肌動蛋白樣蛋白8(actin-like 8,ACTL8)是肌動蛋白家族中的重要一員,在參與細胞分裂、細胞運動、信息傳遞等活動的同時,還具有內吞作用、細胞形態(tài)和極性維持等諸多功能,并與微管和中間絲(IF)共同構成細胞骨架。ACTL8具有對肌肉收縮的調節(jié)和穩(wěn)定的作用,對肉的成熟嫩度有影響。但是目前對于ACTL8基因在黃牛肌肉中的作用機制尚不清楚,其與中國黃牛生長發(fā)育的關聯性有待進一步研究。因此,本文以黃牛ACTL8基因為研究對象,探究該基因的遺傳變異功能,同時對ACTL8基因在秦川牛不同年齡不同組織的表達量進行分析,以期得到相應的分子遺傳學信息,找出對中國黃牛生長發(fā)育有顯著影響的分子標記,為今后深入研究ACTL8基因在黃牛肌肉生長發(fā)育中的功能提供試驗基礎,并為我國黃牛遺傳資源的保護、開發(fā)和使用提供遺傳學依據。本論文的主要研究工作和結論如下:1.黃牛ACTL8基因的遺傳多態(tài)性通過運用PCR-RFLP和DNA池測序技術,對394頭秦川牛、213頭夏南牛、180頭晉南牛、82頭郟縣紅牛、81頭南陽牛和44頭德南牛個體的ACTL8基因的單核苷酸多態(tài)性進行檢測,結果檢測到5個突變位點和2處插入缺失,...

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【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
引言
文獻綜述
    第一章 黃牛ACTL8基因遺傳變異與功能的研究進展
        1.1 黃牛品種簡介
        1.2 ACTL8基因的研究進展
            1.2.1 肌動蛋白概況
            1.2.2 ACTL8基因研究進展
            1.2.3 ACTL8的生物學功能
            1.2.4 ACTL8與細胞骨架
            1.2.5 ACTL8與細胞運動
            1.2.6 ACTL8與細胞分裂
            1.2.7 ACTL8與肌肉
            1.2.8 ACTL8與腫瘤
        1.3 基因的單核苷酸多態(tài)性
        1.4 聚合酶鏈式反應
        1.5 全基因組選擇技術
試驗研究
    第二章 黃牛ACTL8基因的遺傳多樣性
        2.1 試驗材料
            2.1.1 黃牛血樣樣品
            2.1.2 黃牛生長發(fā)育性狀
            2.1.3 試驗所需試劑及儀器設備
            2.1.4 試驗所需試劑及溶液的配置
        2.2 試驗方法
            2.2.1 �；蚪MDNA的提取
            2.2.2 DNA質量的檢測
            2.2.3 PCR引物的設計
            2.2.4 PCR反應體系和擴增條件
            2.2.5 酵切引物的設計
            2.2.6 對酵切位點進行PCR擴增
            2.2.7 酵切分析
        2.3 統(tǒng)計分析
            2.3.1 相關統(tǒng)計分析
            2.3.2 相關分析統(tǒng)計模型
            2.3.3 相關分析軟件
        2.4 結果與分析
            2.4.1 牛基因組DNA樣品質量的檢測
            2.4.2 牛ACTL8基因多態(tài)位點的檢測分析
            2.4.3 牛ACTL8基因插入缺失位點的驗證分析
            2.4.4 牛ACTL8基因多態(tài)位點酶切引物的設計
            2.4.5 牛ACTL8基因多態(tài)位點酶切的鑒定結果
        2.5 討論
            2.5.1 關于牛ACTL8基因多態(tài)位點檢測方法的選擇
            2.5.2 牛ACTL8基因SNPs位點的分析
        2.6 小結
    第三章 黃牛ACTL8基因多態(tài)位點的群體遺傳學數據分析
        3.1 牛ACTL8基因SNP 1 位點的遺傳多樣性統(tǒng)計
        3.2 牛ACTL8基因SNP 4 位點的遺傳多樣性統(tǒng)計
        3.3 牛ACTL8基因SNP 5 位點的遺傳多樣性統(tǒng)計
        3.4 牛ACTL8基因SNP 7 位點的遺傳多樣性統(tǒng)計
        3.5 牛ACTL8基因SNP 8 位點的遺傳多樣性統(tǒng)計
        3.6 牛ACTL8基因SNP 11位點的遺傳多樣性統(tǒng)計
        3.7 牛ACTL8基因SNP 12位點的遺傳多樣性統(tǒng)計
        3.8 牛ACTL8基因SNPS位點的連鎖不平衡分析
            3.8.1 秦川牛ACTL8基因SNPs位點的連鎖不平衡分析
            3.8.2 夏南牛ACTL8基因SNPs位點的連鎖不平衡分析
            3.8.3 德南牛ACTL8基因SNPs位點的連鎖不平衡分析
            3.8.4 南陽牛ACTL8基因SNPs位點的連鎖不平衡分析
            3.8.5 郟縣紅牛ACTL8基因SNPs位點的連鎖不平衡分析
            3.8.6 晉南牛ACTL8基因SNPs位點的連鎖不平衡分析
        3.9 討論
            3.9.1 哈代-溫伯格平衡定律的生物學意義
            3.9.2 連鎖不平衡分析的生物學意義
        3.10 小結
    第四章 ACTL8基因多態(tài)性與六個黃牛品種主要生長性狀的關聯分析
        4.1 黃牛部分生長性狀和ACTL8基因SNPS的關聯分析
            4.1.1 秦川牛群體內ACTL8基因的SNPs突變位點與主要生長性狀的關聯分析
            4.1.2 夏南牛群體內ACTL8基因的SNPs突變位點與主要生長性狀的關聯分析
            4.1.3 郟縣紅牛群體內ACTL8基因的SNPs突變位點與主要生長性狀的關聯分析.414.1.4 德南牛群體內ACTL8基因的SNPs突變位點與主要生長性狀的關聯分析
            4.1.5 南陽牛群體內ACTL8基因的SNPs突變位點與主要生長性狀的關聯分析
            4.1.6 晉南牛群體內ACTL8基因的SNPs突變位點與主要生長性狀的關聯分析
        4.2 討論
        4.3 小結
    第五章 黃牛ACTL8基因的組織表達規(guī)律
        5.1 試驗材料和方法
            5.1.1 試驗動物和所需組織
            5.1.2 試驗所需試劑及溶液的配制和儀器設備
            5.1.3 試驗方法
        5.2 結果與分析
            5.2.1 組織RNA質量檢測結果
            5.2.2 定量引物質量檢驗結果
            5.2.3 ACTL8基因在秦川牛不同生長階段、不同組織的表達量
        5.3 討論
            5.3.1 內參基因β-actin的選擇
            5.3.2 牛ACTL8基因的組織表達譜分析
        5.4 小結
結論和創(chuàng)新點
    試驗結論
    創(chuàng)新點
參考文獻
附錄
致謝
作者簡介



本文編號：3937774