以信號肽酶Ⅰ作為豬肺炎支原體疫苗抗原的可行性研究
【學位單位】:吉林大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2019
【中圖分類】:R392
【部分圖文】:
吉林大學碩士學位論文第三章 實驗結(jié)果3.1 MhSPase I 基因序列的生物信息學分析在NCBI數(shù)據(jù)庫中,獲取了豬肺炎支原體(Mycoplasma hyopneumoniae, Mhp)J 株(ASM820v1, AE017243.1)信號肽酶 (IMhSPase I)的全長序列(NC_007295.1,WP_014579531.1)。MhSPase I 蛋白長度為 160aa,分子式為 C857H1338N212O224S3。分子量約為 18.56kd,理論等電點 pI 為 9.58。
吉林大學碩士學位論文為了解MhSPase I與EcSPase I酶功能區(qū)域結(jié)構(gòu)的暴露程度,通過Swiss Model網(wǎng)站對EcSPase I和 MhSPase I 蛋白的三級結(jié)構(gòu)進行預測,得到如圖3.1.4 的結(jié)果。在 EcSPase I 和 MhSPase I 序列中同源性較高的保守區(qū)域 Box B(紅色)和 Box D(藍色)的整體空間結(jié)構(gòu)和暴露程度相近。
F①:AAGAAACCGCAGCGTAACGACGTGGTGGTCTTCAAGTACAAGGACAAGATCCTGATTAA 59bpR①:GTTTTCAGTTACTTCCAGTTTGTCACCTGGGATACCAGCCAGACGCTTAATCAGGATCT 59bpF②:TTCCCGACCCTGAAGAACGGTCAACAGATCTTTATCAACAATGTTAAGAAACCGCAGCG 59bpR②:CAGATCCGTGAAGTTAGCCACCAGCTCGTCGTTAATCAGGATGCTGTTTTCAGTTACTT 59bpF③:CTGTTCATTTTCGTGTACCAACTGATTAACGTCGAAGGCAATAGCATGTTCCCGACCCT 59bpR③:AAGAATTTGCCCTCAGGAATAACGCCGTTGAATTTCCAGAAGCCCAGATCCGTGAAGTT 59bpF④:ATCGGCGTTATCTTCATCTTCACCTGCGTGCTGATCGTGTCTGCTCTGTTCATTTTCGT 59bpR④:AAGGTACGAGAGTCGTTAGAGAAGTTGATGTTGTCACCCAGCGCGAAGAATTTGCCCTC 59bpF⑤:TTCATCAAGAAGAACCGCCTGATCATCGGCGTTATC 36bpR⑤:AATGTCGTTCAGGTCGAAAAAGCCGAAGGTACGAGAGTC 39bpF⑥:CCATGGGCCTGAAGAGCAAGAACCTGAGCAACAAGTTCCTGAAGTTCATCAAGAAG 56bpR⑥:AAGCTTTCACTCGAGAGCCCAAACACCCTTAATGTCGTTCAGGT 44bp
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