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新疆漢族人群HLA-DRB1、DQB1、DPB1基因多態(tài)性與肺結(jié)核易感相關(guān)性研究

發(fā)布時(shí)間:2017-09-02 14:18

  本文關(guān)鍵詞:新疆漢族人群HLA-DRB1、DQB1、DPB1基因多態(tài)性與肺結(jié)核易感相關(guān)性研究


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【摘要】:目的:本研究通過PCR-SBT法對新疆漢族肺結(jié)核患者和健康人群HLA-DRB1、DQB1、DPB1進(jìn)行等位基因分型,揭示新疆漢族HLA-DRB1、DQB1、DPB1的基因多態(tài)性,闡明HLA-DRB1、DQB1、DPB1與肺結(jié)核發(fā)生的相關(guān)性。方法:采用聚合酶鏈反應(yīng)-直接測序基因分型(Sequence-Based Typing,SBT),分別對92例新疆漢族肺結(jié)核患者與96例新疆漢族隨機(jī)健康對照者的HLA-DRB1、DQB1、DPB1等位基因分型,使用Arlequin 3.15軟件,以最大似然法(Maximum-Likelihood)計(jì)算Hardy-Weinberg平衡、各位點(diǎn)等位基因頻率、單倍型頻率。組間比較采用卡方(χ2)檢驗(yàn),OR值和95%的置信區(qū)間用于患肺結(jié)核風(fēng)險(xiǎn)的評價(jià)。結(jié)果:1.病例組和對照組人群HLA-DRB1、DQB1、DPB1三位點(diǎn)均通過Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)。2.在兩組人群中分別檢出HLA-DRB1等位基因30個(gè)和29個(gè),其中HLA-DRB1*07:01在病例組中的頻率顯著高于對照組(15.8%vs8.3%,OR=2.058,P=0.027),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。3.在兩組人群中分別檢出HLA-DQB1等位基因16個(gè)和29個(gè),其中HLA-DQB1*03:01在病例組中的頻率顯著高于對照組(28.3%vs13.5%,OR=2.515,P=0.0004),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;與對照組相比,病例組HLA-DQB1*03:03頻率明顯增高,但差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.053)。4.在兩組人群中分別檢出HLA-DPB1等位基因12個(gè)和16個(gè),其中HLA-DPB1*05:01(37.5%vs28.1%,OR=1.554,P=0.049)在病例組中的頻率顯著高于對照組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;HLA-DPB1*02:01(16.8%vs27.6%,OR=0.552,P=0.010)在對照組中頻率顯著高于病例組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。5.在兩組人群中分別檢出DRB1-DQB1單倍型43個(gè)和98個(gè),其中DRB1*07:01-DQB1*02:02(10.9%vs 4.7%,OR=2.480,P=0.025)和DRB1*09:01-DQB1*03:03(10.9%vs 5.2%,,OR=2.220,P=0.043)在病例組的頻率顯著高于對照組,兩組差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。6.在兩組人群中分別檢出DRB1-DPB1單倍型76個(gè)和81個(gè),兩組人群間單此倍型頻率無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。7.在兩組人群中分別檢出DQB1-DPB1單倍型56個(gè)和83個(gè),其中DQB1*03:01-DPB1*05:01(15.8%vs 7.5%,OR=2.379,P=0.010)和DQB1*03:03-DPB1*05:01(19.8%vs 2.3%,OR=4.055,P=0.004)在病例組的頻率顯著高于對照組,兩組差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。8.在兩組人群中分別檢出DRB1-DQB1-DPB1單倍型86個(gè)和135個(gè),其中DRB1*11:01-DQB1*03:01-DPB1*05:01(5.4%vs 1%,OR=5.869,P=0.015)和DRB1*09:01-DQB1*03:03-DPB1*05:01(8.7%vs 1.6%,OR=9.964,P=0.002)在病例組的頻率顯著高于對照組,兩組差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)論:1.HLA-DRB1、DQB1、DPB1在新疆漢族中存在較為豐富的多態(tài)性。2.HLA-DRB1*07:01、HLA-DQB1*03:01可能是新疆漢族肺結(jié)核患者的易感基因,HLA-DPB1*02:01可能是新疆漢族肺結(jié)核患者的保護(hù)性基因,HLA-DPB1*05:01是否為新疆漢族肺結(jié)核患者的易感基因有待加大樣本量進(jìn)一步確認(rèn);DRB1*07:01-DQB1*02:02、DRB1*09:01-DQB1*03:03、DQB1*03:01-DPB1*05:01、DQB1*03:03-DPB1*05:01、DRB1*11:01-DQB1*03:01-DPB1*05:01和DRB1*09:01-DQB1*03:03-DPB1*05:01可能是新疆漢族肺結(jié)核患者的易感單倍型。
【關(guān)鍵詞】:白細(xì)胞分化抗原 肺結(jié)核 等位基因 單倍型
【學(xué)位授予單位】:石河子大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R521
【目錄】:
  • 摘要5-6
  • Abstract6-9
  • 英文縮略詞9-10
  • 前言10-13
  • 材料與方法13-20
  • 1 材料13
  • 1.1 主要試劑13
  • 1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備13
  • 2 方法13-18
  • 2.1 研究對象及臨床資料13-14
  • 2.1.1 肺結(jié)核病例組13-14
  • 2.1.2 健康對照組14
  • 2.2 實(shí)驗(yàn)方法14-18
  • 2.2.1 標(biāo)本的處理和保存14
  • 2.2.2 DNA的提取與檢測14-15
  • 2.2.3 HLA-DRB1、DQB1、DPB1基因分型15-18
  • 3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析18
  • 4 技術(shù)路線18-20
  • 結(jié)果20-31
  • 1 PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果20
  • 2 PCR產(chǎn)物的DNA測序結(jié)果20-22
  • 3 病例組與對照組的HLA-DRB1、HLA-DQB1、HLA-DPB1三位點(diǎn)平衡檢驗(yàn)22-23
  • 4 等位基因頻率的分布及比較23-26
  • 5 單倍型頻率的分布及比較26-31
  • 討論31-35
  • 結(jié)論35-36
  • 參考文獻(xiàn)36-40
  • 文獻(xiàn)綜述40-45
  • 參考文獻(xiàn)43-45
  • 致謝45-46
  • 附錄一46-47
  • 作者簡介47-48
  • 導(dǎo)師評閱表48

【相似文獻(xiàn)】

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1 邢萬佳,張勝蘭,克丙申,黃象艷,晏輝,姜兆順;HLA-DQB1、DPB1基因與1型糖尿病相關(guān)性研究[J];中國糖尿病雜志;2001年05期

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1 張海燕;維吾爾族霍奇金淋巴瘤與HLA-DRB1、DPA1、DPB1基因多態(tài)性的相關(guān)性研究[D];新疆醫(yī)科大學(xué);2016年

2 盧麗君;新疆漢族人群HLA-DRB1、DQB1、DPB1基因多態(tài)性與肺結(jié)核易感相關(guān)性研究[D];石河子大學(xué);2016年



本文編號(hào):779056

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