本文關(guān)鍵詞：超聲輔助酶切法用于溶液內(nèi)蛋白質(zhì)樣品酶切特點(diǎn)分析

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【摘要】：目的分析超聲輔助酶切法對(duì)溶液內(nèi)蛋白質(zhì)樣品酶切的特點(diǎn)。方法分別應(yīng)用超聲輔助酶切法與傳統(tǒng)酶切法對(duì)牛血清白蛋白進(jìn)行溶液內(nèi)酶切,通過飛行時(shí)間質(zhì)譜進(jìn)行分析,對(duì)數(shù)據(jù)庫檢索后得到的多肽進(jìn)行比較分析。結(jié)果超聲輔助酶切法的酶切時(shí)間可縮短到10 min,酶切后多肽的回收率比傳統(tǒng)酶切法低8%,但飛行時(shí)間質(zhì)譜鑒定評(píng)分(MASCOT評(píng)分)比傳統(tǒng)方法高約1倍,肽段的覆蓋率高10%,匹配的多肽數(shù)多40%以上。對(duì)超聲輔助酶切法鑒定出的多肽進(jìn)一步分析表明,這些多肽的誤切率較傳統(tǒng)方法高22%,比傳統(tǒng)方法多鑒定出的多肽分子質(zhì)量主要在2～3 ku之間,且大部分為含有誤切位點(diǎn)的多肽。結(jié)論超聲輔助酶切可明顯縮短蛋白質(zhì)酶切時(shí)間,得到更好的多肽鑒定,但部分多肽酶切不完全,樣品損失會(huì)更多。
【作者單位】： 中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)學(xué)院中心實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(30970650)
【分類號(hào)】：R341
【正文快照】： 目前應(yīng)用質(zhì)譜進(jìn)行蛋白質(zhì)組研究需要將蛋白質(zhì)酶切成多肽片段,再進(jìn)行質(zhì)譜分析,通過數(shù)據(jù)庫檢索實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)組的大規(guī)模鑒定[1]。但是在這個(gè)過程中,傳統(tǒng)酶切法耗時(shí)長,往往需要16 h以上,極大的限制了蛋白質(zhì)組分析的通量。超聲輔助酶切法利用超聲波輔助進(jìn)行酶切,可以在幾分鐘內(nèi)實(shí)現(xiàn)蛋

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中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 胡志遠(yuǎn),萬晶宏,王利紅,錢小紅,賀福初;蛋白質(zhì)組研究中雙向聚丙烯酰胺凝膠電泳圖譜的計(jì)算機(jī)分析[J];軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院院刊;1998年04期

2 程志祥,熊俊,倪雪峰,顧冬民,德偉;大鼠胰腺蛋白質(zhì)組研究中雙向電泳技術(shù)的初步建立[J];南京醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2003年02期

3 劉建軍,莊志雄,鄧平建,房師松,趙錦;質(zhì)譜技術(shù)在蛋白質(zhì)組研究中的應(yīng)用[J];衛(wèi)生研究;2003年03期

4 ;名詞解釋[J];預(yù)防醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)信息;2003年03期

5 祁維平,劉師蓮;蛋白質(zhì)組學(xué)及其在疾病研究中的應(yīng)用[J];山東生物醫(yī)學(xué)工程;2002年02期

6 王文靜,陸曄,張?jiān)朴?朱佩云;蛋白質(zhì)組學(xué)及其在公共衛(wèi)生學(xué)領(lǐng)域中的應(yīng)用[J];環(huán)境與職業(yè)醫(yī)學(xué);2003年05期

7 司英健;蛋白質(zhì)組學(xué)研究的內(nèi)容、方法及意義[J];國外醫(yī)學(xué).臨床生物化學(xué)與檢驗(yàn)學(xué)分冊(cè);2003年03期

8 張軍,王友群;蛋白質(zhì)組學(xué)及其在生殖醫(yī)藥學(xué)中的應(yīng)用[J];中國病理生理雜志;2004年03期

9 邵志廣;21世紀(jì)生命科學(xué)的焦點(diǎn)——人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃簡介[J];中學(xué)生物教學(xué);2004年11期

10 吳春太,于姝睿;蛋白質(zhì)組學(xué)用于疾病特殊蛋白質(zhì)的鑒定[J];景德鎮(zhèn)高專學(xué)報(bào);2004年04期

中國重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 莊玉輝;何秀云;張小剛;李國利;丁勤學(xué);闕海萍;;結(jié)核分枝桿菌不同組份蛋白質(zhì)組雙向電泳研究[A];中國防癆協(xié)會(huì)全國學(xué)術(shù)會(huì)議大會(huì)學(xué)術(shù)報(bào)告[C];2001年

2 鐘伯雄;張金衛(wèi);;蛋白質(zhì)組研究[A];中國蠶學(xué)會(huì)第三屆青年學(xué)術(shù)研討會(huì)暨浙江省第二屆青年學(xué)術(shù)論壇——蠶桑分論壇論文集（上冊(cè)）[C];2001年

3 卓肇文;;干細(xì)胞蛋白質(zhì)組應(yīng)是蛋白質(zhì)組學(xué)研究的一個(gè)重點(diǎn)[A];中國蛋白質(zhì)組學(xué)第二屆學(xué)術(shù)大會(huì)論文摘要論文集[C];2004年

4 高峰;路浩;崔新征;郭亮;杜英;張清勇;;胸腺組織重癥肌無力相關(guān)蛋白的鑒定[A];中國免疫學(xué)會(huì)第五屆全國代表大會(huì)暨學(xué)術(shù)會(huì)議論文摘要[C];2006年

5 吳忠道;;蛋白質(zhì)組與寄生蟲學(xué)研究[A];中國動(dòng)物學(xué)會(huì)第七屆全國青年寄生蟲學(xué)工作者學(xué)術(shù)討論會(huì)論文摘要集[C];2002年

6 羅琪;蔣磊;陳廣文;肖獻(xiàn)忠;;大鼠缺血-再灌注損傷心肌中HSP70相互作用蛋白質(zhì)組的研究[A];第七屆海峽兩岸心血管科學(xué)研討會(huì)論文集[C];2009年

7 梁淑芳;于延豹;許雪嬌;宋培明;薛燕;楊們?cè)?陳先;;基于氨基酸同位素代謝標(biāo)記的免疫共沉淀分析蛋白質(zhì)相互作用[A];中國蛋白質(zhì)組學(xué)第三屆學(xué)術(shù)大會(huì)論文摘要[C];2005年

8 黃懿;梁淑芳;劉寶紅;于延豹;陸豪杰;陳先;楊們?cè)?;芯片酶解微反應(yīng)器用于甲肝病毒蛋白質(zhì)組的快速酶解鑒定[A];中國蛋白質(zhì)組學(xué)第三屆學(xué)術(shù)大會(huì)論文摘要[C];2005年

9 許雅君;張國慶;李勇;;宮內(nèi)乙醇暴露對(duì)胎鼠大腦線粒體蛋白質(zhì)組的影響[A];中國毒理學(xué)會(huì)第四屆全國學(xué)術(shù)會(huì)議論文（摘要）集[C];2005年

10 林夏鴻;林玲;;催乳素免疫調(diào)節(jié)效應(yīng)的研究及其信號(hào)傳導(dǎo)途徑的蛋白質(zhì)組分析[A];全國自身免疫性疾病專題研討會(huì)暨第十一次全國風(fēng)濕病學(xué)學(xué)術(shù)年會(huì)論文匯編[C];2006年

中國重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 本報(bào)記者 楊蕾;后基因組時(shí)代蛋白質(zhì)組閃亮登場(chǎng)[N];中國質(zhì)量報(bào);2010年

2 王雪飛;蛋白質(zhì)組潛在新藥的“富礦”[N];健康報(bào);2004年

3 吳華國;“蛋白質(zhì)組計(jì)劃”,有望破解肝病病因[N];新華每日電訊;2007年

4 本報(bào)記者 張荔子;蛋白質(zhì)組學(xué)：人類下一個(gè)目標(biāo)[N];健康報(bào);2001年

5 馮衛(wèi)東;美科學(xué)家首次完成細(xì)胞主要成分構(gòu)圖[N];科技日?qǐng)?bào);2008年

6 劉曉燕　呂志平;蛋白質(zhì)組研究為中醫(yī)藥發(fā)展帶來新曙光[N];中國中醫(yī)藥報(bào);2004年

7 ;大小公司“通吃”競(jìng)爭(zhēng)日趨激烈[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報(bào);2001年

8 吳志軍 記者 張鋒;我國人類重大疾病蛋白質(zhì)組學(xué)研究啟動(dòng)[N];解放軍報(bào);2002年

9 黎明;科學(xué)新寵——蛋白質(zhì)組學(xué)[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報(bào);2001年

10 本報(bào)特約記者 洛頻;利用蛋白質(zhì)組學(xué)加速癌癥研究[N];中國高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)導(dǎo)報(bào);2002年

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 張國安;生物質(zhì)譜新技術(shù)及其在疾病蛋白質(zhì)組研究中的應(yīng)用[D];復(fù)旦大學(xué);2003年

2 應(yīng)萬濤;基于凝膠電泳的蛋白質(zhì)組研究策略及應(yīng)用[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2004年

3 王京蘭;磷酸化蛋白質(zhì)分析方法研究及其在人胎肝磷酸化蛋白質(zhì)組研究中的應(yīng)用[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2004年

4 于雁靈;比較蛋白質(zhì)組定量分析及其在疾病研究中的應(yīng)用[D];復(fù)旦大學(xué);2004年

5 李海龍;長角血蜱雌蜱唾液腺蛋白質(zhì)及激素調(diào)控的研究[D];河北師范大學(xué);2005年

6 郭立海;人胎肝細(xì)胞質(zhì)膜和人紅細(xì)胞膜蛋白質(zhì)組分析[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2005年

7 何瓊瓊;HCV NS3基因轉(zhuǎn)化人肝細(xì)胞及其機(jī)制研究[D];中南大學(xué);2004年

8 姜虹;端粒功能缺陷細(xì)胞分泌的蛋白質(zhì)即人類衰老和疾病的預(yù)報(bào)因子[D];浙江大學(xué);2008年

9 李晶;幽門螺桿菌動(dòng)物模型菌株SS1定植因素分析[D];中國疾病預(yù)防控制中心;2009年

10 章波;電離輻射致腸上皮損傷與修復(fù)相關(guān)蛋白的研究[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2003年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 王潔;雙向電泳法測(cè)定大鼠輻照前后外周血淋巴細(xì)胞蛋白質(zhì)組的差異表達(dá)[D];蘇州大學(xué);2004年

2 馬翔;卵細(xì)胞成熟過程蛋白質(zhì)表達(dá)差異性研究[D];南京醫(yī)科大學(xué);2003年

3 王蓉;大劑量化療動(dòng)物模型的構(gòu)建[D];山西醫(yī)科大學(xué);2007年

4 王東根;關(guān)于我國人類肝臟蛋白質(zhì)組研究策略探討[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2003年

5 沈靜;Hcy誘導(dǎo)血管平滑肌細(xì)胞增殖相關(guān)蛋白質(zhì)的比較蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2004年

6 郝運(yùn)偉;16-24周孕齡人胎肝細(xì)胞核蛋白質(zhì)表達(dá)譜的構(gòu)建[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2004年

7 段小軍;高血壓肝陽上亢證大鼠模型的復(fù)制及天麻鉤藤飲的干預(yù)作用研究[D];廣州中醫(yī)藥大學(xué);2006年

8 閻瀾;白念珠菌耐藥株的蛋白質(zhì)組與基因表達(dá)譜分析及差異蛋白質(zhì)與差異基因的識(shí)別鑒定[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2006年

9 朱葉飛;小鼠精子發(fā)生相關(guān)蛋白質(zhì)的初步分析[D];南京醫(yī)科大學(xué);2003年

10 翁瑜;射頻電磁場(chǎng)對(duì)細(xì)胞蛋白質(zhì)表達(dá)譜的影響[D];浙江大學(xué);2005年

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