試驗(yàn)旨在探討PRKAA2基因在摩拉水牛群體中的遺傳多態(tài)性及其與生長性狀的關(guān)聯(lián)性,進(jìn)而得到顯著相關(guān)的遺傳標(biāo)記,為摩拉水牛的分子標(biāo)記輔助選擇提供理論依據(jù)。利用DNA測序法等技術(shù)進(jìn)行候選基因PRKAA2外顯子4及部分內(nèi)含子3單核苷酸多態(tài)性(SNPs)檢測,并采用生物信息學(xué)方法結(jié)合統(tǒng)計(jì)軟件分析PRKAA2基因與摩拉水牛生長性狀的關(guān)聯(lián)性。結(jié)果顯示,摩拉水牛PRKAA2基因中共檢測到4個SNPs位點(diǎn):c.462 G>A、IVS3.557 T>C、IVS3.560 C>T和IVS3.565 G>A,均包含3種基因型,且符合Hardy-Weinberg平衡。4個SNPs位點(diǎn)在水牛群體中均為中度多態(tài),可以構(gòu)建3種單倍型,T-C-G-G為優(yōu)勢單倍型,其中IVS3.560 C>T與c.462 G>A位點(diǎn)之間存在完全連鎖不平衡,關(guān)聯(lián)分析結(jié)果顯示,單倍型H2與摩拉水牛體斜長和腰角寬呈顯著相關(guān)(P<0.05)。c.462 G>A位點(diǎn)與摩拉水牛體高、十字部高、尻長、坐骨端寬和腰角寬呈顯著相關(guān),其中GG和AA基因型個體的體高和十字部高均顯著高于GA基因型個體,GG基因型...

【文章頁數(shù)】：10 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 樣品采集
    1.2 主要試劑
    1.3 DNA提取
    1.4 引物設(shè)計(jì)及合成
    1.5 PCR擴(kuò)增及基因分型
    1.6 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié) 果
    2.1 PRKAA2基因PCR擴(kuò)增結(jié)果
    2.2 測序結(jié)果
    2.3 PRKAA2基因遺傳學(xué)分析
        2.3.1 基因型頻率、基因頻率
        2.3.2 4個SNPs位點(diǎn)在摩拉群體中的遺傳特性分析
    2.4 連鎖不平衡和單倍型分析
        2.4.1 PRKAA2基因4個SNPs位點(diǎn)的連鎖不平衡分析
        2.4.2 PRKAA2基因4個SNPs位點(diǎn)的單倍型種類及其頻率的計(jì)算分析
    2.5 摩拉水牛PRKAA2基因單倍型與生長性狀的關(guān)聯(lián)分析
    2.6 摩拉水牛PRKAA2基因多態(tài)性與生長性狀的關(guān)聯(lián)分析
3 討 論
4 結(jié) 論



本文編號：4021302