鴨甲肝病毒3型QZ1401株全基因組序列分析及部分毒力研究
發(fā)布時(shí)間:2025-05-15 06:46
鴨甲肝病毒(Duck hepatitis A virus,DHAV)及鴨星狀病毒(Duck astrovirus)導(dǎo)致的鴨病毒性肝炎(Duck viral hepatitis,DVH),主要感染1~3周齡雛鴨,具有高度致死、傳播迅速的特點(diǎn)。其中DHAV型鴨肝炎呈世界范圍分布,給養(yǎng)鴨業(yè)帶來極大的損失。為深入了解DHAV-3基因組變異情況,本研究對(duì)分離自山東青州的DHAV-3分離株QZ1401進(jìn)行了全基因組序列測(cè)定及分析,對(duì)其部分毒力開展了研究。本研究主要內(nèi)容包括以下兩方面:1、DHAV-3山東青州分離株QZ1401的全基因組測(cè)序及結(jié)果分析本研究通過對(duì)DHAV-3青州分離株QZ1401進(jìn)行分段RT-PCR擴(kuò)增、測(cè)序及拼接,最終得到其全基因組序列,分析其全基因組結(jié)構(gòu),結(jié)果表明:QZ1401株的基因組結(jié)構(gòu)為5’UTR-L-VP0-VP3-VP1-2A1-2A2-2B-2C-3A-3B-3C-3D-3’UTR;QZ1401株與其他GeneBank中登錄的DHAV-3毒株存在很高的同源性,全基因組核苷酸同源性為92.7%99.4%,編碼區(qū)的氨基酸序列的同源性為96.5%
【文章頁數(shù)】:48 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
1 前言
1.1 鴨甲肝病毒的概述
1.1.1 鴨甲肝病毒的分類地位
1.1.2 DHAV研究的發(fā)展史
1.2 DHAV的生物學(xué)特性
1.2.1 DHAV的結(jié)構(gòu)特征及抵抗力
1.2.2 D H AV的致病性
1.2.3 D H AV的培養(yǎng)特性
1.3 DHAV-1 分子生物學(xué)研究進(jìn)展
1.3.1 DHAV-3 基因組結(jié)構(gòu)
1.3.2 DHAV-3 功能蛋白作用及其特性
1.4 DHAV的流行病學(xué)
1.5 DHAV的預(yù)防與治療
1.5.1 DHAV的預(yù)防
1.5.2 治療
1.6 本研究目的意義
2 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 菌 ( 毒 )
2.1.2 試驗(yàn)動(dòng)物
2.1.3 酶和相關(guān)試劑
2.1.4 主要儀器
2.1.5 實(shí)驗(yàn)所用的溶液及其配制
2.1.6 全基因組擴(kuò)增引物的設(shè)計(jì)與合成
2.2 方法
2.2.1 QZ1401株DHAV-3 的分離培養(yǎng)以及全基因組測(cè)序
2.2.2 QZ1401株DHAV-3 的毒力測(cè)定
3 結(jié)果與分析
3.1 QZ1401株DHAV-3 全基因組測(cè)序的結(jié)果分析
3.1.1 目的片段擴(kuò)增結(jié)果
3.1.2 QZ1401株DHAV-3 全基因組結(jié)構(gòu)測(cè)序結(jié)果拼接與同源
3.1.3 氨基酸進(jìn)化樹的構(gòu)建與分析
3.1.4 VP1高變區(qū)氨基酸序列分析
3.2 毒力檢測(cè)的結(jié)果
3.2.1 鴨胚半數(shù)致死量
3.2.2 雛鴨半數(shù)致死量
4 討論
4.1 QZ1401株全基因組測(cè)序及分析
4.2 毒力測(cè)定
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
本文編號(hào):4046409
【文章頁數(shù)】:48 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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中文摘要
ABSTRACT
1 前言
1.1 鴨甲肝病毒的概述
1.1.1 鴨甲肝病毒的分類地位
1.1.2 DHAV研究的發(fā)展史
1.2 DHAV的生物學(xué)特性
1.2.1 DHAV的結(jié)構(gòu)特征及抵抗力
1.2.2 D H AV的致病性
1.2.3 D H AV的培養(yǎng)特性
1.3 DHAV-1 分子生物學(xué)研究進(jìn)展
1.3.1 DHAV-3 基因組結(jié)構(gòu)
1.3.2 DHAV-3 功能蛋白作用及其特性
1.4 DHAV的流行病學(xué)
1.5 DHAV的預(yù)防與治療
1.5.1 DHAV的預(yù)防
1.5.2 治療
1.6 本研究目的意義
2 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 菌 ( 毒 )
2.1.2 試驗(yàn)動(dòng)物
2.1.3 酶和相關(guān)試劑
2.1.4 主要儀器
2.1.5 實(shí)驗(yàn)所用的溶液及其配制
2.1.6 全基因組擴(kuò)增引物的設(shè)計(jì)與合成
2.2 方法
2.2.1 QZ1401株DHAV-3 的分離培養(yǎng)以及全基因組測(cè)序
2.2.2 QZ1401株DHAV-3 的毒力測(cè)定
3 結(jié)果與分析
3.1 QZ1401株DHAV-3 全基因組測(cè)序的結(jié)果分析
3.1.1 目的片段擴(kuò)增結(jié)果
3.1.2 QZ1401株DHAV-3 全基因組結(jié)構(gòu)測(cè)序結(jié)果拼接與同源
3.1.3 氨基酸進(jìn)化樹的構(gòu)建與分析
3.1.4 VP1高變區(qū)氨基酸序列分析
3.2 毒力檢測(cè)的結(jié)果
3.2.1 鴨胚半數(shù)致死量
3.2.2 雛鴨半數(shù)致死量
4 討論
4.1 QZ1401株全基因組測(cè)序及分析
4.2 毒力測(cè)定
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
本文編號(hào):4046409
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