本文關(guān)鍵詞：呼吸道感染住院兒童中HBoV1的流行情況及其基因突變與病毒載量關(guān)系研究

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【摘要】：目的：研究人博卡病毒（HBoV1）在重慶地區(qū)呼吸道感染住院患兒中的流行情況，分析HBoV1病毒載量與病情相關(guān)關(guān)系；對(duì)HBoV1陽(yáng)性樣本進(jìn)行基因測(cè)序，分析HBoV1基因突變與臨床癥狀、病毒載量的關(guān)系。 方法：收集2009年6月至2011年5月因呼吸道感染（RTI）于重慶醫(yī)科大學(xué)附屬兒童醫(yī)院呼吸科住院患兒的鼻咽抽吸物（NPA）標(biāo)本，共846份。 Real-Time Quantitative PCR檢測(cè)HBoV1，分析HBoV1病毒載量與臨床癥狀之間的關(guān)系；對(duì)HBoV1陽(yáng)性樣本進(jìn)行基因測(cè)序，分析基因突變與臨床癥狀、病毒載量的關(guān)系。將HBoV1陽(yáng)性樣本擴(kuò)增后測(cè)序獲得的HBoV1臨床株與st2株進(jìn)行比對(duì)（GenBank acces sion no.DQ000496），序列比對(duì)使用MAGA5軟件進(jìn)行。實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)應(yīng)用SPSS17.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。 結(jié)果：846份NPA中，HBoV1陽(yáng)性112例（13.2%），以夏季流行為主，主要感染6月-2歲患兒。病毒定量研究發(fā)現(xiàn)，高載量的HBoV1更容易引起肺炎與腹瀉。對(duì)HBoV1陽(yáng)性樣本進(jìn)行測(cè)序，，得到27個(gè)HBoV1全基因組序列，2個(gè)NS1基因序列，15個(gè)NP1基因序列和10個(gè)VP1/VP2基因序列，三個(gè)基因中分別發(fā)現(xiàn)23個(gè)、10個(gè)和43個(gè)突變位點(diǎn)。HBoV1基因突變與患兒的臨床表現(xiàn)沒(méi)有明顯的統(tǒng)計(jì)學(xué)關(guān)系。在有NP1基因236位點(diǎn)（G236A）、447位點(diǎn)（A447G）以及VP1/VP2基因1461（G1461A）位點(diǎn)突變的樣本中，病毒拷貝數(shù)明顯低于未發(fā)生突變的樣本。 結(jié)論： HBoV1主要感染6月至2歲兒童，在重慶地區(qū)夏季為HBoV1流行季節(jié)。高載量HBoV1更容易引起肺炎和腹瀉。HBoV1基因突變與臨床癥狀無(wú)明顯關(guān)系，NP1基因236位點(diǎn)（G236A）、447位點(diǎn)（A447G）以及VP1/VP2基因1461（G1461A）位點(diǎn)突變可能影響病毒的復(fù)制。
【關(guān)鍵詞】：呼吸道感染 人博卡病毒 基因突變 腹瀉
【學(xué)位授予單位】：重慶醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2013
【分類號(hào)】：R725.6
【目錄】：

• 英漢縮略語(yǔ)名詞對(duì)照5-6
• 摘要6-8
• ABSTRACT8-11
• 前言11-13
• 第一部分 呼吸道感染住院兒童中 HBoV1 流行情況13-23
• 1 材料與方法13-18
• 1.1 研究對(duì)象13
• 1.2 主要儀器13
• 1.3 試驗(yàn)方法13-18
• 1.3.1 標(biāo)本收集和處理13-14
• 1.3.2 病毒 DNA/RNA 提取14
• 1.3.3 制備 HBoV1 質(zhì)粒 DNA14-17
• 1.3.4 Real-Time PCR 檢測(cè) HBoV117-18
• 1.3.5 HBoV1 陽(yáng)性患兒臨床特點(diǎn)及病毒定量分析18
• 2 研究結(jié)果18-20
• 2.1 人群特征及臨床診斷18
• 2.2 HBoV1 流行情況18-19
• 2.3 HBoV1 病毒載量與臨床表現(xiàn)19-20
• 3 討論20-23
• 第二部分 呼吸道感染住院患兒 NPA 檢出 HBoV1 基因突變與病毒載量相關(guān)關(guān)系23-31
• 1 材料與方法23-24
• 1.1 研究對(duì)象23
• 1.2 主要儀器23
• 1.3 試驗(yàn)方法23-24
• 1.3.1 PCR 擴(kuò)增 HBoV123-24
• 1.3.2 序列結(jié)果分析24
• 2 研究結(jié)果24-28
• 2.1 NS1、NP1 和 VP1/VP2 的基因突變分析24-27
• 2.2 基因突變與病毒載量的關(guān)系分析27-28
• 3 討論28-31
• 參考文獻(xiàn)31-34
• 文獻(xiàn)綜述34-42
• 參考文獻(xiàn)37-42
• 致謝42-43
• 攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表文章及科研情況43-44

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 修文瓊;劉光華;康玉蘭;沈曉娜;謝劍鋒;王美愛(ài);張文清;鄭奎城;;人博卡病毒全基因組序列測(cè)定與種系分析[J];中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào);2010年02期

本文編號(hào)：644978