質(zhì)分子中的伯胺基團(tuán)可與醇羥基反應(yīng)形成縮醛,或者與芳環(huán)形成羥甲基,再進(jìn)一步參與交聯(lián)反應(yīng)[5]。
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