發(fā)布時(shí)間：2017-09-28 19:12

  本文關(guān)鍵詞：豬流行性腹瀉病毒感染PK-15細(xì)胞miRNA的差異表達(dá)分析

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【摘要】：為研究豬流行性腹瀉病毒(Porcine epidemic diahorrea virus,PEDV)對(duì)豬腎傳代細(xì)胞PK-15miRNA表達(dá)譜的影響,將PEDV感染PK-15細(xì)胞后,提取總RNA,進(jìn)行高通量測(cè)序,構(gòu)建感染與未感染PEDV的PK-15細(xì)胞的miRNA表達(dá)譜,并進(jìn)行差異性分析,對(duì)表達(dá)差異顯著的miRNA進(jìn)行heatmap聚類分析及GO(Gene ontology,GO)分子功能(Molecular function,MF)分析,選取10個(gè)顯著性差異表達(dá)的miRNA通過RT-qPCR進(jìn)行了驗(yàn)證。結(jié)果發(fā)現(xiàn),顯著性差異表達(dá)的miRNA有214個(gè),其中175個(gè)miRNA表達(dá)上調(diào),39個(gè)miRNA表達(dá)下調(diào)。Heatmap聚類分析表明,病毒組絕大部分差異表達(dá)的miRNA較對(duì)照組表達(dá)量上調(diào),少部分下調(diào)。GO分析表明,miRNA廣泛參與結(jié)合、蛋白結(jié)合、蛋白激酶活性、轉(zhuǎn)移酶活性、含磷基團(tuán)轉(zhuǎn)移、磷酸轉(zhuǎn)移酶活性等生物作用。RT-qPCR驗(yàn)證的各miRNA的表達(dá)趨勢(shì)與高通量測(cè)序結(jié)果一致。結(jié)果表明,豬流行性腹瀉病毒感染對(duì)PK-15細(xì)胞編碼的miRNA表達(dá)水平有顯著影響,從而對(duì)進(jìn)一步研究治療PEDV的miRNA制劑提供新思路。
【作者單位】： 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物生物技術(shù)中心;四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物疫病與人類健康四川省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 豬流行性腹瀉病毒 miRNA表達(dá)譜 PK-細(xì)胞
【基金】：教育部長(zhǎng)江學(xué)者和創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)發(fā)展計(jì)劃(編號(hào):IRT13083);教育部新世紀(jì)優(yōu)秀人才支持計(jì)劃(編號(hào):NCET11-1059)
【分類號(hào)】：S852.651
【正文快照】： 豬流行性腹瀉(Porcine epidemic diahorrea,PED)是由豬流行性腹瀉病毒(Porcine epidemic di-ahorrea virus,PEDV)引起的豬的一種高度接觸性腸道傳染病[1],該病目前不僅成為危害我國養(yǎng)豬業(yè)的重要疾病之一,而且對(duì)全世界的養(yǎng)豬業(yè)都危害極大,給養(yǎng)豬業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。自1976

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本文編號(hào)：937580