本文關(guān)鍵詞：豬流行性腹瀉病毒感染PK-15細胞miRNA的差異表達分析

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【摘要】：為研究豬流行性腹瀉病毒(Porcine epidemic diahorrea virus,PEDV)對豬腎傳代細胞PK-15miRNA表達譜的影響,將PEDV感染PK-15細胞后,提取總RNA,進行高通量測序,構(gòu)建感染與未感染PEDV的PK-15細胞的miRNA表達譜,并進行差異性分析,對表達差異顯著的miRNA進行heatmap聚類分析及GO(Gene ontology,GO)分子功能(Molecular function,MF)分析,選取10個顯著性差異表達的miRNA通過RT-qPCR進行了驗證。結(jié)果發(fā)現(xiàn),顯著性差異表達的miRNA有214個,其中175個miRNA表達上調(diào),39個miRNA表達下調(diào)。Heatmap聚類分析表明,病毒組絕大部分差異表達的miRNA較對照組表達量上調(diào),少部分下調(diào)。GO分析表明,miRNA廣泛參與結(jié)合、蛋白結(jié)合、蛋白激酶活性、轉(zhuǎn)移酶活性、含磷基團轉(zhuǎn)移、磷酸轉(zhuǎn)移酶活性等生物作用。RT-qPCR驗證的各miRNA的表達趨勢與高通量測序結(jié)果一致。結(jié)果表明,豬流行性腹瀉病毒感染對PK-15細胞編碼的miRNA表達水平有顯著影響,從而對進一步研究治療PEDV的miRNA制劑提供新思路。
【作者單位】： 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動物生物技術(shù)中心;四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動物疫病與人類健康四川省重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】： 豬流行性腹瀉病毒 miRNA表達譜 PK-細胞
【基金】：教育部長江學(xué)者和創(chuàng)新團隊發(fā)展計劃(編號:IRT13083);教育部新世紀優(yōu)秀人才支持計劃(編號:NCET11-1059)
【分類號】：S852.651
【正文快照】： 豬流行性腹瀉(Porcine epidemic diahorrea,PED)是由豬流行性腹瀉病毒(Porcine epidemic di-ahorrea virus,PEDV)引起的豬的一種高度接觸性腸道傳染病[1],該病目前不僅成為危害我國養(yǎng)豬業(yè)的重要疾病之一,而且對全世界的養(yǎng)豬業(yè)都危害極大,給養(yǎng)豬業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟損失。自1976

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1 姜成剛;劉荻，

本文編號：937580