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白紋伊蚊Cytb基因特異性引物的設(shè)計及評價

發(fā)布時間:2020-11-09 14:34
   目的設(shè)計并評價白紋伊蚊細(xì)胞色素b(Cytb)基因特異性引物。方法根據(jù)白紋伊蚊Cytb基因保守區(qū)域序列,設(shè)計1對引物,優(yōu)化PCR擴(kuò)增的退火溫度。以白紋伊蚊及同屬、同科、同目昆蟲基因組DNA為樣本,評價引物的特異性;以白紋伊蚊基因組DNA為樣本,評價引物的靈敏性;擴(kuò)增4個口岸捕獲的8只白紋伊蚊,評價引物的重復(fù)性。結(jié)果設(shè)計的引物的最佳退火溫度為55℃。該引物可成功擴(kuò)增白紋伊蚊Cytb基因,不能擴(kuò)增其同屬、同種、同目昆蟲基因;可擴(kuò)增來自4個口岸的濃度1.9 ng/μl以上的白紋伊蚊基因組DNA。結(jié)論本研究設(shè)計的引物的特異性、靈敏性、重復(fù)性理想,適用于白紋伊蚊的鑒定。
【部分圖文】:

效果圖,退火溫度,效果,伊蚊


當(dāng)退火溫度在53~55℃時,白紋伊蚊擴(kuò)增條帶明亮,當(dāng)退火溫度升高至56℃時,擴(kuò)增條帶亮度明顯減弱。因此采用CytbAEDF/CytbAEDR引物進(jìn)行檢測,退火溫度選擇為55℃。2.3 引物的靈敏度

引物,靈敏度,基因組DNA,伊蚊


以白紋伊蚊基因組DNA原液和10-1~10-10稀釋液為模板進(jìn)行擴(kuò)增,基因組DNA原液和10-1稀釋液可見擴(kuò)增條帶,原液擴(kuò)增條帶清晰而10-1稀釋液較弱,10-2~10-10稀釋液未擴(kuò)增到特異性產(chǎn)物。測序結(jié)果顯示,原液、10-1稀釋液擴(kuò)增產(chǎn)物與目的基因片段相似度達(dá)100%。該引物可擴(kuò)增濃度1.9 ng/μl以上的模板量。2.4 引物的重復(fù)性

引物,重復(fù)性,伊蚊,瓊脂糖


提取8只白紋伊蚊的基因組DNA,使用引物CytbAEDF/CytbAEDR進(jìn)行擴(kuò)增和瓊脂糖凝膠電泳,8次獨立擴(kuò)增均可獲得清晰明亮的目的條帶,測序結(jié)果與目的基因片段相似度為100%。該引物穩(wěn)定性好,可用于日常檢測。3 討論
【相似文獻(xiàn)】

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