甲氧西林耐藥性金黃色葡萄球菌ccrAB的表達調(diào)控機制
發(fā)布時間:2020-03-17 09:38
【摘要】:金黃色葡萄球菌(簡稱金葡菌)是一種重要的人類和動物病原體細菌,能夠引起多種類型的感染性疾病,在臨床上主要通過使用抗生素來進行治療。然而隨著耐藥性菌株,特別是甲氧西林耐藥性金黃色葡萄球菌(MRS A)的全球性傳播,抗生素治療遇到了前所未有的挑戰(zhàn)。由于獲得了能夠編碼PBP2a這種替代性青霉素結(jié)合蛋白的基因mecA, MRSA菌株對幾乎所有類型的p內(nèi)酰胺類抗生素產(chǎn)生了抗性;騧ecA位于一個可移動的遺傳元件SCCmec上,該元件上同時也攜帶有編碼一套整合酶的基因ccrAB或ccrC,它們編碼的Ccr整合酶參與了SCCmec的剪切和整合,而且ccrAB或ccrC的表達水平緊密關(guān)聯(lián)著SCCmec元件的穩(wěn)定性及其平行基因轉(zhuǎn)移。早期的研究發(fā)現(xiàn)ccrAB基因只在一小部分的細胞中有表達,而且其所占的比例或者ccrAB基因整體的表達水平可以明顯受到溫度和抗生素等外界因素的影響,說明在ccrAB基因的表達過程中存在著一套非常精細的調(diào)控過程,而關(guān)于這一調(diào)控機理的研究還是一片空白。本課題主要通過以下兩部分的研究對ccrAB表達的調(diào)控機制進行闡述,1.輔助性sigma因子在ccrAB轉(zhuǎn)錄以及SCCmec剪切過程中的調(diào)控輔助性sigma因子在金葡菌中介導(dǎo)了多種環(huán)境因子的感應(yīng)以及細菌細胞生理過程的調(diào)控,早期的研究也發(fā)現(xiàn)SigH參與了金葡菌中原噬菌體基因組剪切和整合的調(diào)控。這些研究結(jié)果提示我們輔助性sigma因子也有可能參與調(diào)控了SCCmec元件的剪切和整合。在該研究中,我們首先確定了ccrA和ccrB處于同一個操縱子中,而且它們的轉(zhuǎn)錄水平表現(xiàn)出了明顯的時相依賴性。我們分別在N315菌株中過表達了SigB, SigH, SigS三種輔助性sigma因子,結(jié)果顯示SigB的過表達明顯提高了ccrA基因的轉(zhuǎn)錄水平,進一步的研究也發(fā)現(xiàn)SigB的過表達能夠明顯提高SCCmec元件的剪切。通過引物延伸實驗和5'RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends)我們鑒定出了一個之前從未被報道的SigB識別序列,而且該序列存在于多種SCCmec Ⅱ型和Ⅳ型的菌株中。2.反向重復(fù)序列以及蛋白調(diào)控因子SarS在ccrAB轉(zhuǎn)錄以及SCCmec剪切過程中的調(diào)控在對N315菌株中ccrAB基因啟動子區(qū)域的序列分析過程中,我們發(fā)現(xiàn)了一段反向重復(fù)序列,進一步分析發(fā)現(xiàn)它廣泛存在于不同類型的攜帶ccrAB基因的SCCmec元件中,而且在堿基組成和相對于ccrA翻譯起始位點的位置上都非常保守。堿基替換相關(guān)的配對堿基可以明顯提高ccrAB基因啟動子的活性,而且無論是替換反向重復(fù)序列的上游配對部分還是下游配對部分對ccrAB基因啟動子活性的影響基本一致,說明該段序列是通過一種特殊的空間結(jié)構(gòu)來影響ccrAB的表達,此外,通過在N315基因組中直接替換該配對堿基或者通過在ccrAB過表達質(zhì)粒中替換該部分堿基可以明顯影響SCCmec元件的穩(wěn)定性。以上結(jié)果說明反向重復(fù)序列在ccrAB基因的表達以及SCCmec元件的穩(wěn)定性方面起到了無可忽視的作用。通過DN A pull-down的方法我們發(fā)現(xiàn)了一個可以特異性結(jié)合ccrAB啟動子的調(diào)控蛋白SarS, EMSA的結(jié)果顯示它可以特異性的同上述反向復(fù)復(fù)序列結(jié)合。實時定量PCR以及啟動子同lacZ基因融合報告的結(jié)果顯示SarS在細菌生長的穩(wěn)定期對ccrAB基因的表達進行了調(diào)控,而且過表達SarS可以明顯提高ccrAB基因的轉(zhuǎn)錄和增強SCCmec元件的剪切。
【圖文】:
在A類wee基因簇中,相關(guān)的基因包括由/nec4基因組成的某一方向的操逡逑縱子^^及與其方向相反的meci?/-/nec/-meci?2調(diào)控基因組成的操縱子,其中,,;nec/4逡逑基因的轉(zhuǎn)錄受/nec/f/-ffiec/-mec/口邋H元信號系統(tǒng)的調(diào)控(圖1.6)(Aredeetal.邋2012)。逡逑簡單來說,P內(nèi)筋胺類抗生素通過巧活MecRl誘導(dǎo)mec/1和;necW-mec/-ff?ec化2逡逑基因的轉(zhuǎn)錄。在該過程中,MecR2蛋白解除MecI二聚體的穩(wěn)定性,干擾MecI逡逑二聚體對mec^啟動子序列的結(jié)合,同時促進它們的蛋白水解失活,最終導(dǎo)致逡逑基因轉(zhuǎn)錄的持續(xù)性誘導(dǎo)。當PQg憸胺類抗生素被耗盡時,MecRl蛋白不再逡逑被巧活,穩(wěn)定狀態(tài)的MecI二巧體蛋白結(jié)合到基因的啟動子上,多余的逡逑MecRl蛋白則錯定在細胞膜上,而Rp余的MecR2蛋白則最有可能通過胞內(nèi)蛋白逡逑降解途徑被降解。逡逑該巧控過程非常類似于WaZ基因同其調(diào)控基因6虹W-Wo/的表達調(diào)控過程。逡逑值得一提的是,在許多苗株中這兩查巧巧系統(tǒng)是同時存在的,此時,施iZ和逡逑同椅被這兩種不同的調(diào)控系統(tǒng)所巧控:Blal與MecI巧可IJJIW二巧體的形式結(jié)合逡逑10逡逑
盡管Q喦盎共磺宄嗆沃直局實耐槐淶賈鋁隋澹鄭桑櫻輛甑某魷鄭髦盅星苫瑰義鮮欠⑾至隋澹鄭桑櫻羻-株所具有的一些共同特征,這巧特征包括變厚的細胞壁和較低逡逑交聯(lián)度的膚聚糖鏈。如圖1.8所示,在VISA菌株的細胞壁上存在著大量的自由逡逑12逡逑
【學位授予單位】:中國科學技術(shù)大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:R378.11
本文編號:2587496
【圖文】:
在A類wee基因簇中,相關(guān)的基因包括由/nec4基因組成的某一方向的操逡逑縱子^^及與其方向相反的meci?/-/nec/-meci?2調(diào)控基因組成的操縱子,其中,,;nec/4逡逑基因的轉(zhuǎn)錄受/nec/f/-ffiec/-mec/口邋H元信號系統(tǒng)的調(diào)控(圖1.6)(Aredeetal.邋2012)。逡逑簡單來說,P內(nèi)筋胺類抗生素通過巧活MecRl誘導(dǎo)mec/1和;necW-mec/-ff?ec化2逡逑基因的轉(zhuǎn)錄。在該過程中,MecR2蛋白解除MecI二聚體的穩(wěn)定性,干擾MecI逡逑二聚體對mec^啟動子序列的結(jié)合,同時促進它們的蛋白水解失活,最終導(dǎo)致逡逑基因轉(zhuǎn)錄的持續(xù)性誘導(dǎo)。當PQg憸胺類抗生素被耗盡時,MecRl蛋白不再逡逑被巧活,穩(wěn)定狀態(tài)的MecI二巧體蛋白結(jié)合到基因的啟動子上,多余的逡逑MecRl蛋白則錯定在細胞膜上,而Rp余的MecR2蛋白則最有可能通過胞內(nèi)蛋白逡逑降解途徑被降解。逡逑該巧控過程非常類似于WaZ基因同其調(diào)控基因6虹W-Wo/的表達調(diào)控過程。逡逑值得一提的是,在許多苗株中這兩查巧巧系統(tǒng)是同時存在的,此時,施iZ和逡逑同椅被這兩種不同的調(diào)控系統(tǒng)所巧控:Blal與MecI巧可IJJIW二巧體的形式結(jié)合逡逑10逡逑
盡管Q喦盎共磺宄嗆沃直局實耐槐淶賈鋁隋澹鄭桑櫻輛甑某魷鄭髦盅星苫瑰義鮮欠⑾至隋澹鄭桑櫻羻-株所具有的一些共同特征,這巧特征包括變厚的細胞壁和較低逡逑交聯(lián)度的膚聚糖鏈。如圖1.8所示,在VISA菌株的細胞壁上存在著大量的自由逡逑12逡逑
【學位授予單位】:中國科學技術(shù)大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:R378.11
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本文編號:2587496
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