Sp110基因rs1135791、rs722555多態(tài)性與結核病的相關性研究
發(fā)布時間:2021-01-10 17:23
[目的]研究Sp110基因rs1135791、rs722555多態(tài)性與肺結核易感性的關系。[方法]采用病例對照研究,選取重慶地區(qū)100例肺結核患者和106例健康對照,運用嵌套式等位基因特異性引物PCR技術檢測Sp110基因rs1135791C/T位點和rs722555A/G位點基因型,運用χ2檢驗分析其基因型頻率和等位基因頻率與肺結核的相關性。[結果]病例組rs1135791CT基因型、C等位基因頻率均高于對照組,差異有統(tǒng)計學意義(P﹤0.05),OR值分別為1.9795和1.6951;病例組rs722555GG基因型、G等位基因頻率均高于對照組,差異有統(tǒng)計學意義(P﹤0.05),OR值分別為2.0235和1.5874。[結論]Sp110基因rs1135791、rs722555多態(tài)性可能是重慶地區(qū)漢族人群肺結核遺傳易感性的危險因素。
【文章來源】:現(xiàn)代預防醫(yī)學. 2008,(03)北大核心
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
NASP- PCR 引物設計原理模式圖
Vol.35, NO.3見表 3, 運用 Mastercycler PCR 擴增儀 ( 德國 Eppendorf 公司)進行PCR 擴增分析。信息(GenBank No.AC009950.6.[gi: 13435267] ) , 利用Primer5. 0軟件設計符合研究需要的引物 ( 表 1) , 利用嵌套式等位基因特異性引物 PCR 技術 ( Nested allele- specific primer, NASP-PCR) 檢測其多態(tài)性。所有引物均由上海生物工程技術有限公司合成。· 417·
2.2.2 rs722555 位點經(jīng) PCR 擴增后產(chǎn)生 3 種基因型 純合子AA ( 221 bp 與 558 bp) , 純合子 GG ( 378 bp 與 558 bp) , 雜合子 AG (221 bp、378 bp 與 558 bp) , 見圖 3。2.3 rs1135791、rs722555 位點多態(tài)性與肺結核發(fā)病相關性分析2.3.1 Hardy- Weinberg 平衡檢驗 對對照組的各位點基因型頻率進行了平衡檢驗, 結果顯示這兩個多態(tài)性位點的基因型分布符合 Hardy- Weinberg 平衡 (P﹥0.05) 。2.3.2 基因型與肺結核發(fā)病相關性分析 rs1135791 位點的 TT和 CT 基因型在病例組和對照組的分布差異有統(tǒng)計學意義(χ2=5.49, P = 0.019 2) , 病 例 組 CT 基 因 型 頻 率 高 于 對 照 組 。rs722555 位點的 AA、AG 和 GG 基因型在病例組和對照組的分布差異有統(tǒng)計學意義 ( χ2= 6.468 9, P = 0.039 4) 。進一步分析發(fā)現(xiàn), 病例組 GG 基因型頻率高于對照組, 差異有統(tǒng)計學意義。結果見表 4。2.3.3 等位基因頻率與肺結核發(fā)病相關性分析 從 rs1135791、rs722555 位點各等位基因在病例組和對照組的分布來看, 病例組 rs1135791C 等位基因和 rs722555G 等位基因頻率都高于對照組
【參考文獻】:
期刊論文
[1]漢族人群NOS2 C-1173T、G-954C單核苷酸多態(tài)性及其等位基因頻率與組合分布特征研究[J]. 馬厚勛,謝正祥,牛永紅,李章勇. 重慶醫(yī)科大學學報. 2005(01)
本文編號:2969108
【文章來源】:現(xiàn)代預防醫(yī)學. 2008,(03)北大核心
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
NASP- PCR 引物設計原理模式圖
Vol.35, NO.3見表 3, 運用 Mastercycler PCR 擴增儀 ( 德國 Eppendorf 公司)進行PCR 擴增分析。信息(GenBank No.AC009950.6.[gi: 13435267] ) , 利用Primer5. 0軟件設計符合研究需要的引物 ( 表 1) , 利用嵌套式等位基因特異性引物 PCR 技術 ( Nested allele- specific primer, NASP-PCR) 檢測其多態(tài)性。所有引物均由上海生物工程技術有限公司合成。· 417·
2.2.2 rs722555 位點經(jīng) PCR 擴增后產(chǎn)生 3 種基因型 純合子AA ( 221 bp 與 558 bp) , 純合子 GG ( 378 bp 與 558 bp) , 雜合子 AG (221 bp、378 bp 與 558 bp) , 見圖 3。2.3 rs1135791、rs722555 位點多態(tài)性與肺結核發(fā)病相關性分析2.3.1 Hardy- Weinberg 平衡檢驗 對對照組的各位點基因型頻率進行了平衡檢驗, 結果顯示這兩個多態(tài)性位點的基因型分布符合 Hardy- Weinberg 平衡 (P﹥0.05) 。2.3.2 基因型與肺結核發(fā)病相關性分析 rs1135791 位點的 TT和 CT 基因型在病例組和對照組的分布差異有統(tǒng)計學意義(χ2=5.49, P = 0.019 2) , 病 例 組 CT 基 因 型 頻 率 高 于 對 照 組 。rs722555 位點的 AA、AG 和 GG 基因型在病例組和對照組的分布差異有統(tǒng)計學意義 ( χ2= 6.468 9, P = 0.039 4) 。進一步分析發(fā)現(xiàn), 病例組 GG 基因型頻率高于對照組, 差異有統(tǒng)計學意義。結果見表 4。2.3.3 等位基因頻率與肺結核發(fā)病相關性分析 從 rs1135791、rs722555 位點各等位基因在病例組和對照組的分布來看, 病例組 rs1135791C 等位基因和 rs722555G 等位基因頻率都高于對照組
【參考文獻】:
期刊論文
[1]漢族人群NOS2 C-1173T、G-954C單核苷酸多態(tài)性及其等位基因頻率與組合分布特征研究[J]. 馬厚勛,謝正祥,牛永紅,李章勇. 重慶醫(yī)科大學學報. 2005(01)
本文編號:2969108
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