我國近10年肺結核發(fā)病率分析及結核分枝桿菌快速檢測方法研究
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【摘要】:目的: 1.以省級行政區(qū)域為研究對象,建立2004-2012年全國31個。ㄗ灾螀^(qū)、直轄市)肺結核地理信息數(shù)據(jù)庫,制作肺結核發(fā)病的專題地圖,并描述我國肺結核發(fā)病在時間、地點、人群的“三間分布”特征,確定2004-2012年我國肺結核高發(fā)區(qū)、高發(fā)期和高危人群,為部隊肺結核防控關鍵技術研發(fā)提供依據(jù)。 2.篩選結核分枝桿菌特異性的基因作為LAMP檢測的靶基因序列,設計并篩選特異性的引物,用檢測濁度法和鈣黃綠素染色法對該引物的特異性與靈敏性測試,為部隊結核病現(xiàn)場快速檢測提供一種新的檢測與判斷方法。 方法: 1.近10年肺結核發(fā)病率分析 1.1.數(shù)據(jù)收集和處理的方法 利用中國疾病監(jiān)測信息報告管理系統(tǒng),收集研究區(qū)域內肺結核網(wǎng)絡報告數(shù)據(jù)和人口信息,利用Excel2010軟件,對數(shù)據(jù)進行比對篩選和排序整理。 1.2利用ArcGIS9.0軟件,建立我國各省結核地理信息數(shù)據(jù)庫,從時間、空間、人群三方面,對我國結核發(fā)病分布特征進行描述性分析。 2.結核分枝桿菌快速檢測方法研究 2.1引物篩選 通過NCBI在線數(shù)據(jù)庫的檢索,選擇結核分枝桿菌的特異性保守序列IS6110為靶序列,并針對這一序列用軟件(Primer Explorer4)設計特異性的LAMP引物,并篩選最佳引物。 2.2特異性評價 用篩選的最佳引物分別檢測結核分枝桿菌和非結核分枝桿菌,,評價該引物檢測結核分枝桿菌的特異性。 2.3靈敏性評價 將提取的結核分枝桿菌DNA進行10倍梯度稀釋,用該引物進行檢測,評價其靈敏性與傳統(tǒng)PCR方法的差異。 結果: 1.近10年肺結核發(fā)病率分析 1.1全國肺結核發(fā)病概況 2004-2012年我國31個省、直轄市和自治區(qū),共報告肺結核發(fā)病病例9663,728例,死亡26,932例,十年來我國肺結核病例報告總體呈下降趨勢。 1.2全國肺結核空間分布情況 新疆肺結核年均發(fā)病率為181.42/10萬居全國首位,貴州、海南、廣西、重慶、西藏、黑龍江六。ㄖ陛犑小⒆灾螀^(qū))年均發(fā)病率次之,北京、山東、上海和天津四。ㄖ陛犑校┠昃l(fā)病率低于50/10萬。 1.3全國肺結核時間分布情況 從2004-2012年我國肺結核月均發(fā)病率來看,一、二季度肺結核發(fā)病率較高,三、四季度肺結核發(fā)病率較低,其中,1月和3月發(fā)病率較高且相近,自3月份起發(fā)病率逐月下降,12月發(fā)病率為一年中最低。 1.4全國肺結核人間分布情況 肺結核患者中男性高于女性;從年齡分布上看,14歲以下人群年均發(fā)病率較低,老年人(60歲以后)年均發(fā)病率最高。從職業(yè)分布上看,我國肺結核發(fā)病主要以農民為主。 2.結核分枝桿菌快速檢測方法研究 2.1最佳引物篩選 以結核分支桿菌IS6110基因序列為靶序列,設計5套LAMP引物為反應引物,以結核分枝桿菌為模板在濁度儀中進行LAMP反應,結果顯示引物JH164組為最佳擴增引物。 2.2JH164引物檢測結核分枝桿菌的特異性檢測實驗 用JH164引物對14種細菌DNA進行檢測,結果顯示,JH164引物具有良好的特異性。 2.3JH164引物檢測結核分枝桿菌靈敏性實驗 用JH164引物分別用濁度法和鈣黃綠素染色法進行檢測,檢測10倍梯度稀釋的結核分枝桿菌DNA,結果顯示,用JH164引物進行LAMP結核分枝桿菌檢測的靈敏性是傳統(tǒng)PCR方法的10倍,最低檢測值為:101pg/μl。 結論: 1.在過去的10年,我國肺結核發(fā)病率呈總體下降趨勢,但防控形勢依然嚴峻。我國肺結核病在新疆發(fā)病率最高,提示該地區(qū)結核病防控應作為重點。從發(fā)病時間來看,我國肺結核發(fā)病多集中在一、二季度,提示此時為結核病多發(fā)季節(jié),應做好結核病防控措施。從人群角度來看,肺結核患者多為務農者,以男性為主,老年人發(fā)病率較高。 2.用LAMP方法檢測結核分枝桿菌具有簡單、快速、特異性高、靈敏性好的特點,而且反應在恒溫狀態(tài)下即可發(fā)生,反應成本低,是一種非常適用于基本部隊的結核分枝桿菌快速檢測技術,如果使用鈣黃綠素染色法,在其反應結果判斷方面則更為簡單,對結核病疫情的早期控制和結核病患者的早發(fā)現(xiàn)、早診斷、早治療具有十分重要的意義。
【關鍵詞】:結核分枝桿菌 發(fā)病率 LAMP 快速檢測
【學位授予單位】:第三軍醫(yī)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2013
【分類號】:R521;R446.5
【目錄】:
- 縮略語表4-5
- Abstract5-8
- 摘要8-11
- 第一章 前言11-17
- 第二章 近 10 年肺結核發(fā)病率分析17-23
- 2.1 材料與方法17
- 2.2 結果17-21
- 2.3 結論21-22
- 2.4 討論22-23
- 第三章 環(huán)介導的恒溫擴增法快速檢測結核分枝桿菌的研究23-39
- 3.1 材料與方法23-33
- 3.2 結果33-37
- 3.3 討論37-39
- 全文結論39-40
- 本研究的創(chuàng)新點與不足40-41
- 參考文獻41-44
- 文獻綜述44-53
- 參考文獻50-53
- 研究生期間發(fā)表和待發(fā)的論文53-54
- 致謝54
【參考文獻】
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本文關鍵詞:我國近10年肺結核發(fā)病率分析及結核分枝桿菌快速檢測方法研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號:325406
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