本文關鍵詞：利用Illumina MiSeq測序平臺分析肉雞盲腸微生物多樣性，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：為對肉雞盲腸微生物的多樣性進行探索,選取15只飼養(yǎng)在相同條件下的科寶-500肉雞,利用Illumina MiSeq測序平臺與Qiime等16srRNA序列分析工具在22日齡時采集盲腸內(nèi)容物進行研究。結(jié)果顯示:1)測序共獲得359 158條有效序列與3 210個OTU,并且由稀釋曲線可以證明此次測序結(jié)果比較全面的覆蓋了肉雞盲腸微生物群落。2)各樣品菌群之間存在差異,得到序列的數(shù)量以及菌群多樣性差別較大。3)通過核心菌群分析可知,4個共享菌群在門水平上分別為:擬桿菌門Bacteroidetes(70.0%±12.1%)、厚壁菌門Firmicutes(25.4%±11.2%)、變形菌門Proteobacteria(4.3%±3.7%)和藍菌門Cyanobacteria(0.3%±0.5%)。4)有益菌群如乳酸桿菌屬Lactobacillus、雙歧桿菌屬Bifidobacterium雖然存在于盲腸微生物中,但相對豐度不高。5)PICRUSt分析盲腸菌群對應的基因功能發(fā)現(xiàn):功能轉(zhuǎn)運、嘌呤代謝、DNA修復重組蛋白、氧化磷酸化和甲烷代謝等基因功能豐度最高。由此可見,個體差異雖然對肉雞盲腸微生物結(jié)構(gòu)影響較大,但是仍然存在不少共性。
【作者單位】： 四川農(nóng)業(yè)大學動物醫(yī)學院/動物微生態(tài)研究中心/動物疫病與人類健康四川省重點實驗室;
【關鍵詞】： 肉雞 盲腸 微生物 核心菌群 Illumina MiSeq測序 PICRUSt分析
【基金】：四川省科技廳國際合作項目(2013HH0055)
【分類號】：S831
【正文快照】： 肉雞作為一類重要的經(jīng)濟動物,其生產(chǎn)性能和健康程度與腸道內(nèi)復雜的微生物結(jié)構(gòu)緊密相關。作為肉雞腸道微生物最富集的腸段,盲腸微生態(tài)系統(tǒng)受到了廣泛的關注。在之前的研究中,許多方法例如厭氧培養(yǎng)法[1]、末端限制性片段長度多樣性分析(T-RFLP)[2]、變性梯度凝膠電泳PCR(PCR-DGG

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  本文關鍵詞：利用Illumina MiSeq測序平臺分析肉雞盲腸微生物多樣性，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號：510566