本試驗旨在研究患乳腺癌貓與健康貓體內差異代謝物的變化情況,并探討差異代謝物與貓乳腺癌發(fā)生之間的關系。本試驗選取臨床收集的經(jīng)組織病理學確診的貓乳腺癌血清樣本6例作為試驗組(T組),同時選取年齡相似,品種相同的健康貓血清6例作為對照組(C組)。運用超高效液相色譜質譜聯(lián)用技術(liquid chromatography-mass spectrometry,LC-MS)對兩組貓的血清樣本進行檢測,采用無監(jiān)督的主成分分析(principal component analysis, PCA)、正交偏最小二乘法-判別分析(orthogonal projections to latent structures-discriminant analysis,OPLS-DA)及學生t檢驗(Student’s t-test)篩選出差異代謝物,然后再對篩選出的差異代謝物進行層次聚類分析(hierarchical clustering analysis,HCA),并進行差異代謝物的KEGG注釋及差異代謝物的代謝通路分析。結果表明,在兩組樣本中共定性到159種差異代謝物。與C組相比,在T組中有49種差異代謝物出現(xiàn)下...

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【部分圖文】：

圖2差異代謝物篩選火山圖

通過對篩選出的差異代謝物進行定性,共定性到159種差異代謝物,與C組相比,T組中有49種下調,110種上調。通過以上分析得到的差異代謝物,在生物學上往往具有結果和功能相似性/互補性,或者受同一代謝通路的正調控/負調控,表現(xiàn)為在不同試驗組間具有相似或相反的表達特征。對這類特征進行H....

圖3HCA熱力圖

代謝反應及其調控并不單獨進行,往往會形成復雜的通路和網(wǎng)絡,它們的相互影響和相互調控最終導致代謝組發(fā)生系統(tǒng)性的改變。KEGG數(shù)據(jù)庫以基因和基因組的功能信息為基礎,以代謝反應為線索,串聯(lián)可能的代謝途徑及對應的調控蛋白,以圖解的方式展示細胞生理生化過程。將篩選出的全部差異代謝物對KEG....

圖4差異代謝通路氣泡圖

表1貓乳腺腫癌關鍵差異代謝產(chǎn)物Table1Keydifferentialmetabolitesoffelinemammarycarcinomas差異代謝物DifferentialmetabolitesP值PvalueVIP值VIPvalueFold....

圖55種標志性差異代謝物互作網(wǎng)絡圖

圖4差異代謝通路氣泡圖表25種差異代謝產(chǎn)物代謝通路歸屬Table2Metabolicpathwaysof5differentialmetabolites差異代謝物DifferentialmetabolitesKEGGID代謝通路名稱Metabolic....

本文編號：3951297