本文關(guān)鍵詞：巴曲酶的線性和構(gòu)象型B細(xì)胞抗原表位的預(yù)測

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【摘要】：目的:預(yù)測巴曲酶的B細(xì)胞線性表位和構(gòu)象型表位,本項(xiàng)目的預(yù)期成果可為該藥物的安全化應(yīng)用提供新思路。方法:基于巴曲酶的蛋白質(zhì)序列,采用DNAStar軟件和ABCpred、BCPREDS、BcePred和BepiPred 1.0服務(wù)器預(yù)測巴曲酶的線性表位。以蝮蛇毒蛋白C激活劑蛋白的晶體結(jié)構(gòu)為模板,利用MODELLER9.10軟件中的Pythonwin程序進(jìn)行該酶的同源模建,并利用PROCHECK、ERRAT及PROSA程序進(jìn)行合理化評價。根據(jù)巴曲酶的模建三維結(jié)構(gòu)并結(jié)合DiscoTope和cons PPISP網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫預(yù)測構(gòu)象型抗原表位。結(jié)果:得到肽端AA3~9、19~31、57~82、93~101、106~114、127~142、171~183、196~208、223~230區(qū)域?yàn)榘颓傅腂細(xì)胞線性表位優(yōu)勢區(qū)域。然后得到蛋白的N端41~48、57~71、76~82、93~100、109~115、127~133、146~152、194~203區(qū)段為B細(xì)胞構(gòu)象型表位區(qū)域。結(jié)論:這些B細(xì)胞抗原表位可為降低巴曲酶的免疫原性提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。
【作者單位】： 大連理工大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(81102378) 中央高�；究蒲袠I(yè)務(wù)費(fèi)專項(xiàng)資金資助(DUT11SM02)
【分類號】：R392
【正文快照】： 1963年Klobusitzi和Konig從美洲矛頭蝮蛇(Bothrops atrox moojenii)毒液中分離得到一種絲氨酸蛋白水解酶,即巴曲酶(Batroxobin,EC 3.4.21.29)。該酶的基因已經(jīng)被克隆,并在畢赤酵母系統(tǒng)里進(jìn)行了重組表達(dá),其部分生化性質(zhì)也得到研究[1,2]。它能特異性裂解纖維蛋白原α鏈中Arg16-G

【參考文獻(xiàn)】

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中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 周濤;賈懷杰;何小兵;管齊賽;景志忠;;CD4~+T細(xì)胞表位分析鑒定技術(shù)研究進(jìn)展[J];免疫學(xué)雜志;2013年06期

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6 錢春艷;宋麗君;余傳信;殷旭仁;王s，

本文編號：1154453