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合作豬SLA-DQA第2、4外顯子多態(tài)性分析

發(fā)布時(shí)間:2024-12-08 22:23
  合作豬是一種生長(zhǎng)較慢的小型豬種,放牧性能很強(qiáng),具有不易疲勞、不懼暴曬和風(fēng)雪等特殊性能。為研究合作豬SLA-DQA基因外顯子2和4遺傳多態(tài)性及變異特征,確定其等位基因數(shù)、核苷酸多態(tài)位點(diǎn)、氨基酸多態(tài)位點(diǎn)及各個(gè)等位基因之間的遺傳關(guān)系,分析其進(jìn)化意義,選用PCR-SSCP對(duì)439只合作豬SLA-DQA基因外顯子2和4的多態(tài)性進(jìn)行了檢測(cè),測(cè)序測(cè)定了各等位基因序列,構(gòu)建了同源樹(shù)以便進(jìn)一步明確合作豬SLA-DQA基因外顯子2和4的各等位基因之間以及與平原豬種、國(guó)外豬種的遺傳關(guān)系。結(jié)果顯示,在合作豬SLA-DQA外顯子2中發(fā)現(xiàn)了7個(gè)新等位基因,共18個(gè)核苷酸多態(tài)位點(diǎn),10個(gè)氨基酸多態(tài)位點(diǎn);合作豬SLA-DQA外顯子4中發(fā)現(xiàn)了4個(gè)新等位基因,共6個(gè)核苷酸多態(tài)位點(diǎn),4個(gè)氨基酸多態(tài)位點(diǎn),說(shuō)明合作豬SLA-DQA外顯子2和4具有較豐富的多態(tài)性,群體內(nèi)可能蘊(yùn)藏著更加豐富的遺傳資源。通過(guò)SLA-DQA基因構(gòu)建的同源樹(shù)表明,合作豬SLA-DQA基因外顯子2和4最初可能由一個(gè)等位基因突變分化成一大類基因;合作豬SLA-DQA外顯子2和4序列與各個(gè)豬種的的SLA-DQA外顯子2和4序列具有較高的同源性,預(yù)示著這些豬種的S...

【文章頁(yè)數(shù)】:42 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖3-2DQA基因第2外顯子擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖

圖3-2DQA基因第2外顯子擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖

目的條帶清晰,分別得到341bp和252bp的片段,片段長(zhǎng)度大小一致(見(jiàn)圖3-1,圖3-2)。


圖3-3DQA基因第2外顯子SSCP電泳圖譜

圖3-3DQA基因第2外顯子SSCP電泳圖譜

變性聚丙烯酰胺凝膠在合適的溫度下恒定電壓進(jìn)行電色之后對(duì)電泳的結(jié)果進(jìn)行觀察(見(jiàn)圖3-3、圖3-4)。



本文編號(hào):4015099

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