發(fā)布時(shí)間：2017-10-15 23:38

  本文關(guān)鍵詞：多位點(diǎn)序列分型方法在嗜麥芽窄食單胞菌分子分型中的應(yīng)用

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【摘要】：目的建立多位點(diǎn)序列分型方法(Multilocus sequence typing,MLST)分析嗜麥芽窄食單胞菌。方法提取嗜麥芽窄食單胞菌基因組DNA,選擇文獻(xiàn)報(bào)道的7個(gè)嗜麥芽窄食單胞菌管家基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,將目的基因PCR產(chǎn)物測(cè)序,測(cè)序結(jié)果與標(biāo)準(zhǔn)序列比對(duì)后上傳至數(shù)據(jù)庫(kù)(http://pubmlst.org/smaltophilia/),獲得相應(yīng)的7對(duì)管家基因組成的等位基因譜和序列分型編碼(sequence types,STs),應(yīng)用MLST方法分析68株嗜麥芽窄食單胞菌ST型的流行病學(xué)意義。結(jié)果對(duì)68株嗜麥芽窄食單胞菌菌株通過(guò)多位點(diǎn)序列分型方法分析,所有菌株均為同一新的ST型(ST87),該結(jié)果與現(xiàn)場(chǎng)流行病學(xué)的關(guān)系一致。結(jié)論 MLST是一種方便、快速的分子生物學(xué)方法,實(shí)驗(yàn)室菌株資料可以比較,適用于嗜麥芽窄食單胞菌的進(jìn)化關(guān)系、群體結(jié)構(gòu)和長(zhǎng)期的全球分子流行病學(xué)研究。
【作者單位】： 中國(guó)疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所;
【關(guān)鍵詞】： 嗜麥芽窄食單胞菌 分子分型 多位點(diǎn)序列分型
【基金】：國(guó)家科技重大項(xiàng)目“重大傳染病應(yīng)急處置檢測(cè)技術(shù)平臺(tái)”(No.2011ZX10004-001,No.2013ZX10004-101002)~~
【分類號(hào)】：R378.2
【正文快照】： 窄食單胞菌屬(Stenotrophomonas)是一個(gè)新命名的菌屬,屬于變形菌門(mén)、β-γ變形菌亞綱,嚴(yán)格 非發(fā)酵型專性需氧、具有運(yùn)動(dòng)能力的革蘭氏陰性桿菌,以前稱為嗜麥芽假單胞菌和嗜麥芽窄食單胞菌。近幾年除了嗜麥芽窄食單胞菌(S.maltophilia)外,還鑒定了以下11個(gè)種:好氧反硝化窄食單

【共引文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 李文革;田國(guó)忠;盧金星;;多位點(diǎn)串聯(lián)重復(fù)序列分析方法在嗜麥芽窄食單胞菌分子分型中的應(yīng)用[J];疾病監(jiān)測(cè);2013年09期

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 金春光;林輝;徐景野;鄭劍;;脈沖場(chǎng)凝膠電泳對(duì)銅綠假單胞菌的分子檢測(cè)與相關(guān)性分析[J];中國(guó)微生態(tài)學(xué)雜志;2007年02期

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4 金東;崔志剛;肖玉春;王鑫;顧鋒;夏勝利;胡萬(wàn)富;楊晉川;汪華;顧玲;徐建國(guó);闞飆;景懷琦;;中國(guó)六省致病小腸結(jié)腸炎耶爾森菌的脈沖場(chǎng)凝膠電泳分析[J];中華流行病學(xué)雜志;2006年08期

5 金春光;石優(yōu)章;徐景野;鄭劍;;用脈沖場(chǎng)凝膠電泳方法對(duì)O139霍亂弧菌分型的研究[J];中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志;2007年04期

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9 金玉娟;甘莉萍;楊慧;楊坤祥;;深圳市龍崗區(qū)2004～2008年傷寒沙門(mén)菌脈沖場(chǎng)電泳分子分型研究[J];中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志;2009年07期

10 陳瑞;訾占超;石佩;宋立;;雞沙門(mén)氏菌脈沖場(chǎng)凝膠電泳分型研究[J];中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào);2009年11期

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 陳經(jīng)雕;鄧小玲;柯碧霞;劉美真;譚海玲;柯昌文;李柏生;;羊種布魯氏菌菌株分子分型研究[A];新發(fā)和再發(fā)傳染病防治熱點(diǎn)研討會(huì)論文集[C];2010年

2 郭軍慶;杜振昆;張妙仙;項(xiàng)玉燕;柯永恩;周繼勇;;奶牛布氏桿菌分離株的分子分型[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)獸醫(yī)公共衛(wèi)生學(xué)分會(huì)成立大會(huì)暨第一次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2008年

3 陳敏;廖萬(wàn)清;吳紹熙;姚志榮;陳江漢;徐紅;陳裕充;;新生隱球菌變種間ITS序列差異的研究[A];第二屆全國(guó)深部真菌感染學(xué)術(shù)會(huì)議論文集[C];2007年

4 薛峰;徐飛;陳穎;李震中;張睿;張常印;蔣原;李懷林;陸承平;;2006-2008年華東地區(qū)空腸彎曲菌動(dòng)物源分離株分子分型研究[A];動(dòng)物檢疫學(xué)分會(huì)2010年學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2010年

5 李孝權(quán);鄧小玲;鄧志愛(ài);張欣強(qiáng);吳新偉;陳守義;王鳴;;廣州地區(qū)小川型霍亂弧菌的脈沖場(chǎng)凝膠電泳分析[A];2010廣東省預(yù)防醫(yī)學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)資料匯編[C];2010年

6 凌華志;李濤;徐元宏;曹紅霞;;假單胞菌屬細(xì)菌中整合子的分布及其可轉(zhuǎn)移耐藥性研究[A];第五次全國(guó)中青年檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2006年

7 張蔚;;杭州地區(qū)副溶血弧菌臨床及小水產(chǎn)品分離株的分子分型[A];應(yīng)對(duì)突發(fā)公共衛(wèi)生事件論壇論文集[C];2005年

8 李小麗;鄭曉燕;陰峧宏;;志賀菌分型方法的研究進(jìn)展及其應(yīng)用和價(jià)值評(píng)估[A];“2008災(zāi)害創(chuàng)傷與急救新進(jìn)展”學(xué)術(shù)交流會(huì)學(xué)術(shù)論文集[C];2008年

9 潘勁草;葉榕;王滿琴;張文元;孟冬梅;濮小英;張蔚;汪皓秋;黃志成;施世鋒;項(xiàng)海青;何浙生;;O139群霍亂弧菌的核糖體基因分型及其與藥物抗性相關(guān)性研究[A];應(yīng)對(duì)突發(fā)公共衛(wèi)生事件論壇論文集[C];2005年

10 李小麗;陰峧宏;栗紹剛;溫艷;黃敏君;齊志群;李威;;志賀菌分型方法的研究進(jìn)展、應(yīng)用及價(jià)值評(píng)估[A];第四屆全國(guó)災(zāi)害醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議暨第二屆“華森杯”災(zāi)害醫(yī)學(xué)優(yōu)秀學(xué)術(shù)論文評(píng)審會(huì)學(xué)術(shù)論文集[C];2007年

中國(guó)重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 項(xiàng)錚;運(yùn)用生物芯片了解天賦基因[N];科技日?qǐng)?bào);2008年

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前8條

1 孫二琳;嗜麥芽窄食單胞菌臨床株的耐藥特性[D];天津醫(yī)科大學(xué);2004年

2 趙帆;中國(guó)漢賽巴爾通體的分子分型研究[D];中國(guó)疾病預(yù)防控制中心;2011年

3 江玲麗;單核細(xì)胞增多性李斯特菌的主要毒力基因分析及其重組菌構(gòu)建與免疫原性[D];浙江大學(xué);2006年

4 李勁松;深部念珠菌的基因診斷、分子分型及耐藥機(jī)制研究[D];天津醫(yī)科大學(xué);2004年

5 陶江;某些重要人類致病微生物分子進(jìn)化的研究[D];南開(kāi)大學(xué);2004年

6 席美麗;食源性革蘭氏陰性腸道病原菌PFGE分型和大腸桿菌耐藥性研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2009年

7 張曉媛;腸出血性大腸桿菌O157:H7大質(zhì)粒pO157的致病機(jī)制研究[D];中國(guó)疾病預(yù)防控制中心;2011年

8 潘玉善;禽源大腸桿菌、奇異變形桿菌多重耐藥的分子特征及CTX-M基因傳播擴(kuò)散機(jī)制[D];河南農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 李婧;我國(guó)部分地區(qū)不同來(lái)源副溶血弧菌的分子分型及遺傳變異研究[D];中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2012年

2 陳建才;傷寒沙門(mén)菌SNPs分子分型分析和鼠傷寒沙門(mén)菌分子流行病學(xué)特點(diǎn)研究[D];蘇州大學(xué);2012年

3 吳松羽;炭疽芽孢桿菌MLVA分子分型研究[D];南昌大學(xué);2011年

4 劉萍萍;產(chǎn)單核細(xì)胞李氏桿菌分子分型及侵襲相關(guān)基因研究[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2013年

5 吳國(guó)輝;重慶市霍亂弧菌的分子流行病學(xué)研究[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2008年

6 周海健;中國(guó)霍亂弧菌PFGE數(shù)據(jù)庫(kù)的建立以及AFLP用于分型實(shí)驗(yàn)條件的研究[D];中國(guó)疾病預(yù)防控制中心;2008年

7 杜振昆;奶牛布魯氏菌的PCR檢測(cè)與分子分型研究[D];新疆農(nóng)業(yè)大學(xué);2007年

8 季金殿;羽毛角蛋白質(zhì)降解菌的分離、鑒定與角蛋白酶基因的克隆、表達(dá)[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年

9 梁歌宏;嗜麥芽窄食單胞菌生物被膜的鑒定和抗生素的體外抗菌活性研究[D];天津醫(yī)科大學(xué);2008年

10 宋振銀;雞源魏氏梭菌的分離、鑒定及分子分型研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2008年

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