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利用標(biāo)記輔助最佳線性無偏差預(yù)測法選擇高產(chǎn)仔數(shù)大白母豬的研究

發(fā)布時間:2017-06-08 12:16

  本文關(guān)鍵詞:利用標(biāo)記輔助最佳線性無偏差預(yù)測法選擇高產(chǎn)仔數(shù)大白母豬的研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:產(chǎn)仔數(shù)是母豬繁殖重要的組成性狀,提高母豬產(chǎn)仔數(shù)能夠顯著地提高生產(chǎn)效率和經(jīng)濟效益。然而豬的繁殖性狀遺傳力低,受環(huán)境因素影響較大,并且為限性性狀,從而導(dǎo)致了傳統(tǒng)選擇效果不大。隨著分子生物學(xué)以及生物信息學(xué)等新興學(xué)科的發(fā)展與成熟,采用標(biāo)記輔助選擇能成功地解決這一難題。我們首先檢測了武漢西湖州大白豬群(472頭)4個控制豬繁殖性狀候選主效基因雌激素受體基因(ESR)、促卵泡素β亞基基因(FSHβ)、鈣粘蛋白類似物基因(CTNNAL1)、mi R-27a基因的基因型。結(jié)果表明:在大白豬群中4個位點上存在不同程度的多態(tài)性。我們同時對4個候選基因在豬群中的遺傳效應(yīng)進行了分析。結(jié)果如下:1.ESR、mi R-27a、FSHβ位點A等位基因的頻率分別是0.58、0.80、0.16;CTNNAL1位點G等位基因的頻率是0.67。2.通過四個候選基因與大白豬繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn):ESR基因BB基因型的頭胎總產(chǎn)仔數(shù)比AA基因型高0.72頭/胎(P0.05)。FSHβ基因頭胎總產(chǎn)仔數(shù)BB基因型比AA基因型高1.81頭/胎(P0.05);BB基因型總胎次總產(chǎn)仔數(shù)比AA基因型高1.25頭/胎(P0.05),加性效應(yīng)為0.48頭/胎(P0.05);總胎次產(chǎn)活仔數(shù)AB、BB基因型分別比AA基因型高1.36頭/胎(P0.05)、1.49頭/胎(P0.05),且加性效應(yīng)為0.65頭/胎(P0.05)。CTNNAL1基因經(jīng)產(chǎn)總產(chǎn)仔數(shù)CG基因型比GG基因型高0.55頭/胎(P0.05),顯性效應(yīng)為0.27頭/胎(P0.05);總胎次總產(chǎn)仔數(shù)CG基因型顯著比GG基因型高0.50頭/胎(P0.05);總胎次產(chǎn)活仔數(shù)GG基因型比CC基因型高0.55頭/胎(P0.05),加性效應(yīng)為0.18頭/胎(P0.05)。mi R-27a基因?qū)Υ蟀棕i的產(chǎn)仔數(shù)性狀沒有顯著性影響。3.通過四個候選基因兩兩合并基因型與繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn):ESR、FSHβ兩個基因的最優(yōu)基因型是AABB;ESR、CTNNAL1兩個基因的最優(yōu)基因型是AACG;ESR、mi R-27a兩個基因的最優(yōu)基因型是AAAA;FSHβ、CTNNAL1兩個基因的最優(yōu)基因型是BBCG;FSHβ、mi R-27a兩個基因的最優(yōu)基因型是BBAA;CTNNAL1、mi R-27a兩個基因的最優(yōu)基因型是CGAA。4.通過對四個候選基因估計育種值與繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn):ESR基因中B等位基因為有利等位基因,有利于頭胎產(chǎn)活仔數(shù)估計育種值、經(jīng)產(chǎn)總產(chǎn)仔數(shù)估計育種值增加和頭胎死胎數(shù)估計育種值、頭胎木乃伊數(shù)估計育種值、總胎次出生窩重估計育種值減少;FSHβ基因中B等位基因為有利等位基因,有利于頭胎總產(chǎn)仔數(shù)估計育種值、經(jīng)產(chǎn)產(chǎn)活仔數(shù)估計育種值、總胎次斷奶仔豬數(shù)估計育種值的增加和經(jīng)產(chǎn)木乃伊數(shù)估計育種值減少;CTNNAL1基因中G等位基因為有利等位基因,有利于頭胎總產(chǎn)仔數(shù)估計育種值、經(jīng)產(chǎn)產(chǎn)活仔數(shù)估計育種值、總胎次出生窩重估計育種值的增加和頭胎死胎數(shù)估計育種值減少;mi R-27a基因中A等位基因為有利等位基因,有利于經(jīng)產(chǎn)總產(chǎn)仔數(shù)估計育種值、總胎次總產(chǎn)仔數(shù)估計育種值、出生窩重估計育種值增加和頭胎死胎數(shù)估計育種值、經(jīng)產(chǎn)木乃伊數(shù)估計育種值減少。
【關(guān)鍵詞】: MBLUP ESR基因 FSHβ基因 CTNNAL1基因 mi R-27a基因 估計育種值
【學(xué)位授予單位】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:S828
【目錄】:
  • 摘要8-10
  • Abstract10-12
  • 第一章 文獻綜述12-24
  • 1 引言12-13
  • 2 關(guān)于豬繁殖性狀的遺傳改良方法13-16
  • 2.1 利用雜交手段進行繁殖性狀的改良13
  • 2.2 通過常規(guī)選擇改良豬的繁殖性狀13-14
  • 2.3 利用標(biāo)記輔助選擇改良豬繁殖性狀14-16
  • 2.3.1 尋找主效基因或QTL的方法14-15
  • 2.3.2 影響標(biāo)記輔助選擇效率的因素15-16
  • 2.3.3 標(biāo)記輔助選擇的應(yīng)用16
  • 3 標(biāo)記輔助最佳線性無偏差預(yù)測法16-17
  • 4 候選基因17-19
  • 4.1 關(guān)于ESR基因17
  • 4.2 關(guān)于FSHβ 基因17-18
  • 4.3 關(guān)于mi R-27a基因18
  • 4.4 關(guān)于CTNNAL1基因18-19
  • 5 估計育種值研究進展19-23
  • 5.1 育種值的概念19-20
  • 5.2 育種值估計的方法20-21
  • 5.3 準確估計育種值的意義21-22
  • 5.4 育種值估計不足和今后的發(fā)展趨勢22-23
  • 6 選題的目的與意義23-24
  • 第二章 材料與方法24-36
  • 1. 實驗材料24-26
  • 1.1 實驗樣品24
  • 1.2 主要儀器和設(shè)備24-25
  • 1.3 主要試劑與試劑盒25
  • 1.4 常用試劑及配制25-26
  • 2 試驗方法26-36
  • 2.1 豬基因組DNA的提取26-28
  • 2.1.1 豬血液提取基因組DNA26-27
  • 2.1.2 豬毛發(fā)提取基因組DNA27-28
  • 2.2 候選基因引物的設(shè)計與合成28
  • 2.3 候選基因片段序列擴增28-29
  • 2.4 候選基因的PCR-RFLP酶切分型29
  • 2.5 數(shù)據(jù)的處理29-36
  • 2.5.1 基因型遺傳效應(yīng)分析29-30
  • 2.5.2 育種值的估計30-36
  • 2.5.2.1 育種值估計的材料30
  • 2.5.2.2 育種值估計統(tǒng)計分析模型30-32
  • 2.5.2.3 育種值估計的統(tǒng)計計算方法32-35
  • 2.5.2.4 估計育種值與基因型的的關(guān)聯(lián)分析35-36
  • 第三章 結(jié)果與分析36-56
  • 1 候選基因片段的PCR擴增結(jié)果36-37
  • 2 候選基因位點的PCR-RFLPs37-38
  • 3 候選基因位點多態(tài)性分布38-40
  • 4 候選基因位點在試驗群體中遺傳效應(yīng)的分析40-45
  • 4.1 ESR基因位點40-41
  • 4.2 FSHβ 基因位點41-43
  • 4.3 CTNNAL1基因位點43-44
  • 4.4 mi R-27a基因位點44-45
  • 5 雙標(biāo)記組合對繁殖性狀的影響45-50
  • 5.1 ESR、FSHβ 兩個位點合并基因型對繁殖性狀的影響45-46
  • 5.2 ESR、CTNNAL1兩個位點合并基因型對繁殖性狀的影響46-47
  • 5.3 ESR、mi R-27a兩個位點合并基因型對繁殖性狀的影響47-48
  • 5.4 FSHβ、CTNNAL1兩個位點合并基因型對繁殖性狀的影響48-49
  • 5.5 FSHβ、mi R-27a兩個位點合并基因型對繁殖性狀的影響49-50
  • 5.6 CTNNAL1、mi R-27a兩個位點合并基因型對繁殖性狀的影響50
  • 6 四個候選基因繁殖性狀育種值的估計50-56
  • 6.1 ESR基因繁殖性狀的估計育種值50-52
  • 6.2 FSHβ 基因繁殖性狀的估計育種值52-53
  • 6.3 CTNNAL1基因繁殖性狀的估計育種值53-54
  • 6.4 mi R-27a基因繁殖性狀的估計育種值54-56
  • 第四章 討論56-63
  • 1 關(guān)于4個標(biāo)記的遺傳效應(yīng)分析56-61
  • 1.1 單個標(biāo)記的遺傳效應(yīng)56-60
  • 1.1.1 ESR在試驗群體中的遺傳效應(yīng)56-57
  • 1.1.2 FSHβ 在試驗群體中的遺傳效應(yīng)57-58
  • 1.1.3 CTNNAL1在試驗群體中的遺傳效應(yīng)58-59
  • 1.1.4 mi R-27a在試驗群體中的遺傳效應(yīng)59-60
  • 1.2 兩個標(biāo)記的遺傳效應(yīng)60-61
  • 1.2.1 ESR分別和FSHβ、CTNNAL1、mi R-27a基因合并基因型的遺傳效應(yīng)60-61
  • 1.2.2 FSHβ 分別和CTNNAL1、mi R-27a基因合并基因型的遺傳效應(yīng)61
  • 1.2.3 CTNNAL1和mi R-27a基因合并基因型的遺傳效應(yīng)61
  • 2 四個候選標(biāo)記的繁殖性狀估計育種值分析61-63
  • 2.1 ESR基因繁殖性狀估計育種值分析61-62
  • 2.2 FSHβ 基因繁殖性狀估計育種值分析62
  • 2.3 CTNNAL1基因繁殖性狀估計育種值分析62
  • 2.4 mi R-27a基因繁殖性狀估計育種值分析62-63
  • 第五章 小結(jié)63-64
  • 第六章 本研究的創(chuàng)新之處64-65
  • 參考文獻65-71
  • 碩士期間已發(fā)表論文71-72
  • 致謝72

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前6條

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3 施啟順;柳小春;劉志偉;李小平;李永輝;唐凡;;5個與豬產(chǎn)仔數(shù)相關(guān)基因的效應(yīng)分析[J];遺傳;2006年06期

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  本文關(guān)鍵詞:利用標(biāo)記輔助最佳線性無偏差預(yù)測法選擇高產(chǎn)仔數(shù)大白母豬的研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號:432504

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