本文關(guān)鍵詞：生物信息學輔助克隆和分析人GLUT-9基因啟動子

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【摘要】：目的:對人GLUT-9基因5′-非翻譯區(qū)進行克隆,并對其啟動子和轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)進行生物信息學分析,為后續(xù)的GLUT-9基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究奠定基礎(chǔ)。方法:通過搜索網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫,得到GLUT-9基因翻譯起始點上游約2 kb的序列。以人總DNA為模板,采用PCR方法進行序列克隆。運用BDGP:Neural Network Promoter Prediction軟件對上述序列進行分析,預(yù)測出該段序列可能的啟動子區(qū)域;運用TFSEARCH軟件分析潛在的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點。結(jié)果:人GLUT-9基因的啟動子可能位于轉(zhuǎn)錄起始點上游反義鏈的-550到-503區(qū),序列上存在包括CdxA、SRY和Lyf-1等12個轉(zhuǎn)錄因子的潛在結(jié)合位點。結(jié)論:克隆得到人GLUT-9基因5′-非翻譯區(qū)2 kb的序列,對人GLUT-9基因啟動子和5′-非翻譯區(qū)調(diào)控區(qū)序列進行了初步的生物信息學分析,為后續(xù)試驗提供了研究基礎(chǔ)。
【作者單位】： 南方醫(yī)科大學南方醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科;
【基金】：廣東省科技計劃項目(編號:2011B061300004) 廣東省自然科學基金(編號:S2011010002975)
【分類號】：R346
【正文快照】： 葡萄糖轉(zhuǎn)運蛋白-9(facilitated glucose trans-porter 9,GLUT-9)基因位于4p15.3-p16,全長214 025 bp,含1個非編碼區(qū)外顯子和13個編碼區(qū)外顯子,編碼葡萄糖轉(zhuǎn)運體9(glucose transporter9,GLUT9)[1]。對多個國家的白種人群運用基因芯片進行全基因組掃描分析發(fā)現(xiàn)GLUT-9基因的遺傳

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1 何文s，

本文編號：1248940