中華按蚊幼蟲腸道細(xì)菌宏基因組的組成研究
本文關(guān)鍵詞:中華按蚊幼蟲腸道細(xì)菌宏基因組的組成研究
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【摘要】:目的了解野外采集的中華按蚊幼蟲腸道細(xì)菌的多樣性。方法應(yīng)用高通量測序技術(shù)測定采自上海嘉定稻田(分成兩組,即L1和L2)和海南文昌滲出小積水(AS)的中華按蚊幼蟲腸道細(xì)菌16S rDNA V4變異區(qū)序列,應(yīng)用Qiime和Mothur等軟件整理和統(tǒng)計樣品序列數(shù)目和操作分類單元(OTUs)數(shù)量,分析物種的豐度、分布和Alpha多樣性,以及物種豐度的差異性。結(jié)果本研究獲得用于分析的序列和OTU數(shù)為253 724/3 930(L1)、225 203/4 312(L2)和73 990/2 380(AS);稀疏曲線表明測序深度充分,OTU的數(shù)量接近實際情況。L1、L2和AS等3個樣品的豐富度指數(shù)分別為5 942.61/6 534.88、6 328.17/7 235.89和4 228.66/5 651.20,多樣性指數(shù)分別為4.63/0.03、5.10/0.02和0.14/3.94。中華按蚊幼蟲腸道優(yōu)勢菌種均隸屬變形菌門,分別占87%(AS)和90%(L),除此之外,共有的優(yōu)勢門還有厚壁菌門、擬桿菌門和放線菌門。比較樣品L與AS的細(xì)菌豐度,發(fā)現(xiàn)除變形菌門和異常球菌-棲熱菌門外,其余18門均差異顯著;樣品L1和L2相比,僅9個門差異顯著。結(jié)論獲得了稻田和海邊滲出水環(huán)境中華按蚊幼蟲腸道細(xì)菌的均勻度、豐富度和菌群結(jié)構(gòu)。
【作者單位】: 陜西師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;第二軍醫(yī)大學(xué)病原生物學(xué)教研室;Biology
【關(guān)鍵詞】: 中華按蚊 幼蟲 細(xì)菌菌群 高通量測序
【基金】:國家自然科學(xué)基金委員會-云南省人民政府聯(lián)合基金(No.U0932604)~~
【分類號】:R378
【正文快照】: 按蚊是一類重要的醫(yī)學(xué)昆蟲,有些種類可傳播嚴(yán)重危害人類健康的疾病,如瘧疾、絲蟲病和病毒病等。眾所周知,瘧疾的病原體(瘧原蟲)必須在按蚊體內(nèi)經(jīng)歷一系列復(fù)雜的發(fā)育和繁殖過程,才可感染人。有研究顯示,按蚊腸道共生菌可影響瘧原蟲的發(fā)育[1-3],如在實驗室發(fā)現(xiàn),感染了某些革蘭
【相似文獻(xiàn)】
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中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 何桂銘;容t,
本文編號:1132849
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