梅花鹿致敏與休眠鹿茸干細胞差異蛋白表達的2D-DIGE分析
發(fā)布時間:2017-07-01 23:14
本文關鍵詞:梅花鹿致敏與休眠鹿茸干細胞差異蛋白表達的2D-DIGE分析,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:旨在對梅花鹿(Cervus nippon)致敏鹿茸干細胞與休眠鹿茸干細胞表達蛋白進行差異篩選、鑒定及生物信息分析,為深入探討鹿茸獨特的再生分子調節(jié)機制奠定基礎。本研究采用雙向熒光差異凝膠電泳(Two-dimensional fluorescence difference in gel electrophoresis,2D-DIGE)分離蛋白樣品;利用DeCyder 7.2分析軟件對2D-DIGE圖像進行統計學分析尋找差異表達蛋白;利用MALDI-TOF-MS(Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight tandem mass spectrometry)鑒定差異蛋白,通過Mascot軟件搜索NCBInr數據庫尋找匹配的蛋白;采用PANTHER(Protein Analysis Through Evolutionary Relationships)軟件對差異蛋白進行聚類分析,REACTOME數據庫分析差異蛋白所參與的信號通路。結果得到了致敏鹿茸干細胞與休眠鹿茸干細胞2D-DIGE圖譜,致敏鹿茸干細胞與休眠鹿茸干細胞蛋白豐度相比較,比值≥1.1倍以及比值≤-1.1倍(P0.05)的差異蛋白點有159個,其中110個上調表達,49個下調表達,EDA(Extended data analysis)分析得到了多個Marker蛋白,質譜鑒定了84個差異蛋白質點,48個為陽性結果,共來自27種蛋白質。并對已鑒定蛋白進行了GO分析以及信號通路富集分析。致敏鹿茸干細胞與休眠鹿茸干細胞蛋白差異明顯,質譜鑒定獲得了來自多種可能與鹿茸再生相關的差異蛋白。由此可知,鹿茸再生是鹿茸干細胞從休眠到致敏的轉化過程,需要多種蛋白分子以及信號通路的綜合調控。
【作者單位】: 中國農業(yè)科學院特產研究所特種動物分子生物學國家重點實驗室;
【關鍵詞】: 鹿茸干細胞 再生 蛋白質組學 D-DIGE
【基金】:國家高技術研究發(fā)展計劃(863)項目(2011AA100603) 國家自然科學基金項目(31170950) 吉林省重點科技攻關項目(20150204071NY) 吉林省自然科學基金項目(20140101139JC)
【分類號】:S825
【正文快照】: 近年來,再生生物學尤其是割處再生(Epimor-phic regeneration)是生命科學研究的重點領域,鹿茸是迄今為止所發(fā)現的唯一一個可以割處完全再生的哺乳動物附屬器官。以鹿茸為模型深入研究其獨特再生分子調節(jié)機制對于揭開哺乳動物器官再生之謎具有重要意義[1]。鹿茸是以年為周期而
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本文編號:507843
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