中國(guó)首次分離的二株基因Ⅰ型流行性乙型腦炎病毒全基因組序列分析(英文)
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【摘要】:目的分析中國(guó)首次分離的基因Ⅰ型流行性乙型腦炎病毒(JEV)全基因組的基因組特征。方法設(shè)計(jì)JEV全基因組擴(kuò)增引物,RT-PCR擴(kuò)增片斷,PCR產(chǎn)物直接測(cè)序,拼接后獲得全基因組序列。采用生物學(xué)軟件進(jìn)行同源性和系統(tǒng)進(jìn)化分析。結(jié)果 1977和1982年分離自云南蚊蟲(chóng)的M28和BN82215病毒株基因組全長(zhǎng)分別為10 969bp和10 970bp,5′非編碼區(qū)均含有96個(gè)核苷酸,3′非編碼區(qū)含有573和574個(gè)核苷酸。它們的開(kāi)放閱讀框(ORF)都從97到10 396位,共10 299個(gè)核苷酸,編碼3 433個(gè)氨基酸。M28和BN82215株與來(lái)自GenBank的5個(gè)基因型JEV株的全基因組核苷酸和氨基酸同源性分別為78.4%~96.3%和91.4%~99.6%,與近幾年國(guó)內(nèi)外基因Ⅰ型流行株的同源性最高,進(jìn)化關(guān)系最接近,都屬于基因Ⅰ型。這兩株病毒與JEV疫苗株SA14-14-2相比,有56個(gè)氨基酸差異,其中E基因有11個(gè)氨基酸差異,但都不屬抗原關(guān)鍵位點(diǎn)。結(jié)論本研究闡明了中國(guó)首次分離的基因Ⅰ型JEV的全基因組分子特征,決定病毒抗原和毒力的E蛋白關(guān)鍵位點(diǎn)無(wú)明顯變化。證實(shí)20世紀(jì)70和80年代云南省就有基因Ⅰ型JEV流行。
【作者單位】: 云南省地方病防治所/云南省病毒立克次體研究中心;大理學(xué)院公共衛(wèi)生學(xué)院;
【基金】:Supported by the National Natural Science Foundation of China(No.30560142) the China-U.S.Collaborative Program on Emerging&Re-Emerging Infectious Diseases(No.U19-GH000004)~~
【分類號(hào)】:R373
【正文快照】: Japanese encephalitis(JE)is an acute central nerv-ous system infection caused by Japanese encephali-tis virus(JEV),which was first isolated from Ja-pan in 1935as a causative agent for JE[1].Humanis infected mainly through bites by mosquitoes,es-pecially
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中國(guó)重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 記者 柳s,
本文編號(hào):1250723
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