【摘要】：目的比較4種血清型登革病毒NS1蛋白型特異性抗原表位基因序列及氨基酸序列之間的差異,為利用基因差異進(jìn)行血清學(xué)分型及疫苗研究提供新的線索。方法利用DNAstar數(shù)據(jù)包中的Editseq程序,從20株登革病毒分離株的全基因組序列中將NS1基因型特異性抗原表位序列截取出來,再用ClustalX軟件進(jìn)行多序列比對,進(jìn)行同源性分析,找出型內(nèi)最為保守的抗原表位序列。并將比對結(jié)果在120株登革病毒序列中進(jìn)一步驗(yàn)證。結(jié)果 NS1蛋白36～45和71～85位氨基酸為型特異性抗原表位,高度保守,型內(nèi)完全相同,型間不同。結(jié)論 NS1蛋白36～45位氨基酸可以作為登革病毒血清分型和研制亞單位疫苗的靶標(biāo)。
[Abstract]:Objective to compare the sequences of epitopes and amino acids of NS1 protein epitopes of four serotypes of dengue virus in order to provide a new clue for serological typing and vaccine research. Methods using the Editseq program in the DNAstar packet, the NS1 genotypic epitope sequences were intercepted from the genome sequences of 20 dengue virus isolates, and then the multiple sequence alignment was performed with ClustalX software for homology analysis. Identify the most conserved epitopes in the type. The results were further verified in 120 strains of dengue virus. Results the amino acids at the NS1 protein 365and 71C 85 were type-specific epitopes, highly conserved, identical in type and different in type. Conclusion Amino acid of NS1 at 36C / 45 can be used as a target for dengue virus serotyping and subunit vaccine development.
【作者單位】： 南方醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生與熱帶醫(yī)學(xué)學(xué)院中心實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(U1132002) 廣州市科技計劃項(xiàng)目(2008Z1E4011) 新發(fā)傳染病防治廣東普通高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室基金(KLB09007)
【分類號】：R373.33

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