Dysbindin-1在小鼠睪丸組織中相互作用蛋白的篩選及鑒定
發(fā)布時(shí)間:2021-03-18 14:05
目的:通過(guò)篩選并鑒定(肌)營(yíng)養(yǎng)不良短小蛋白結(jié)合蛋白1(dystrobrevin binding protein1,dysbindin-1)在睪丸組織中的相互作用蛋白,研究dysbindin-1在睪丸中的可能功能。方法:在Rosetta(DE3)菌種中誘導(dǎo)表達(dá)可溶性GST-dysbindin-1融合蛋白,經(jīng)谷胱甘肽-瓊脂糖珠親和純化后,與小鼠的睪丸組織蛋白孵育進(jìn)行GST pull-down實(shí)驗(yàn),通過(guò)液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(LC MS/MS)分析篩選dysbindin-1在睪丸組織中的相互作用蛋白。利用BioGPS數(shù)據(jù)庫(kù)聚類睪丸組織中高表達(dá)和特異性表達(dá)的互作蛋白,運(yùn)用DAVID6.8在線分析工具從細(xì)胞組分、分子功能、生物學(xué)過(guò)程和京都基因與基因組百科全書(shū)通路等方面對(duì)篩選出的互作蛋白進(jìn)行GO(gene ontology)富集分析。選擇我們感興趣的潛在互作蛋白囊泡分選蛋白4A(vacuolar protein sorting 4A,vps4a),通過(guò)分子克隆技術(shù)構(gòu)建原核和真核表達(dá)載體,運(yùn)用GST pull-down、免疫共沉淀等實(shí)驗(yàn),驗(yàn)證dysbindin-1與vps4a的互作關(guān)系。結(jié)果:1.本實(shí)驗(yàn)共篩選出108個(gè)dysbindin-1在睪丸組織中的潛在互作蛋白,其中98個(gè)為尚未報(bào)道的dysbindin-1互作蛋白,7個(gè)為睪丸高表達(dá)蛋白,5個(gè)為睪丸特異性表達(dá)蛋白。2.DAVID 6.8在線分析工具GO富集分析發(fā)現(xiàn):這些候選蛋白主要分布在細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞核、細(xì)胞膜、細(xì)胞外泌體等細(xì)胞組分中,通過(guò)與蛋白質(zhì)、核酸等分子結(jié)合參與蛋白翻譯和轉(zhuǎn)運(yùn)、囊泡運(yùn)輸及凋亡等生物學(xué)過(guò)程以及氨基酸生物合成、溶酶體及蛋白酶體等生物學(xué)通路。3.通過(guò)GST pull-down和免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)證實(shí)dysbindin-1和vps4a存在相互作用。結(jié)論:Dysbindin-1在小鼠睪丸組織中與多種蛋白相互作用,可能參與精子發(fā)生和受精等生物學(xué)過(guò)程。
【學(xué)位授予單位】:山西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R363
本文編號(hào):2415509
【學(xué)位授予單位】:山西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R363
文章目錄
中文摘要
英文摘要
常用縮寫(xiě)詞中英文對(duì)照表
前言
第一部分 GST pull-down聯(lián)合質(zhì)譜篩選dysbindin-1 互作蛋白
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
2 結(jié)果
2.1 GST及GST-dysbindin-1 原核誘導(dǎo)表達(dá)及純化
2.2 體外GST pull-down結(jié)合實(shí)驗(yàn)篩選dysbindin-1 相互作用蛋白
第二部分 Dysbindin-1 潛在互作蛋白的功能分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料和方法
2 結(jié)果
2.1 新發(fā)現(xiàn)的dysbindin-1 相互作用蛋白
2.2 Dysbindin-1 潛在互作蛋白GO功能注釋富集分析
第三部分 體外實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證dysbindin-1 與vps4a的相互作用
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
2 結(jié)果
2.1 PCR擴(kuò)增vps4a基因
2.2 構(gòu)建及鑒定重組質(zhì)粒pCMV-Tag 2B/vps4a
2.3 亞克隆重組質(zhì)粒pGEX-4T-1/vps4a的構(gòu)建及鑒定
2.4 體外GST pull-down實(shí)驗(yàn)
2.5 免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)
討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):2415509
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