基于CUDA的腦組織快速提取研究
本文關(guān)鍵詞:基于CUDA的腦組織快速提取研究
更多相關(guān)文章: 腦組織提取 CUDA SP-BET 水平集 區(qū)域生長
【摘要】:隨著醫(yī)學成像技術(shù)的快速發(fā)展,磁共振成像技術(shù)徹底擺脫了電離輻射對人體細胞的傷害,無創(chuàng)傷,而且具有多方位成像,信息量大,能清楚區(qū)分軟組織等特點。從磁共振腦圖像中對腦組織的分割提取已成為腦功能研究及臨床醫(yī)學應(yīng)用中的一項非常重要的預(yù)處理過程。在實際應(yīng)用中,為檢測出病人和正常人大腦之間的細小差別,需要對大量病人和正常人的腦圖像進行腦組織提取實驗,以便細節(jié)比較。這需要較高的腦組織提取精度和速度,以及較強的穩(wěn)定性。手動的腦組織提取方法可以達到精度很高,但是費時費力,需要操作人員對大腦解剖結(jié)構(gòu)非常清楚,且受主觀性影響;自動的腦組織提取方法中采用混合方法,可以達到較高精度和穩(wěn)定性要求,處理時間比手動的快,但是速度上仍然難以滿足用戶需求。為此,本文提出基于CUDA的腦組織快速提取方法的研究,采用改進的BET、水平集、區(qū)域生長三種結(jié)合的混合的并行處理的腦組織自動提取算法。在本文中,利用CUDA多核GPU加速的方法快速提取腦組織。腦組織的提取算法首先采用改進的BET,通過分配線程并行處理的方式計算,每次迭代,一個線程計算大腦表面的一個頂點新位置,每個線程塊計算同一幅MR腦圖像切片的所有頂點更新時的新位置。因此,迭代N次后,可以同時更新K幅MR腦圖像切片所有頂點的新位置,即BET演化結(jié)束。為了改善算法的準確性,我們用上一幅MR腦圖像切片的BET演化結(jié)果作為下一幅MR腦圖像切片的初始腦組織輪廓。實驗結(jié)果表明,這種BET并行計算提取腦組織的方法在準確性和穩(wěn)定性方面全局最優(yōu),在處理110幅MR腦圖像切片時,運行時間不足1s,實現(xiàn)了腦組織輪廓的快速提取。在BET演化的基礎(chǔ)上,將所有離散的頂點兩兩相連連成線,得到初始的腦組織輪廓,并通過區(qū)域生長方法可以得到每幅MR腦圖像切片的初始腦組織掩模,最后再利用水平集和區(qū)域生長結(jié)合的方法提取準確的腦組織。實驗結(jié)果表明,水平集并行處理的方法在準確性和穩(wěn)定性方面局部最優(yōu),在處理一幅MR腦圖像切片時,運行時間低于1s,這種基于CUDA并行處理的混合方法實現(xiàn)了對腦組織的快速提取。
【關(guān)鍵詞】:腦組織提取 CUDA SP-BET 水平集 區(qū)域生長
【學位授予單位】:南昌航空大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:TP391.41;R445.2
【目錄】:
- 摘要4-5
- Abstract5-9
- 第一章 緒論9-19
- 1.1 課題研究背景和意義9-10
- 1.2 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀10-17
- 1.2.1 腦組織提取的研究現(xiàn)狀10-14
- 1.2.2 GPU的發(fā)展14-17
- 1.3 本文研究內(nèi)容17-18
- 1.4 本文結(jié)構(gòu)18-19
- 第二章 CUDA技術(shù)19-27
- 2.1 引言19
- 2.2 CUDA編程模型19-23
- 2.2.1 線程層次20-21
- 2.2.2 CUDA核21-22
- 2.2.3 CUDA對C的擴展22-23
- 2.3 CUDA存儲模型23-25
- 2.4 CUDA的開發(fā)環(huán)境25-26
- 2.5 本章小結(jié)26-27
- 第三章 基于CUDA和BET的腦組織快速提取27-42
- 3.1 引言27
- 3.2 BET算法原理27-30
- 3.2.1 輪廓的初始化28
- 3.2.2 BET的演化原理28-30
- 3.3 BET算法的改進30-33
- 3.3.1 平滑力的改進30-31
- 3.3.2 擴張力的改進31-32
- 3.3.3 搜索路徑的改進32-33
- 3.4 基于CUDA的腦組織快速提取33-41
- 3.4.1 P-BET方法33-36
- 3.4.2 SP-BET方法36-38
- 3.4.3 實驗結(jié)果38-41
- 3.5 本章小結(jié)41-42
- 第四章 基于CUDA、水平集和區(qū)域生長的腦組織快速提取42-57
- 4.1 引言42
- 4.2 水平集方法42-46
- 4.2.1 曲線演化42-44
- 4.2.2 水平集方法44-46
- 4.3 區(qū)域生長概述46-47
- 4.4 基于CUDA的腦組織提取實驗47-56
- 4.4.1 腦組織掩模的提取47-48
- 4.4.2 基于水平集的腦組織快速提取48-53
- 4.4.3 水平集和區(qū)域生長結(jié)合的腦組織快速提取53-56
- 4.5 本章小結(jié)56-57
- 第五章 總結(jié)和展望57-59
- 5.1 總結(jié)57-58
- 5.2 展望58-59
- 參考文獻59-63
- 致謝63-64
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