本文關(guān)鍵詞：阜陽市手足口病柯薩奇病毒A10型VP4區(qū)基因特征分析

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【摘要】：目的分析2011-2012年阜陽市手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)患兒咽拭子標(biāo)本分離的柯薩奇病毒A10型(coxsackievirus A10,CoxA10)VP4區(qū)的基因特征,初步了解該病毒的變異情況。方法對49份HFMD患兒的咽拭子標(biāo)本進(jìn)行病毒分離,出現(xiàn)人腸道病毒(human enterovirus,HEV)特征性病毒致細(xì)胞病變效應(yīng)(cytopathic effect,CPE)后提取病毒RNA,用VP4區(qū)分型引物進(jìn)行半巢式反轉(zhuǎn)錄-PCR,再通過測序和GenBank Blast比對確定病毒型別,并對其VP4區(qū)進(jìn)行序列進(jìn)化分析。結(jié)果 49份咽拭子標(biāo)本有16份出現(xiàn)了特征性CPE,病毒分離陽性率32.7%。其中三株經(jīng)鑒定為CoxA10,陽性率18.8%。它們的VP4區(qū)核苷酸序列同源性為95%～99%,與GenBank中參考毒株VP4區(qū)核苷酸序列同源性為77%～97%。其中與中國株HQOO5431同源性為96%～97%,與中國株JN639887同源性為96%～97%,與中國株FJ598089同源性為95%～96%,與日本株AB282808同源性為85%～86%,與日本株AB162743同源性為87%～89%,與CoxA10原型株Kowalik(AF081300)同源性為77%～78%。進(jìn)化分析表明這三株分離株與Kowalik株聚成一簇,均屬于CoxA10,與日本各地分離的CoxA10的病毒核苷酸差異較大,但與我國本土分離株自成一簇。結(jié)論 2011-2012年阜陽地區(qū)手足口病病原體CoxA10 VP4與中國地區(qū)分離株在進(jìn)化上密切相關(guān),其序列未發(fā)生明顯變異。
【作者單位】： 安徽醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院微生物學(xué)教研室;哥倫比亞大學(xué)病理與細(xì)胞生物學(xué)教研室;
【關(guān)鍵詞】： 手足口病 柯薩奇病毒感染 序列同源性
【基金】：國家自然科學(xué)基金(30872253) 安徽省科技廳科技攻關(guān)項目(8010302179)
【分類號】：R373
【正文快照】： 作為一種常見的兒童傳染性疾病,手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)近年來在我國的發(fā)病率呈現(xiàn)明顯上升的趨勢。HFMD主要由多種人腸道病毒(human enterovirus,HEV)引起,包括柯薩奇病毒A組(coxsackievirus A,CVA)的2、4、5、7、9、10、16型,柯薩奇病毒B組(coxsackievir

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本文編號：1102039