本文關(guān)鍵詞：hsa-miR-1908靶基因預(yù)測(cè)及生物信息學(xué)分析

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【摘要】：目的對(duì)hsa-miR-1908進(jìn)行系統(tǒng)的生物信息學(xué)分析,預(yù)測(cè)其可能參與的生物學(xué)過(guò)程及信號(hào)通路,為深入研究其在人脂肪細(xì)胞分化、肥胖發(fā)生等過(guò)程中的功能與機(jī)制奠定基礎(chǔ)。方法應(yīng)用miRBase獲取hsa-miR-1908的序列,并分析其特征;應(yīng)用miRanda預(yù)測(cè)hsa-miR-1908的靶基因,并取預(yù)測(cè)結(jié)果及基因芯片結(jié)果的交集,進(jìn)一步進(jìn)行基因功能注釋(Gene ontology)和生物通路富集分析(Pathway enrichment)。結(jié)果 hsa-miR-1908在各物種之間有一定保守性,其靶基因功能富集于Wnt受體信號(hào)的調(diào)控、細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡等生物學(xué)過(guò)程;其靶基因信號(hào)通路富集于促性腺激素釋放激素信號(hào)通路、MAPK信號(hào)通路、胰島素信號(hào)通路、細(xì)胞周期等信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路及胰腺癌等疾病通路中。結(jié)論 hsa-miR-1908預(yù)測(cè)的靶基因集合富集于多個(gè)信號(hào)通路及生物學(xué)過(guò)程,與肥胖密切相關(guān),為后續(xù)has-miR-1908在人脂肪細(xì)胞中生物學(xué)功能研究奠定基礎(chǔ)。
【作者單位】： 南京醫(yī)科大學(xué)兒科研究所;南京醫(yī)科大學(xué)附屬南京婦幼保健院兒童保健科;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.81100618) 南京市科技計(jì)劃項(xiàng)目(No.201104013)
【分類(lèi)號(hào)】：R341
【正文快照】： microRNA(smiRNAs)是生物體內(nèi)一類(lèi)長(zhǎng)度約22個(gè)核苷酸的內(nèi)源性非編碼單鏈小RNA,通過(guò)與其靶標(biāo)mRNA3’UTR不完全互補(bǔ)配對(duì)、降解靶mRNA或抑制靶mRNA翻譯(轉(zhuǎn)錄后調(diào)控作用)的機(jī)制來(lái)發(fā)揮其作用,調(diào)節(jié)幾乎所有的生命活動(dòng)(包括脂肪組織分化及發(fā)育)和大多數(shù)疾病的發(fā)病過(guò)程[1-5]。miR-1908

【共引文獻(xiàn)】

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中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

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10 楊q

本文編號(hào)：1233102