梅花鹿致敏與休眠鹿茸干細(xì)胞差異蛋白表達(dá)的2D-DIGE分析
發(fā)布時(shí)間:2017-07-01 23:14
本文關(guān)鍵詞:梅花鹿致敏與休眠鹿茸干細(xì)胞差異蛋白表達(dá)的2D-DIGE分析,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:旨在對(duì)梅花鹿(Cervus nippon)致敏鹿茸干細(xì)胞與休眠鹿茸干細(xì)胞表達(dá)蛋白進(jìn)行差異篩選、鑒定及生物信息分析,為深入探討鹿茸獨(dú)特的再生分子調(diào)節(jié)機(jī)制奠定基礎(chǔ)。本研究采用雙向熒光差異凝膠電泳(Two-dimensional fluorescence difference in gel electrophoresis,2D-DIGE)分離蛋白樣品;利用DeCyder 7.2分析軟件對(duì)2D-DIGE圖像進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析尋找差異表達(dá)蛋白;利用MALDI-TOF-MS(Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight tandem mass spectrometry)鑒定差異蛋白,通過Mascot軟件搜索NCBInr數(shù)據(jù)庫尋找匹配的蛋白;采用PANTHER(Protein Analysis Through Evolutionary Relationships)軟件對(duì)差異蛋白進(jìn)行聚類分析,REACTOME數(shù)據(jù)庫分析差異蛋白所參與的信號(hào)通路。結(jié)果得到了致敏鹿茸干細(xì)胞與休眠鹿茸干細(xì)胞2D-DIGE圖譜,致敏鹿茸干細(xì)胞與休眠鹿茸干細(xì)胞蛋白豐度相比較,比值≥1.1倍以及比值≤-1.1倍(P0.05)的差異蛋白點(diǎn)有159個(gè),其中110個(gè)上調(diào)表達(dá),49個(gè)下調(diào)表達(dá),EDA(Extended data analysis)分析得到了多個(gè)Marker蛋白,質(zhì)譜鑒定了84個(gè)差異蛋白質(zhì)點(diǎn),48個(gè)為陽性結(jié)果,共來自27種蛋白質(zhì)。并對(duì)已鑒定蛋白進(jìn)行了GO分析以及信號(hào)通路富集分析。致敏鹿茸干細(xì)胞與休眠鹿茸干細(xì)胞蛋白差異明顯,質(zhì)譜鑒定獲得了來自多種可能與鹿茸再生相關(guān)的差異蛋白。由此可知,鹿茸再生是鹿茸干細(xì)胞從休眠到致敏的轉(zhuǎn)化過程,需要多種蛋白分子以及信號(hào)通路的綜合調(diào)控。
【作者單位】: 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院特產(chǎn)研究所特種動(dòng)物分子生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】: 鹿茸干細(xì)胞 再生 蛋白質(zhì)組學(xué) D-DIGE
【基金】:國(guó)家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(863)項(xiàng)目(2011AA100603) 國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31170950) 吉林省重點(diǎn)科技攻關(guān)項(xiàng)目(20150204071NY) 吉林省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(20140101139JC)
【分類號(hào)】:S825
【正文快照】: 近年來,再生生物學(xué)尤其是割處再生(Epimor-phic regeneration)是生命科學(xué)研究的重點(diǎn)領(lǐng)域,鹿茸是迄今為止所發(fā)現(xiàn)的唯一一個(gè)可以割處完全再生的哺乳動(dòng)物附屬器官。以鹿茸為模型深入研究其獨(dú)特再生分子調(diào)節(jié)機(jī)制對(duì)于揭開哺乳動(dòng)物器官再生之謎具有重要意義[1]。鹿茸是以年為周期而
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本文編號(hào):507843
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