【摘要】：目的建立一種可同時檢測鼻病毒、呼吸道合胞病毒以及腺病毒的基因芯片方法。方法根據(jù)GenBank已發(fā)表的鼻病毒、呼吸道合胞病毒和腺病毒的基因序列,應用生物學軟件設計相應的引物和寡核苷酸探針,構建檢測芯片;使用巢式PCR擴增標記目的片段,將其與檢測基因芯片進行雜交和掃描分析;通過特異性、靈敏性和重復性試驗評估基因芯片方法。結果設計的全部探針均能與相應的標記樣品特異性雜交,其中探針1a和1b可特異檢測鼻病毒;探針2a、2b和2c可特異檢測呼吸道合胞病毒,探針3a和3b可特異檢測腺病毒。基因芯片法檢測3種病毒的最低拷貝數(shù)分別是2.59×102個/μl、2.21×101個/μl和2.05×102個/μl。結論構建的基因芯片可特異性檢測樣品中低滴度的鼻病毒、呼吸道合胞病毒以及腺病毒,有望為臨床提供確診依據(jù)。
[Abstract]:Objective to establish a gene chip method for simultaneous detection of rhinovirus, respiratory syncytial virus and adenoviruses. Methods according to the gene sequences of rhinovirus, respiratory syncytial virus and adenoviruses published by GenBank, the corresponding primers and oligodeoxynucleotides probes were designed by biological software, and the detection chip was constructed. The target fragment was amplified by nest PCR, crossed with the detection gene chip and analyzed by scanning, and the gene chip method was evaluated by specificity, sensitivity and reproducibility test. Results all the designed probes could specifically cross with the corresponding labeled samples, in which probes 1a and 1b could specifically detect rhinovirus, probe 2a, 2b and 2c could specifically detect respiratory syncytial virus, and probes 3a and 3b could specifically detect adenoviruses. The minimum copy number of the three viruses detected by gene chip method was 2.59 脳 102 / 渭 l, 2.21 脳 101 / 渭 l and 2.05 脳 102 / 渭 l, respectively. Conclusion the constructed gene chip can specifically detect low titer rhinovirus, respiratory syncytial virus and adenovirus in the sample, which is expected to provide diagnostic basis for clinical diagnosis.
【作者單位】： 吉林大學畜牧獸醫(yī)學院;軍事醫(yī)學科學院軍事獸醫(yī)研究所;吉林農(nóng)業(yè)大學動物科技學院;長春中醫(yī)藥大學;
【基金】：吉林省科技支撐計劃項目(No.20100416)
【分類號】：R373

【參考文獻】

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【共引文獻】

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本文編號：2494049