本文關(guān)鍵詞：云南大額牛瘤胃微生物多樣性分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：為研究云南大額牛瘤胃微生物多樣性,本研究通過(guò)對(duì)大額牛瘤胃微生物宏基因組測(cè)序(總數(shù)據(jù)產(chǎn)出3Gb)、分析、組裝,共獲得13 546 196個(gè)環(huán)境基因標(biāo)簽(EGTs)。在微生物分析時(shí)隨機(jī)選用了10 387 566個(gè)EGTs(占總EGTs的76.68%)與NCBI的NR數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行BLAST比對(duì),進(jìn)行物種注釋。結(jié)果顯示,在分析的EGTs中,主要由細(xì)菌域、真核生物域、古生菌域及部分不能確定域歸屬的未知微生物構(gòu)成,其中微生物主要屬于10個(gè)門,94%的EGTs屬于擬桿菌門、厚壁菌門、變形桿菌門和放線菌門,擬桿菌門和厚壁菌門豐度最高,分別占總細(xì)菌的48%和42%。大額牛瘤胃中主要的纖維降解細(xì)菌為黃化瘤胃球菌、溶纖維丁酸弧菌、白色瘤胃球菌和產(chǎn)琥珀酸絲狀桿菌,分別占總細(xì)菌的1.60%、1.20%、0.86%和0.52%。本研究結(jié)果表明EGTs技術(shù)可用于分析環(huán)境微生物群落結(jié)構(gòu)和解釋微生物群落功能,對(duì)研究特殊環(huán)境中的微生物的構(gòu)成具有重要意義。
【作者單位】： 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)與飼料科學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 云南大額牛 宏基因組測(cè)序 環(huán)境基因標(biāo)簽 微生物群落
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(31160467、31360562、31160449、31260543)
【分類號(hào)】：S823
【正文快照】： 宏基因組測(cè)序分析技術(shù)已被證明是一種快速有效的分析環(huán)境微生物群落的方法,目前研究者已經(jīng)成功研究了污水、植物、人類唾液及動(dòng)物胃腸道等多種環(huán)境中的微生物的多樣性[1-3]。宏基因組學(xué)結(jié)合高通量測(cè)序技術(shù)不僅避開(kāi)了很多微生物不可培養(yǎng)的難題[4],可從基因?qū)用鎭?lái)對(duì)整個(gè)微生物群

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

1 李碧鳳;朱雅新;茍瀟;冷靜;毛華明;李清;馮勵(lì);楊舒黎;;云南大額牛瘤胃宏基因組Fosmid文庫(kù)的構(gòu)建與分析[J];中國(guó)畜牧獸醫(yī);2013年12期

2 毛華明,鄧衛(wèi)東,文際坤;大額牛的生物學(xué)特征及研究開(kāi)發(fā)利用潛力[J];云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2005年02期

【共引文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 周熊艷;王松明;顧招兵;吳錫川;冷靜;毛華明;李清;馮勵(lì);楊舒黎;;云南大額牛瘤胃微生物多樣性分析[J];中國(guó)畜牧獸醫(yī);2016年05期

2 丁小維;田文婷;張波;楊枝;趙瑩;朱京頡;涂敏;;鹽湖微生物Fosmid文庫(kù)纖維素酶克隆的篩選及產(chǎn)酶研究[J];陜西理工學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2016年01期

3 王U，

本文編號(hào)：499649