母豬殺嬰行為的全基因組關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時(shí)間:2017-09-07 07:06
本文關(guān)鍵詞:母豬殺嬰行為的全基因組關(guān)聯(lián)分析
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【摘要】:本研究測(cè)定了288頭來(lái)自白色杜洛克×二花臉F2群體的母豬殺嬰行為表型,旨在定位出影響母豬殺嬰行為的QTL;谡麄(gè)家系及已經(jīng)掃描個(gè)體的60KSNP芯片信息推測(cè)出本試驗(yàn)288頭個(gè)體60K的基因型。隨后,我們利用R語(yǔ)言GenABEL軟件包的廣義混合線性模型對(duì)母豬殺嬰行為表型進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析,定位影響母豬殺嬰行為的顯著關(guān)聯(lián)SNP位點(diǎn)。結(jié)果,在SSC2和SSC8上共發(fā)現(xiàn)50個(gè)與母豬殺嬰顯著關(guān)聯(lián)的SNPs位點(diǎn),其中有21個(gè)SNPs位于SSC8:35.05~47.54 Mb區(qū)域達(dá)到基因組顯著水平,在SSC2上只有1個(gè)SNP位點(diǎn)達(dá)到染色體顯著水平。通過(guò)搜尋顯著相關(guān)SNP所在區(qū)域內(nèi)的注釋基因,發(fā)現(xiàn)了12個(gè)可能影響母豬殺嬰行為的重要位置候選基因。該研究為進(jìn)一步鑒別影響母豬殺嬰行為的主效基因和因果突變位點(diǎn)提供了研究基礎(chǔ)。
【作者單位】: 省部共建豬遺傳改良與養(yǎng)殖技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】: 豬 全基因組關(guān)聯(lián)分析 母豬殺嬰 候選基因
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(30760164) 江西省自然科學(xué)基金(2008GQN0031)
【分類號(hào)】:S828
【正文快照】: 母豬母性性能的好壞是影響?zhàn)B豬業(yè)經(jīng)濟(jì)效益的重要因素。母豬殺嬰行為即母豬在分娩期間或產(chǎn)后24h之內(nèi)咬傷甚至咬死新生仔豬的行為,給養(yǎng)豬業(yè)造成巨大經(jīng)濟(jì)損失。M.J.Harris等[1]通過(guò)對(duì)大規(guī)模的商業(yè)母豬群體調(diào)查發(fā)現(xiàn)約5.3%的初產(chǎn)母豬表現(xiàn)出不同程度的殺嬰行為。在歐洲商業(yè)群體中調(diào),
本文編號(hào):808096
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