為探討綿羊血小板糖蛋白V基因（Glycoprotein V,Platelet,GP5）編碼蛋白的結(jié)構(gòu)和功能,以NCBI網(wǎng)站的GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中發(fā)布的綿羊GP5基因序列（登錄號(hào)為XM₀27965957.1）為基礎(chǔ),采用生物信息學(xué)在線工具和軟件對(duì)綿羊的GP5基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,綿羊GP5基因序列中包含1個(gè)最大長(zhǎng)度為1 620 bp的開(kāi)放閱讀框,推測(cè)其編碼539個(gè)氨基酸,其中亮氨酸含量最多,為22.6%。GP5基因所編碼的蛋白其相對(duì)分子質(zhì)量約為59 305.38 KDa,理論等電點(diǎn)為9.40;亞細(xì)胞定位結(jié)果表明其主要位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)（44.4%）。GP5蛋白含有信號(hào)肽和跨膜螺旋結(jié)構(gòu),在二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)中,該蛋白以無(wú)規(guī)卷曲為主,為70.14%。GP5蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)主要由無(wú)規(guī)卷曲折疊纏繞形成,與二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)構(gòu)一致。

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圖1 綿羊GP5基因序列開(kāi)放閱讀框分析

蛋白基本理化性質(zhì)主要包括相對(duì)分子質(zhì)量、理論等電點(diǎn)（pI）值、氨基酸組成等[3]。利用ProtParam在線工具和Bioedit軟件對(duì)綿羊GP5基因編碼產(chǎn)物的理化性質(zhì)進(jìn)行分析，結(jié)果表明，綿羊GP5基因編碼539個(gè)氨基酸殘基，其分子式為C2681H4320N756O728S16，....

圖2 綿羊GP5基因編碼蛋白的氨基酸組成

圖1綿羊GP5基因序列開(kāi)放閱讀框分析2.3綿羊GP5蛋白親疏水性分析

圖3 綿羊GP5基因編碼蛋白疏水性/親水性預(yù)測(cè)分析

通過(guò)SignalP3.0軟件對(duì)綿羊GP5蛋白潛在信號(hào)肽剪切位點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測(cè)，以此推斷綿羊GP5蛋白是否存在信號(hào)肽序列及蛋白編碼產(chǎn)物是否為分泌蛋白。由圖4可知，在16和17位氨基酸之間存在剪切位點(diǎn)的可能性較大，可以推斷出GP5蛋白存在信號(hào)肽序列，且屬于分泌蛋白。綿羊GP5基因編碼產(chǎn)....

圖4 綿羊GP5基因蛋白潛在信號(hào)肽剪切位點(diǎn)分析

圖3綿羊GP5基因編碼蛋白疏水性/親水性預(yù)測(cè)分析2.5綿羊GP5基因編碼產(chǎn)物亞細(xì)胞定位分析

本文編號(hào)：4038307