基因VI型中不同亞型新城疫病毒的生物學(xué)特性測定及遺傳進(jìn)化分析
發(fā)布時間:2017-07-30 00:06
本文關(guān)鍵詞:基因VI型中不同亞型新城疫病毒的生物學(xué)特性測定及遺傳進(jìn)化分析
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【摘要】:新城疫病毒(Newcastle disease virus, NDV)又稱禽副粘病毒1型(Avianparamyxovirus-1,APMV-1),是副粘病毒科、禽腮腺炎病毒屬中的一員。根據(jù)毒力的不同,NDV可被分為高致病性、中等毒力和低致病性毒株。盡管NDV只有一個血清型,但卻存在多個基因型;颌鲂涂杀贿M(jìn)一步分為9個亞型(VIa-VIi),其中,Ⅵb亞型毒株為鴿源分離株,對鴿具有宿主特異性;而Ⅵa和VIc-VIi亞型主要為雞源毒株。本研究對臨床分離到的6株基因Ⅵ型NDV的生物學(xué)特性進(jìn)行了測定,并從中選取4株不同亞型的NDV進(jìn)行SPF雞的致病性試驗。結(jié)果表明:雞源毒株對雞呈現(xiàn)出高致病性;鴿源毒株雖為中強(qiáng)毒,但對雞僅表現(xiàn)為低致病性。此外,我們選取40株宿主來源明確的基因Ⅵ型NDV進(jìn)行了遺傳進(jìn)化和全基因組序列的比對分析,進(jìn)一步比較了鴿源和雞源基因Ⅵ型毒株在分子水平上的差異,為防控基因Ⅵ型NDV提供理論支持。1、基因Ⅵ型不同亞型新城疫病毒生物學(xué)特性測定6株基因Ⅵ型NDV生物學(xué)特性測定結(jié)果顯示:5株雞源毒株的MDT均小于60h,ICPI均大于1.7,與其它雞源毒株相比,Kuwait株的毒力相對較低;鴿源毒株JS/07/04/Pi的MDT、ICPI和IVPI分別為88 h、1.2和0.89,屬于中等毒力毒株。選取Kuwait (Ⅵa亞型)、JX-1/94 (Ⅵf亞型)、ZhJ3 (VIg亞型)和JS/07/04/Pi (Ⅵb亞型)進(jìn)行30日齡SPF雞的攻毒試驗。Kuwait、JX-1/94和ZhJ3感染組雞表現(xiàn)出典型的新城疫癥狀,病程急促,發(fā)病率和死亡率為100%;各組織臟器的組織損傷及病理變化明顯,以脾臟、胸腺和法氏囊壞死為特征;喉頭和泄殖腔病毒檢出率高,感染后第5天可達(dá)100%。但與ZhJ3和JX-1/94相比,Kuwait株感染組雞的病程較長。鴿源毒株JS/07/04 /Pi感染雞后幾乎不引起任何臨床癥狀及組織損傷。本研究表明,基因Ⅵ型NDV中,除鴿源Ⅵb亞型毒株外,其它亞型毒株對雞均表現(xiàn)為高致病性,但與其它雞源毒株相比,早期的Ⅵa亞型毒株對雞的致病性偏弱。2、基因Ⅵ型新城疫病毒的遺傳進(jìn)化分析根據(jù)F基因47~420位核苷酸序列對30株已知宿主來源和分離時間的基因Ⅵ型NDV進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析。結(jié)果表明,1980s及之前基因Ⅵ型分離株的遺傳關(guān)系較近,它們之間的核苷酸與氨基酸序列的同源性分別為92.5~100%和92.7~100%。同時,鴿源和雞源Ⅵ型毒株均與60年代Ⅵa亞型分離株的遺傳距離較近,氨基酸序列同源性分別為95.2~98.4%和96.0~96.8%,表明80年代分離到的Ⅵ型毒株均由該亞型進(jìn)化而來;而上世紀(jì)80年代之后分離的病毒與Ⅵa亞型之間的遺傳距離越來越遠(yuǎn)。因此,1980s分離到的基因Ⅵ型NDV均由Ⅵa亞型進(jìn)化而來,隨著時間的推移病毒在進(jìn)化過程中出現(xiàn)了多個基因亞型。對40株基因Ⅵ型NDV的全基因序列進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析結(jié)果與上述基本一致。根據(jù)全基因序列與各基因編碼區(qū)序列分別繪制的遺傳進(jìn)化樹保持一致,說明基因Ⅵ型NDV的遺傳進(jìn)化是在基因組水平上整體進(jìn)行的。此外,為了進(jìn)一步比較鴿源與雞源毒株在分子水平上的差異,我們對40株基因Ⅵ型NDV的核苷酸及各基因編碼的氨基酸置換情況進(jìn)行了統(tǒng)計分析,與雞源基因Ⅵ型NDV相比,鴿源毒株前導(dǎo)序列的第32位核苷酸由A變?yōu)镚,且鴿源毒株在6個結(jié)構(gòu)蛋白上均出現(xiàn)了特征性氨基酸位點的變化。
【關(guān)鍵詞】:新城疫病毒 基因Ⅵ型 雞 鴿 致病性 遺傳進(jìn)化分析
【學(xué)位授予單位】:揚州大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:S852.65
【目錄】:
- 摘要3-5
- Abstract5-9
- 符號說明9-11
- 綜述11-25
- 1. 新城疫病毒概述11-17
- 1.1 新城疫病毒的基因組構(gòu)成11-12
- 1.2 新城疫病毒的感染與復(fù)制12
- 1.3 新城疫病毒的致病性12-13
- 1.4 新城疫病毒相關(guān)蛋白的分子生物學(xué)研究13-17
- 2. 新城疫病毒的流行17-18
- 3. 新城疫病毒的演化18-20
- 3.1 影響新城疫病毒變異的因素18
- 3.2 新城疫病毒基因組的演化18-19
- 3.3 新城疫病毒毒力及抗原性的演化19
- 3.4 新城疫病毒宿主范圍的擴(kuò)大19-20
- 參考文獻(xiàn)20-25
- 第一章 基因Ⅵ型新城疫病毒的生物學(xué)特性測定25-41
- 1. 材料25-26
- 1.1 毒株、雞胚及細(xì)胞25-26
- 1.2 實驗動物26
- 1.3 主要儀器及試劑26
- 2. 方法26-29
- 2.1 NDV的擴(kuò)增26
- 2.2 病毒生物學(xué)特性測定26-28
- 2.3 致病性試驗28-29
- 3. 結(jié)果29-37
- 3.1 熱穩(wěn)定試驗29
- 3.2 病毒的生物學(xué)特性29-30
- 3.3 神經(jīng)氨酸酶活性試驗30
- 3.4 病毒在細(xì)胞上的復(fù)制能力30-31
- 3.5 病毒感染后的臨床癥狀31-32
- 3.6 病毒感染后的病理剖檢變化32-33
- 3.7 組織病理學(xué)變化33-35
- 3.8 攻毒后不同時間的排毒率35
- 3.9 病毒載量的變化35-37
- 4. 討論37-39
- 參考文獻(xiàn)39-41
- 第二章 基因Ⅵ型新城疫病毒的遺傳進(jìn)化分析41-61
- 1. 材料41-42
- 1.1 毒株和雞胚41
- 1.2 主要試劑及儀器41-42
- 1.3 分子生物學(xué)軟件42
- 2. 方法42-47
- 2.1 基于F基因的遺傳進(jìn)化分析42-43
- 2.2 兩株雞源基因Ⅵ型NDV全基因組序列的測定43-46
- 2.3 全基因組序列比對分析46-47
- 3. 結(jié)果47-57
- 3.1 基于F基因的遺傳進(jìn)化分析47-51
- 3.2 全基因組序列分析51-57
- 4. 討論57-59
- 參考文獻(xiàn)59-61
- 全文小結(jié)61-62
- 致謝62-63
【參考文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前4條
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,本文編號:591648
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