發(fā)布時(shí)間：2018-05-13 00:09

  本文選題：甲型HN流感病毒 + 血凝素��； 參考：《臨床檢驗(yàn)雜志》2013年04期

【摘要】：目的研究杭州地區(qū)2009年至2012年甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)與神經(jīng)氨酸酶(NA)的基因進(jìn)化特征,分析該病毒的遺傳變異和抗原的分子水平轉(zhuǎn)變。方法用RT-PCR分別擴(kuò)增甲型H1N1流感病毒HA基因和NA基因片段并進(jìn)行測(cè)序,用DNAMAN和MEGA 4.0生物信息學(xué)軟件對(duì)HA和NA基因序列進(jìn)行進(jìn)化分析。結(jié)果建立的RT-PCR可成功檢測(cè)HA(C)、HA(D)和NA基因,遺傳進(jìn)化分析結(jié)果表明,杭州地區(qū)甲型H1N1流感病毒的HA與NA氨基酸序列的親緣系數(shù)與WHO推薦的病毒株及國(guó)內(nèi)代表株的同源性均為98.9%～100%;三維構(gòu)象結(jié)果表明,HA編碼的蛋白質(zhì)有5個(gè)位點(diǎn)發(fā)生改變,而NA編碼的蛋白質(zhì)僅發(fā)生2個(gè)位點(diǎn)改變。結(jié)論 2009年至2011年杭州地區(qū)甲型H1N1流感病毒HA和NA基因序列與世界范圍內(nèi)流行的病毒參考株具有高度同源性,但HA與NA蛋白質(zhì)表位存在某些氨基酸位點(diǎn)的改變。
[Abstract]:Objective to study the genetic evolution of hemagglutinin (HA) and neuraminidase (neuraminidase) of influenza A (H1N1) virus from 2009 to 2012 in Hangzhou, and to analyze the genetic variation and molecular level transformation of the virus. Methods the HA gene and na gene fragment of H1N1 influenza A virus were amplified by RT-PCR and sequenced. The sequences of HA and na genes were analyzed by DNAMAN and MEGA 4.0 bioinformatics software. Results the established RT-PCR could be successfully used to detect HAD and na genes, and the results of genetic evolution analysis showed that, The homology of HA and na amino acid sequence of influenza A (H1N1) virus in Hangzhou area was 98.9100.The result of 3D conformation showed that the protein encoded by HA changed at 5 sites. However, na encoded protein changed only 2 sites. Conclusion the sequences of HA and na genes of influenza A (H1N1) virus in Hangzhou from 2009 to 2011 are highly homologous to those of the worldwide viral reference strains, but there are some amino acid epitopes in HA and na protein epitopes.
【作者單位】： 浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬義烏醫(yī)院檢驗(yàn)科;浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第一醫(yī)院檢驗(yàn)科;
【基金】：“十二五”國(guó)家科技重大專項(xiàng)(No:2012ZX10004-210) 浙江省教育廳(N20110467)
【分類號(hào)】：R373.14

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本文編號(hào)：1880766