本文關鍵詞：牛脂肪細胞分泌因子五個基因遺傳特征分析，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：在黃牛育種中,一個重要的目標就是生長和肉質性狀的提高。脂肪細胞分泌因子(Adipocytokines)是一類與脂類、糖類和能量代謝密切相關的活性因子,參與動物生長發(fā)育和脂肪沉積。因此,本研究選擇其中5個關鍵成員Leptin, Adiponectin, Resistin, TNF-a和Angptl8作為候選基因,通過DNA池測序結合forced-PCR-RFLP技術,檢測5個基因在6個牛種共計537個個體中的SNPs,分析其與牛生長性狀的相關性；同時運用qRT-PCR方法檢測發(fā)生遺傳變異的三個基因Leptin、TNF-a和Angptl8在棗北黃牛10種組織中的mRNA表達情況。以上研究旨在為我國黃牛生產性狀改良提供理論依據。主要結果如下：1.牛Leptin基因SNPs檢測及其與黃牛生長性狀的關聯分析本研究共檢測到牛Leptin基因(AC_000161.1)2個SNPs,分別為g.12254(T/C)和g.14177(C/T)。g.12254(T/C)導致Leptin蛋白第25位Cys突變?yōu)锳rg，g.14177(C/T)導致第80位Ala突變?yōu)閂al。關聯分析結果顯示：在郟縣紅牛群體中,g.14177(C/T)位點CT基因型個體的坐骨端寬、十字部高顯著高于CC基因型個體(P0.05)。在南陽牛群體中,g.12254(T/C)位點CT基因型個體的初生重顯著高于TT基因型個體,體重(12月齡)顯著高于CC基因型個體(P0.05)；TT基因型個體的胸圍(24月齡)顯著高于CC基因型個體(P0.05)。在整個黃牛群體中,g.14177(C/T)位點CT基因型個體的胸圍、腰角寬、坐骨端寬、體重顯著高于CC基因型個體(P0.05),腹圍、重高比極顯著高于CC基因型個體(P0.01)。2.牛TNF-α基因SNPs檢測及其與黃牛生長性狀的關聯分析本研究檢測到牛TNF-α基因(AC 000180.1)1個SNP, g.2130(A/G),該位點位于第2外顯子區(qū),屬于同義突變。關聯分析結果顯示：在郟縣紅牛和整個黃牛群體中,g.2130(A/G)位點三種基因型個體在各生長性狀指標間差異不顯著。在南陽牛群體中,g.2130(A/G)位點GA基因型個體的胸圍(6、18、24月齡)、坐骨端寬(12月齡)、平均日增重(18月齡)和體重(24月齡)顯著高于GG基因型個體(P0.05);GA基因型個體的體重(6、18月齡)和平均日增重(6月齡)極顯著高于GG基因型個體(P0.01)。3.牛Angptl8基因SNPs檢測及其與黃牛生長性狀的關聯分析本研究共檢測到牛Angptl8基因(AC 000164.1)2個SNPs,分別為g.629(G/A)和g.884(T/C),位于基因的5'UTR。關聯分析結果顯示：在郟縣紅牛群體中,g.629(G/A)位點GG基因型個體的體高、腹圍顯著高于AA基因型個體(P0.05)。g.884(T/C)位點TT基因型個體的胸圍、腰角寬、十字部高顯著高于TC基因型個體(P0.05),腹圍極顯著高于TC基因型個體(P0.01)。在南陽牛群體中,g.884(T/C)位點TT基因型個體的體斜長(18、24月齡)顯著高于TC基因型個體(P0.05)。在整個黃牛群體中,g.629(G/A)位點GG基因型個體的腹圍顯著高于AA基因型個體(P0.05),GA基因型個體的腹圍極顯著高于AA基因型個體(P0.01)。g.884(T/C)位點TT基因型個體的胸圍、體重顯著高于TC基因型個體(P0.05),腹圍、重高比極顯著高于TC基因型個體(P0.01)。4.牛Leptin、TNF-α和Angptl8基因5個位點組合效應與黃牛生長性狀的關聯分析本研究對Leptin, TNF-α和Angptl8基因組合多態(tài)位點(組合基因型個數大于10,共發(fā)現8種組合型)與黃牛生長性狀的關聯分析結果顯示：5個位點組合基因型CCCCGAAATC個體的腹圍極顯著高于CCCCGAGATC基因型個體(P0.01)；基因型CCCCGAGATC個體的腹圍顯著高于CTCCGAAATC和CTCCGGAATC基因型個體(P0.05)。5.牛Leptin、TNF-α和4ngptl8基因的實時定量表達分析本研究以牛Leptin、TNF-α和Angptl8基因為研究對象,以24月齡成年棗北黃牛的10種不同組織樣為材料,采用qRT-PCR方法檢測三個候選基因在10種組織中的表達規(guī)律。研究結果表明：(1)Leptin基因在成年棗北牛的背部脂肪和內臟脂肪中表達量較高,在背最長肌中表達量次之,在心臟、瘤胃、腎臟中表達量較少,在肝臟、脾臟、肺臟和小腸中幾乎不表達；(2)TNF-α基因在成年棗北牛的脾臟、肺臟、小腸、肝臟中表達量較高,在腎臟、心臟、瘤胃、背最長肌中表達量較低,在背部脂肪和內臟脂肪中幾乎不表達；(3)Angptl8基因在成年棗北牛的背部脂肪和肝臟中高度表達,在內臟脂肪、肺、小腸中表達量次之,在心臟、背最長肌、腎臟、脾臟和瘤胃中均少量表達。
【關鍵詞】：牛 脂肪細胞分泌因子 SNPs 關聯分析 組織表達分析
【學位授予單位】：信陽師范學院
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：S823
【目錄】：

• 摘要6-8
• Abstract8-14
• 第1章 引言14-28
• 1.1 中國黃牛概況14-15
• 1.2 動物育種技術和策略在中國黃牛上的應用15-18
• 1.2.1 動物育種的目標15
• 1.2.2 數量性狀研究的兩種常用方法15-16
• 1.2.3 常用分子遺傳標記簡介16-18
• 1.3 實時熒光定量PCR技術18-19
• 1.3.1 SYBR Green Ⅰ染料法18-19
• 1.3.2 相對定量方法19
• 1.4 脂肪細胞分泌因子五個代表性基因的研究進展19-26
• 1.4.1 Leptin基因的研究進展20-21
• 1.4.2 Adiponectin基因的研究進展21-22
• 1.4.3 Resistin基因的研究進展22-23
• 1.4.4 TNF-α基因的研究進展23-24
• 1.4.5 Angptl8基因的研究進展24-25
• 1.4.6 脂肪細胞分泌因子5個成員的聯系和區(qū)別25-26
• 1.5 本研究的目的和意義26-28
• 第2章 牛5個基因遺傳變異及其與生長性狀的關聯分析28-69
• 2.1 材料28-29
• 2.1.1 試驗動物28-29
• 2.1.2 儀器設備與試劑29
• 2.2 試驗方法29-34
• 2.2.1 牛全血基因組DNA的提取29
• 2.2.2 核酸濃度和質量測定29-30
• 2.2.3 DNA池構建30
• 2.2.4 多態(tài)位點掃描引物設計30-32
• 2.2.5 引物稀釋及PCR擴增32
• 2.2.6 DNA池測序-多態(tài)位點檢測32
• 2.2.7 多態(tài)位點的生物信息學分析32-33
• 2.2.8 PCR-RFLP分析及測序驗證33-34
• 2.2.9 統計分析34
• 2.3 結果與分析34-65
• 2.3.1 牛5個候選基因DNA池擴增產物檢測34-35
• 2.3.2 牛5個候選基因SNPs篩查35-36
• 2.3.3 突變位點的分布和類型36-37
• 2.3.4 突變位點的生物信息學分析37-41
• 2.3.5 牛Leptin、TNF-α和Angptl8基因的SNPs分型結果41-46
• 2.3.6 牛Leptin、TNF-α和Angptl8基因多態(tài)位點的遺傳參數分析46-50
• 2.3.7 牛Leptin或Angptl8基因SNPs的連鎖不平衡和單倍型分析50-52
• 2.3.8 牛Leptin、TNF-α和Angptl8基因SNPs與生長性狀關聯分析52-65
• 2.4 討論65-69
• 2.4.1 牛Leptin、TNF-α和Angptl8基因的QTL分析65-67
• 2.4.2 牛Leptin、TNF-α和Angptl8基因SNPs分析67
• 2.4.3 牛Leptin、TNF-α和Angptl8基因SNPs群體遺傳結構分析67-68
• 2.4.4 牛Leptin、TNF-α和Angptl8基因對生長性狀的效應分析68-69
• 第3章 棗北牛Leptin、TNF-α和Angptl8 mRNA組織表達分析69-80
• 3.1 材料69
• 3.1.1 試驗動物及樣品69
• 3.1.2 儀器設備與試劑69
• 3.2 試驗方法69-73
• 3.2.1 試驗思路及路線圖69-70
• 3.2.2 RNA提取與質量檢測70
• 3.2.3 反轉錄RNA為cDNA70-71
• 3.2.4 熒光定量引物的設計與質量檢測71-72
• 3.2.5 熒光定量PCR反應體系及擴增條件72
• 3.2.6 統計分析72-73
• 3.3 結果與分析73-77
• 3.3.1 RNA質量及完整性檢測73
• 3.3.2 引物質量檢測73-74
• 3.3.3 實時定量PCR過程中的溶解曲線74-75
• 3.3.4 棗北牛三個候選基因的組織表達規(guī)律研究75-77
• 3.4 討論77-80
• 3.4.1 內參基因GAPDH和β-actin的選擇77-78
• 3.4.2 棗北黃牛的現狀及組織表達分析的意義78-80
• 第4章 結論80-82
• 致謝82-83
• 參考文獻83-93
• 攻讀學位期間獲得與學位論文相關的科研成果目錄93-94
• 附錄94-101

【相似文獻】

中國期刊全文數據庫 前10條

1 ;二齡(魚用)鰱雜交魚生長性狀的分析[J];湖南水產科技;1974年01期

2 劉永新;劉海金;;應用動物模型對牙鲆不同日齡生長性狀的遺傳分析[J];大連水產學院學報;2009年S1期

3 安慧;馬旭平;吳占福;吳淑琴;王學彬;;塞北兔生長性狀與屠宰性狀典型相關分析[J];中國養(yǎng)兔;2012年07期

4 劉永新;劉英杰;周勤;高磊;方輝;韓剛;王玉芬;姜秀鳳;劉海金;;牙鲆主要生長性狀與體質量的灰色關聯度分析[J];中國水產科學;2014年02期

5 丁艷;魯紹雄;連林生;;撒壩豬胰島素樣生長因子-Ⅰ基因多態(tài)性及其與部分生長性狀的關聯分析[J];中國畜牧獸醫(yī);2012年10期

6 孫小霞,蘇時萍,阮少寧;火炬松生理、生化指標及其與生長性狀的關系[J];河南科技大學學報(農學版);2003年04期

7 劉永新;蔣麗;王桂興;劉海金;劉英杰;;牙鲆選育家系生長性狀的因子分析[J];水產學雜志;2013年05期

8 劉永新;詹金綿;劉奕;王桂興;劉海金;劉英杰;;牙鲆雜合克隆的鑒定及其生長性狀的遺傳分析[J];水產科學;2014年01期

9 王慶志;李琪;劉世凱;孔令鋒;;長牡蠣成體生長性狀的遺傳參數估計[J];中國水產科學;2012年04期

10 李健;林希冉;陳佳虹;張奕;陳家歡;張細權;;雞1號染色體114701476-115068911區(qū)域與生長性狀的關聯分析[J];中國獸醫(yī)學報;2012年09期

中國重要會議論文全文數據庫 前10條

1 羅坤;孔杰;欒生;楊翠華;楊國梁;王軍毅;張宇飛;;羅氏沼蝦生長性狀的遺傳參數及其相關性分析[A];中國海洋湖沼學會第九次全國會員代表大會暨學術研討會論文摘要匯編[C];2007年

2 譚新;俞小牧;童金茍;;鳙GH基因單核苷酸多態(tài)性及其與生長性狀相關性研究[A];2009年中國水產學會學術年會論文摘要集[C];2009年

3 王t

本文編號：434127