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Nanodisc類膜體系中FGFR1c結(jié)構(gòu)及活性的研究

發(fā)布時間:2020-05-22 14:49
【摘要】:成纖維細胞生長因子受體(FGFR)是成纖維細胞生長因子(FGF)家族蛋白的受體蛋白。作為受體酪氨酸家族中的一員,FGFR在調(diào)控細胞的增殖、分化、遷移及細胞存活等過程中發(fā)揮著重要功能,FGFR信號通路的異常將導(dǎo)致多種疾病或者發(fā)育綜合征的出現(xiàn)。FGFR位于細胞膜表面,其胞外端通過輔因子(肝素或klothos)結(jié)合配體,形成同源二聚復(fù)合體,引起胞內(nèi)激酶區(qū)不同酪氨酸磷酸化位點發(fā)生反式磷酸化反應(yīng),進而活化下游的信號通路。FGFR胞內(nèi)激酶結(jié)構(gòu)域包含7個酪氨酸磷酸化位點,其中位于活化環(huán)上的Y653和Y654具有酪氨酸激酶活性;其他酪氨酸位點的磷酸化可以作為下游信號分子的結(jié)合位點,從而活化特定的信號通路。FGFR是單次跨膜的酪氨酸受體,然而體外研究中膜環(huán)境模擬的挑戰(zhàn)性,限制了針對全長膜蛋白結(jié)構(gòu)和功能的研究,導(dǎo)致絕大多數(shù)體外研究仍以局部結(jié)構(gòu)域作為研究對象。因此尋找合適的類膜環(huán)境,對深入探究全長FGFR的結(jié)構(gòu)和功能至關(guān)重要。在已知的多種類膜體系中,Nanodiscs是一種較為理想的體外類膜體系模型。Nanodiscs不僅含有雙層的磷脂結(jié)構(gòu),而且可以依據(jù)不同的研究目的,通過調(diào)控磷脂的比例及組成,精確地調(diào)控nanodiscs尺寸的大小;同時組裝后的復(fù)合物可以利用多種技術(shù)手段進行表征及分析。該技術(shù)已被嘗試應(yīng)用于多個膜蛋白的結(jié)構(gòu)及功能研究中。本論文選擇與腫瘤發(fā)生密切相關(guān)的一種成纖維細胞生長因子受體(FGFR)家族成員FGFR1 c,結(jié)合體外nanodiscs體系對其進行了一系列的探究。研究內(nèi)容主要包括兩部分:第一部分重點探究FGFR1c體外nanodiscs組裝的適宜條件,并對FGFR1c的結(jié)構(gòu)進行初步表征和功能驗證;第二部分利用peptide nanodiscs體系研究局部膜環(huán)境對FGFR1c胞內(nèi)激酶結(jié)構(gòu)域活性的調(diào)控作用。取得的主要研究結(jié)果如下:1.構(gòu)建了 FGFR1c的昆蟲細胞表達體系,表達并純化了全長FGFR1c蛋白,利用MSPΔH5 nanodiscs體系實現(xiàn)了針對全長FGFR1c及其配體復(fù)合物(bFGF/heparin/FGFR)的組裝,并對FGFR1c進行生物冷凍電鏡的初步結(jié)構(gòu)表征和功能驗證。2.利用peptide nanodiscs體系,通過調(diào)控磷脂與小肽的比例,實現(xiàn)了對nanodiscs尺寸的精確調(diào)控,并通過引入一定比例的DGS-NTA(Ni)磷脂將FGFR胞內(nèi)激酶結(jié)構(gòu)域(FGFR1K)錨定在類膜體系的表面,在類膜體系環(huán)境下對FGFR1K的活性進行了系統(tǒng)研究。
【圖文】:

家族,進化樹


第一章FGFR結(jié)構(gòu)域功能研宄進展及類膜體系在膜蛋白研宄中的應(yīng)用白進行分類,分為很多蛋白亞家族。目前,較為一致的觀點是將FGF:5個旁分泌的亞家族,一個內(nèi)分泌的亞家族(FGF15/19亞家族)在于細胞內(nèi)的FGF亞家族(FGF11亞家族)。經(jīng)典的旁分泌的家族主幾個家族:FGF1亞家族,FGF4亞家族,FGF7亞家族,FGF8亞家邋亞家族(圖邋1.1)邋[4,邋19-21]。逡逑Cofactor:邋Heparin/Heparan邋sulfate逡逑-一逡逑

結(jié)構(gòu)元件


邐邐逡逑因庫中得到的cDNA具有高度的同源性(90-100%是在激酶區(qū)),同時,FLG邋—逡逑部分的cDNA的克隆,與大鼠中Bek中克隆的cDNA序列有84%的基因同源性逡逑[67]。Bek就是現(xiàn)在的FGFR2,同源基因的克隆促進了邋FGFR3和FGFR4基因的逡逑發(fā)現(xiàn)[68-71]。逡逑1.2.1成纖維細胞生長因子受體的結(jié)構(gòu)元件逡逑N端含有一個疏水的信號肽,三個胞外的免疫球蛋白的結(jié)構(gòu),一個胞內(nèi)的激逡逑酶結(jié)構(gòu)域,,由跨膜的螺旋區(qū)和近膜區(qū)連接起來。FGFR蛋白的胞外端有三個免疫逡逑球蛋白狀結(jié)構(gòu)域(DI,邋DII和DII),N端起始是一段22氨基酸的信號肽,在逡逑DI和DII的連接處有一個酸盒(一段酸性的氨基酸序列),緊接著是DII和Dili逡逑結(jié)構(gòu)域(圖1.2)邋[72-74]。DII和Dili以及它們之間的連接區(qū)域決定了邋FGFR與逡逑配體結(jié)合的選擇性和特異性。DI和酸盒在胞外端作為自抑制的結(jié)構(gòu)存在,當(dāng)逡逑FGFR胞外端的DI和I-II之間的連接區(qū)域被選擇性剪切掉之后,FGFR與相應(yīng)的逡逑FGF的親和性得到了增強,這一現(xiàn)象印證了邋DI及其連接區(qū)域在配體結(jié)合過程中逡逑確實存在自抑制的作用[75]。逡逑
【學(xué)位授予單位】:中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:Q78;R341

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本文編號:2676161

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