綿羊外周血中游離DNA應(yīng)用于胎兒性別鑒定以及基因分型的初步研究
發(fā)布時(shí)間:2024-05-22 01:51
目的:外周血中游離的DNA主要是指存在于血漿,血清等循環(huán)系統(tǒng)里的一些小片段DNA。它是機(jī)體代謝的正常生理表現(xiàn),但是在一些病變或類(lèi)病變機(jī)體中這類(lèi)游離的DNA的含量和組成會(huì)發(fā)生變化。這些研究結(jié)果在一些疾病的臨床診斷以及非創(chuàng)傷性早期妊娠診斷方面給人們提供了一個(gè)新的檢測(cè)診斷方法。本研究應(yīng)用三種方法從綿羊外周血漿/血清中分離提取游離DNA,建立高效的外周血游離DNA提取方法,并對(duì)SRY基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增開(kāi)展早期胎兒性別鑒定,同時(shí)對(duì)利用游離DNA進(jìn)行基因突變篩選的可行性做初步的研究。 方法:1、綿羊外周血中游離DNA提取及SRY基因檢測(cè)。利用加熱法、酚氯仿法以及試劑盒從500μL血漿/血清中提取游離的DNA。根據(jù)游離DNA片段的特點(diǎn)分別設(shè)計(jì)擴(kuò)增產(chǎn)物為168bp的MC1R檢測(cè)引物和178bp的SRY基因引物進(jìn)行普通PCR檢測(cè)。 2、不同妊娠時(shí)期胎兒性別鑒定。利用試劑盒提取血漿樣品中游離DNA,設(shè)計(jì)巢式PCR引物,優(yōu)化擴(kuò)增體系。對(duì)SRY基因特異性擴(kuò)增,并統(tǒng)計(jì)各個(gè)妊娠階段的檢測(cè)結(jié)果與分娩結(jié)果分析。 3、利用酶切及HRM技術(shù)對(duì)血漿DNA中綿羊FecB基因進(jìn)行分型效果研究。 結(jié)果:1、利用加熱法、酚氯仿法、...
【文章頁(yè)數(shù)】:53 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
項(xiàng)目資助
摘要
Abstract
英文縮略詞表
前言
1 研究目的和意義
2 論文的理論依據(jù)
3 論文總體研究思路
3.1 綿羊外周血中游離 DNA 分離提取方法的建立:
3.2 利用巢氏 PCR 對(duì)游離胎兒 DNA 檢測(cè)進(jìn)而開(kāi)展胎兒性別鑒定:
3.3 基于 HRM 的外周血游離 DNA 用于基因分型的研究:
第一章 文獻(xiàn)綜述
前言
1 游離胎兒 DNA 的病理、生理學(xué)機(jī)制
2 游離胎兒 DNA 的組織來(lái)源
2.1 胎兒造血細(xì)胞
2.2 胎盤(pán)
2.3 胎兒和母體之間 DNA 分子的直接轉(zhuǎn)運(yùn)
3 游離胎兒 DNA 的提取分離
3.1 直接熱提取法
3.2 酚氯仿法
3.3 商業(yè)試劑盒
4 游離胎兒 DNA 的檢測(cè)
4.1 普通 PCR 擴(kuò)增法
4.2 巢式 PCR 檢測(cè)
4.3 熒光定量 PCR 法
4.4 引物延伸 PCR 法
4.5 質(zhì)譜法(MS)檢測(cè)
5 游離胎兒 DNA 的臨床應(yīng)用
5.1 妊娠胎兒性別鑒定
5.2 、性別相關(guān)遺傳疾病的診斷
6 其他遺傳相關(guān)疾病的臨床診斷
6.1 、染色體非整倍體疾病的診斷
6.2 、Rh D 血型檢測(cè)
7 基于 HRM 的基因分型技術(shù)
8、存在的問(wèn)題及研究前景
第二章 試驗(yàn)研究
試驗(yàn)一 綿羊外周血中游離 DNA 提取及 SRY 基因檢測(cè)
引言
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 實(shí)驗(yàn)樣品采集和制備
1.1.2 所需設(shè)備儀器及試劑
1.2 方法
1.2.1 酚氯仿法提取血漿/血清游離 DNA
1.2.2 加熱法提取血漿/血清游離 DNA
1.2.3 利用試劑盒提取血漿/血清游離 DNA
1.2.4 PCR 反應(yīng)
1.2.5 凝膠電泳分析
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 采用不同提取方法檢測(cè)結(jié)果
2.2 檢測(cè)不同來(lái)源模板擴(kuò)增的結(jié)果
2.3 SRY 基因的檢測(cè)
3 討論
4 結(jié)論
試驗(yàn)二 基于巢式 PCR 的游離胎兒 DNA 性別鑒定
引言
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 實(shí)驗(yàn)樣品采集和制備
1.1.2 所需設(shè)備儀器及試劑
1.2 方法
1.2.1 利用加熱法提取血漿游離 DNA
1.2.2 巢式 PCR 反應(yīng)及其第二輪反應(yīng)體系優(yōu)化
1.2.3 凝膠電泳分析
1.2.4 結(jié)果判定統(tǒng)計(jì)
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 巢式 PCR 第二輪擴(kuò)增體系優(yōu)化結(jié)果
2.2 血漿樣本擴(kuò)增結(jié)果
2.3 性別判定結(jié)果
2.4 不同妊娠時(shí)期鑒定準(zhǔn)確率
3 討論
4 結(jié)論
試驗(yàn)三 基于 HRM 的游離 DNA 中 FecB 基因突變篩選的可行性研究
前言
1 材料和方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 所需設(shè)備儀器及試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.3.1 血液基因組的提取
1.3.2 引物設(shè)計(jì)合成
1.3.3 不同引物濃度
1.3.4 不同 Mg2+濃度
1.3.5 染料添加量對(duì) HRM 的影響分析
1.3.6 染料添加方式對(duì) HRM 分析的影響
1.3.7 HRM 分析
1.3.8 進(jìn)行 PCR-RLFP 檢測(cè)
1.3.9 基因的克隆測(cè)序鑒定
2 結(jié)果
2.1 不同引物濃度對(duì) HRM 分析的影響
2.2 不同 Mg2+濃度對(duì) HRM 分析的影響
2.3 染料濃度梯度結(jié)果分析
2.4 染料添加時(shí)間差異結(jié)果分析
2.5 PCR-RLFP 檢測(cè)結(jié)果
2.6 測(cè)序結(jié)果
3 討論
4、結(jié)論
全文結(jié)論及研究特色與創(chuàng)新
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡(jiǎn)介及在學(xué)成果
石河子大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文導(dǎo)師評(píng)閱表
本文編號(hào):3980222
【文章頁(yè)數(shù)】:53 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
項(xiàng)目資助
摘要
Abstract
英文縮略詞表
前言
1 研究目的和意義
2 論文的理論依據(jù)
3 論文總體研究思路
3.1 綿羊外周血中游離 DNA 分離提取方法的建立:
3.2 利用巢氏 PCR 對(duì)游離胎兒 DNA 檢測(cè)進(jìn)而開(kāi)展胎兒性別鑒定:
3.3 基于 HRM 的外周血游離 DNA 用于基因分型的研究:
第一章 文獻(xiàn)綜述
前言
1 游離胎兒 DNA 的病理、生理學(xué)機(jī)制
2 游離胎兒 DNA 的組織來(lái)源
2.1 胎兒造血細(xì)胞
2.2 胎盤(pán)
2.3 胎兒和母體之間 DNA 分子的直接轉(zhuǎn)運(yùn)
3 游離胎兒 DNA 的提取分離
3.1 直接熱提取法
3.2 酚氯仿法
3.3 商業(yè)試劑盒
4 游離胎兒 DNA 的檢測(cè)
4.1 普通 PCR 擴(kuò)增法
4.2 巢式 PCR 檢測(cè)
4.3 熒光定量 PCR 法
4.4 引物延伸 PCR 法
4.5 質(zhì)譜法(MS)檢測(cè)
5 游離胎兒 DNA 的臨床應(yīng)用
5.1 妊娠胎兒性別鑒定
5.2 、性別相關(guān)遺傳疾病的診斷
6 其他遺傳相關(guān)疾病的臨床診斷
6.1 、染色體非整倍體疾病的診斷
6.2 、Rh D 血型檢測(cè)
7 基于 HRM 的基因分型技術(shù)
8、存在的問(wèn)題及研究前景
第二章 試驗(yàn)研究
試驗(yàn)一 綿羊外周血中游離 DNA 提取及 SRY 基因檢測(cè)
引言
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 實(shí)驗(yàn)樣品采集和制備
1.1.2 所需設(shè)備儀器及試劑
1.2 方法
1.2.1 酚氯仿法提取血漿/血清游離 DNA
1.2.2 加熱法提取血漿/血清游離 DNA
1.2.3 利用試劑盒提取血漿/血清游離 DNA
1.2.4 PCR 反應(yīng)
1.2.5 凝膠電泳分析
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 采用不同提取方法檢測(cè)結(jié)果
2.2 檢測(cè)不同來(lái)源模板擴(kuò)增的結(jié)果
2.3 SRY 基因的檢測(cè)
3 討論
4 結(jié)論
試驗(yàn)二 基于巢式 PCR 的游離胎兒 DNA 性別鑒定
引言
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 實(shí)驗(yàn)樣品采集和制備
1.1.2 所需設(shè)備儀器及試劑
1.2 方法
1.2.1 利用加熱法提取血漿游離 DNA
1.2.2 巢式 PCR 反應(yīng)及其第二輪反應(yīng)體系優(yōu)化
1.2.3 凝膠電泳分析
1.2.4 結(jié)果判定統(tǒng)計(jì)
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 巢式 PCR 第二輪擴(kuò)增體系優(yōu)化結(jié)果
2.2 血漿樣本擴(kuò)增結(jié)果
2.3 性別判定結(jié)果
2.4 不同妊娠時(shí)期鑒定準(zhǔn)確率
3 討論
4 結(jié)論
試驗(yàn)三 基于 HRM 的游離 DNA 中 FecB 基因突變篩選的可行性研究
前言
1 材料和方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 所需設(shè)備儀器及試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.3.1 血液基因組的提取
1.3.2 引物設(shè)計(jì)合成
1.3.3 不同引物濃度
1.3.4 不同 Mg2+濃度
1.3.5 染料添加量對(duì) HRM 的影響分析
1.3.6 染料添加方式對(duì) HRM 分析的影響
1.3.7 HRM 分析
1.3.8 進(jìn)行 PCR-RLFP 檢測(cè)
1.3.9 基因的克隆測(cè)序鑒定
2 結(jié)果
2.1 不同引物濃度對(duì) HRM 分析的影響
2.2 不同 Mg2+濃度對(duì) HRM 分析的影響
2.3 染料濃度梯度結(jié)果分析
2.4 染料添加時(shí)間差異結(jié)果分析
2.5 PCR-RLFP 檢測(cè)結(jié)果
2.6 測(cè)序結(jié)果
3 討論
4、結(jié)論
全文結(jié)論及研究特色與創(chuàng)新
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡(jiǎn)介及在學(xué)成果
石河子大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文導(dǎo)師評(píng)閱表
本文編號(hào):3980222
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