本文關(guān)鍵詞：基于高通量測(cè)定肉雞回腸微生物多樣性及PICRUSt基因預(yù)測(cè)分析

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【摘要】：本試驗(yàn)旨在研究健康肉雞回腸的微生物群落結(jié)構(gòu)及功能。采用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)15只雞的回腸內(nèi)容物進(jìn)行測(cè)序,按照97%的相似度歸類(lèi)操作分類(lèi)單元(OTUs),去除序列數(shù)量少的OTUs(n2),然后進(jìn)行生物信息學(xué)分析及PICRUSt基因預(yù)測(cè)。結(jié)果表明:1)共獲得424 062條tags,并歸類(lèi)于1 002個(gè)非單OTUs,樣品平均tags為(28 271±8 855)條,平均OTUs為(261±82)個(gè)。2)所有樣品共含有20個(gè)菌門(mén),160個(gè)菌屬。其中,共享核心菌門(mén)4個(gè),分別是厚壁菌門(mén)(85.35%)、變形菌門(mén)(6.09%)、藍(lán)細(xì)菌門(mén)(2.15%)和放線(xiàn)菌門(mén)(0.16%);共享核心菌屬19個(gè),占樣品微生物總量的93.75%。3)雞回腸樣品預(yù)測(cè)得出328個(gè)功能。從前20個(gè)功能熱圖可知,各樣品的效能存在差異。由此可見(jiàn),雞回腸微生物群落復(fù)雜,但主要菌群相對(duì)穩(wěn)定。本試驗(yàn)為進(jìn)一步研究雞回腸微生物群落結(jié)構(gòu)與功能提供了參考依據(jù)。
【作者單位】： 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院動(dòng)物微生態(tài)研究中心;
【關(guān)鍵詞】： 肉雞 回腸 高通量測(cè)序 核心菌群 PICRUSt
【基金】：四川省科技廳國(guó)際合作項(xiàng)目(2013HH0055)
【分類(lèi)號(hào)】：S831
【正文快照】： 雞的腸道是一個(gè)巨大的生態(tài)系統(tǒng),腸道微生物對(duì)雞的營(yíng)養(yǎng)、免疫等功能有著重要的影響。雞腸道的不同部位具有不同的作用,其中回腸是營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)吸收的關(guān)鍵部位,且微生物多樣性較高被人們廣泛關(guān)注[1]。雞腸道微生物多樣性的研究方法有很多,早期主要采用傳統(tǒng)培養(yǎng)的方法[2],但腸道中厭，

本文編號(hào)：643716