發(fā)布時間：2017-07-08 13:01

  本文關(guān)鍵詞：貴州白山羊L-FABP和H-FABP基因表達(dá)、多態(tài)性與生長性狀的遺傳效應(yīng)研究

  更多相關(guān)文章： 貴州白山羊 L-FABP基因 H-FABP基因 生長性狀 實時熒光定量PCR

【摘要】：為研究貴州白山羊L-FABP和H-FABP基因表達(dá)及多態(tài)性與生長性狀的關(guān)聯(lián)性,以期得到能夠影響貴州白山羊各群體生長性狀顯著效應(yīng)的分子遺傳標(biāo)記。本試驗利用DNA混合池、PCR產(chǎn)物直接測序和PCR-SSCP技術(shù)方法檢測L-FABP和H-FABP基因單核苷酸多態(tài)性,利用SPSS 18.0軟件中一般線性模型對不同基因型與生長性狀指標(biāo)進(jìn)行相關(guān)性分析;同時利用在線軟件對L-FABP和H-FABP基因RNA結(jié)構(gòu)和蛋白各級結(jié)構(gòu)進(jìn)行生物信息學(xué)分析,利用實時熒光定量PCR法分析貴州白山羊L-FABP和H-FABP基因在不同組織中mRNA表達(dá)規(guī)律。研究結(jié)果如下:1.多態(tài)位點檢測結(jié)果表明,貴州白山羊L-FABP基因內(nèi)含子2處存在C4557T和A4575G兩個突變位點,H-FABP基因外顯子3和外顯子5處存在G4713C和C8228T兩個同義突變位點。2.遺傳效應(yīng)分析結(jié)果表明,L-FABP基因C4557T和A4575位點多態(tài)座位有利于提高貴州白山羊體重、體高、體斜長和管圍,其中CCGG有利于提高貴州白山羊成年母羊的體高和體斜長;TTGG有利于提高貴州白山羊周歲母羊的體重和管圍。H-FABP基因C8228T位點基因型CC有利于提高周歲羊全群部分生長性狀指標(biāo)。3.生物信息學(xué)表明,山羊H-FABP基因兩個突變位點可使RNA二級結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,對蛋白質(zhì)的各級結(jié)構(gòu)均無影響,且兩蛋白理化性質(zhì)均穩(wěn)定,且含有的氨基酸殘基大多數(shù)都是親水性的不含跨膜結(jié)構(gòu)域和信號肽,也不屬于膜蛋白或分泌蛋白,被定位于真核生物細(xì)胞質(zhì)中。4.qRT-PCR檢測結(jié)果表明,在成年貴州白山羊9個組織中,L-FABP基因在肝和十二指腸表達(dá)量較高,心和股二頭肌表達(dá)量最低;H-FABP基因在心和股二頭肌表達(dá)較高,肝表達(dá)量最低,兩基因之間可能存在拮抗作用。
【關(guān)鍵詞】：貴州白山羊 L-FABP基因 H-FABP基因 生長性狀 實時熒光定量PCR
【學(xué)位授予單位】：貴州大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S827
【目錄】：

• 摘要9-10
• Abstract10-12
• 第一章 文獻(xiàn)綜述12-27
• 1.1 前言12-13
• 1.2 貴州白山羊品種介紹13-14
• 1.3 PPAR信號通路14-16
• 1.4 FABP發(fā)現(xiàn)與命名16
• 1.5 L-FABP候選基因研究概述16-21
• 1.5.1 L-FABP基因結(jié)構(gòu)與功能16-18
• 1.5.2 L-FABP與疾病研究18-20
• 1.5.3 L-FABP基因與畜禽生長研究20-21
• 1.6 H-FABP候選基因研究概述21-26
• 1.6.1H-FABP基因結(jié)構(gòu)與功能21-22
• 1.6.2 H-FABP與疾病研究22-24
• 1.6.3 H-FABP基因與畜禽生長研究24-26
• 1.7 研究目的及意義26-27
• 第二章 貴州白山羊L-FABP和H-FABP基因多態(tài)性及其與生長性狀遺傳效應(yīng)研究27-62
• 2.1 試驗材料27-30
• 2.1.1 試驗樣本27
• 2.1.2 試驗主要儀器27-28
• 2.1.3 試驗主要試劑及溶液28-30
• 2.2 試驗方法30-38
• 2.2.1 貴州白山羊生長性狀指標(biāo)測定30
• 2.2.2 試驗羊血液基因組DNA的提取及檢測30-31
• 2.2.3 PCR反應(yīng)31-34
• 2.2.4 SNPs篩選及驗證34-36
• 2.2.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析36-38
• 2.3 結(jié)果與分析38-57
• 2.3.1 基因組DNA提取結(jié)果38-39
• 2.3.2 PCR擴(kuò)增結(jié)果39-41
• 2.3.3 DNA池PCR產(chǎn)物測序結(jié)果41-42
• 2.3.4 PCR-SSCP檢測多態(tài)性42-44
• 2.3.5 SNPs位點測序驗證44-47
• 2.3.6 SNPs位點群體遺傳結(jié)構(gòu)分析47-51
• 2.3.7 試驗群體生長性狀遺傳效應(yīng)分析51-57
• 2.4 討論57-61
• 2.4.1 L-FABP和H-FABP基因多態(tài)性檢測及其多態(tài)性技術(shù)探討57-59
• 2.4.2 L-FABP和H-FABP基因在山羊群體中的遺傳結(jié)構(gòu)分析59-60
• 2.4.3 L-FABP和H-FABP基因多態(tài)性與山羊生長性狀遺傳效應(yīng)分析60-61
• 2.5 小結(jié)61-62
• 第三章 山羊L-FABP和H-FABP基因生物信息學(xué)分析62-83
• 3.1 材料與方法62-64
• 3.1.1 材料62
• 3.1.2 山羊L-FABP和H-FABP蛋白一級序列分析62-63
• 3.1.3 山羊L-FABP和H-FABP基因RNA二級結(jié)構(gòu)分析63
• 3.1.4 山羊L-FABP和H-FABP蛋白二級結(jié)構(gòu)分析63-64
• 3.1.5 山羊L-FABP和H-FABP蛋白三級結(jié)構(gòu)分析64
• 3.2 結(jié)果與分析64-80
• 3.2.1 山羊L-FABP和H-FABP蛋白一級序列分析64-70
• 3.2.2 山羊L-FABP和H-FABP基因RNA二級結(jié)構(gòu)分析70
• 3.2.3 山羊L-FABP和H-FABP蛋白二級結(jié)構(gòu)分析70-79
• 3.2.4 山羊L-FABP和H-FABP蛋白三級結(jié)構(gòu)分析79-80
• 3.3 討論80-82
• 3.3.1 山羊L-FABP和H-FABP蛋白一級結(jié)構(gòu)分析80-81
• 3.3.2 山羊L-FABP和H-FABP基因RNA二級結(jié)構(gòu)分析81
• 3.3.3 山羊L-FABP和H-FABP蛋白二級和三級結(jié)構(gòu)分析81-82
• 3.4 小結(jié)82-83
• 第四章 貴州白山羊L-FABP和H-FABP基因表達(dá)調(diào)控分析83-93
• 4.1 材料與方法83-84
• 4.1.1 試驗樣品83
• 4.1.2 試驗主要儀器83-84
• 4.1.3 試驗主要試劑84
• 4.2 試驗方法84-86
• 4.2.1 總RNA提取84-85
• 4.2.2 總RNA的檢測及反轉(zhuǎn)錄85
• 4.2.3 引物設(shè)計85-86
• 4.2.4 Real-time PCR反應(yīng)86
• 4.2.5 數(shù)據(jù)分析86
• 4.3 試驗結(jié)果與分析86-90
• 4.3.1 總RNA的提取及完整性檢測86-87
• 4.3.2 PCR擴(kuò)增結(jié)果87-88
• 4.3.3 Real-time PCR擴(kuò)增曲線和熔解曲線88-89
• 4.3.4 L-FABP和H-FABP基因在貴州白山羊不同組織中表達(dá)規(guī)律89-90
• 4.4 討論90-92
• 4.4.1 L-FABP和H-FABP基因在貴州白山羊不同組織中表達(dá)分析90-91
• 4.4.2 Quantitative Real-time PCR實驗總結(jié)91-92
• 4.5 小結(jié)92-93
• 第五章 結(jié)論93-95
• 5.1 主要結(jié)論93
• 5.2 研究創(chuàng)新點93
• 5.3 進(jìn)一步需要開展的工作93-95
• 參考文獻(xiàn)95-104
• 致謝104-106
• 附錄106-109

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本文編號：534617