黃牛ACTL8基因的遺傳變異及組織表達(dá)譜研究
發(fā)布時(shí)間:2024-03-24 17:07
肌動蛋白樣蛋白8(actin-like 8,ACTL8)是肌動蛋白家族中的重要一員,在參與細(xì)胞分裂、細(xì)胞運(yùn)動、信息傳遞等活動的同時(shí),還具有內(nèi)吞作用、細(xì)胞形態(tài)和極性維持等諸多功能,并與微管和中間絲(IF)共同構(gòu)成細(xì)胞骨架。ACTL8具有對肌肉收縮的調(diào)節(jié)和穩(wěn)定的作用,對肉的成熟嫩度有影響。但是目前對于ACTL8基因在黃牛肌肉中的作用機(jī)制尚不清楚,其與中國黃牛生長發(fā)育的關(guān)聯(lián)性有待進(jìn)一步研究。因此,本文以黃牛ACTL8基因?yàn)檠芯繉ο?探究該基因的遺傳變異功能,同時(shí)對ACTL8基因在秦川牛不同年齡不同組織的表達(dá)量進(jìn)行分析,以期得到相應(yīng)的分子遺傳學(xué)信息,找出對中國黃牛生長發(fā)育有顯著影響的分子標(biāo)記,為今后深入研究ACTL8基因在黃牛肌肉生長發(fā)育中的功能提供試驗(yàn)基礎(chǔ),并為我國黃牛遺傳資源的保護(hù)、開發(fā)和使用提供遺傳學(xué)依據(jù)。本論文的主要研究工作和結(jié)論如下:1.黃牛ACTL8基因的遺傳多態(tài)性通過運(yùn)用PCR-RFLP和DNA池測序技術(shù),對394頭秦川牛、213頭夏南牛、180頭晉南牛、82頭郟縣紅牛、81頭南陽牛和44頭德南牛個(gè)體的ACTL8基因的單核苷酸多態(tài)性進(jìn)行檢測,結(jié)果檢測到5個(gè)突變位點(diǎn)和2處插入缺失,...
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
引言
文獻(xiàn)綜述
第一章 黃牛ACTL8基因遺傳變異與功能的研究進(jìn)展
1.1 黃牛品種簡介
1.2 ACTL8基因的研究進(jìn)展
1.2.1 肌動蛋白概況
1.2.2 ACTL8基因研究進(jìn)展
1.2.3 ACTL8的生物學(xué)功能
1.2.4 ACTL8與細(xì)胞骨架
1.2.5 ACTL8與細(xì)胞運(yùn)動
1.2.6 ACTL8與細(xì)胞分裂
1.2.7 ACTL8與肌肉
1.2.8 ACTL8與腫瘤
1.3 基因的單核苷酸多態(tài)性
1.4 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)
1.5 全基因組選擇技術(shù)
試驗(yàn)研究
第二章 黃牛ACTL8基因的遺傳多樣性
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 黃牛血樣樣品
2.1.2 黃牛生長發(fā)育性狀
2.1.3 試驗(yàn)所需試劑及儀器設(shè)備
2.1.4 試驗(yàn)所需試劑及溶液的配置
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 ;蚪MDNA的提取
2.2.2 DNA質(zhì)量的檢測
2.2.3 PCR引物的設(shè)計(jì)
2.2.4 PCR反應(yīng)體系和擴(kuò)增條件
2.2.5 酵切引物的設(shè)計(jì)
2.2.6 對酵切位點(diǎn)進(jìn)行PCR擴(kuò)增
2.2.7 酵切分析
2.3 統(tǒng)計(jì)分析
2.3.1 相關(guān)統(tǒng)計(jì)分析
2.3.2 相關(guān)分析統(tǒng)計(jì)模型
2.3.3 相關(guān)分析軟件
2.4 結(jié)果與分析
2.4.1 ;蚪MDNA樣品質(zhì)量的檢測
2.4.2 牛ACTL8基因多態(tài)位點(diǎn)的檢測分析
2.4.3 牛ACTL8基因插入缺失位點(diǎn)的驗(yàn)證分析
2.4.4 牛ACTL8基因多態(tài)位點(diǎn)酶切引物的設(shè)計(jì)
2.4.5 牛ACTL8基因多態(tài)位點(diǎn)酶切的鑒定結(jié)果
2.5 討論
2.5.1 關(guān)于牛ACTL8基因多態(tài)位點(diǎn)檢測方法的選擇
2.5.2 牛ACTL8基因SNPs位點(diǎn)的分析
2.6 小結(jié)
第三章 黃牛ACTL8基因多態(tài)位點(diǎn)的群體遺傳學(xué)數(shù)據(jù)分析
3.1 牛ACTL8基因SNP 1 位點(diǎn)的遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)
3.2 牛ACTL8基因SNP 4 位點(diǎn)的遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)
3.3 牛ACTL8基因SNP 5 位點(diǎn)的遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)
3.4 牛ACTL8基因SNP 7 位點(diǎn)的遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)
3.5 牛ACTL8基因SNP 8 位點(diǎn)的遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)
3.6 牛ACTL8基因SNP 11位點(diǎn)的遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)
3.7 牛ACTL8基因SNP 12位點(diǎn)的遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)
3.8 牛ACTL8基因SNPS位點(diǎn)的連鎖不平衡分析
3.8.1 秦川牛ACTL8基因SNPs位點(diǎn)的連鎖不平衡分析
3.8.2 夏南牛ACTL8基因SNPs位點(diǎn)的連鎖不平衡分析
3.8.3 德南牛ACTL8基因SNPs位點(diǎn)的連鎖不平衡分析
3.8.4 南陽牛ACTL8基因SNPs位點(diǎn)的連鎖不平衡分析
3.8.5 郟縣紅牛ACTL8基因SNPs位點(diǎn)的連鎖不平衡分析
3.8.6 晉南牛ACTL8基因SNPs位點(diǎn)的連鎖不平衡分析
3.9 討論
3.9.1 哈代-溫伯格平衡定律的生物學(xué)意義
3.9.2 連鎖不平衡分析的生物學(xué)意義
3.10 小結(jié)
第四章 ACTL8基因多態(tài)性與六個(gè)黃牛品種主要生長性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.1 黃牛部分生長性狀和ACTL8基因SNPS的關(guān)聯(lián)分析
4.1.1 秦川牛群體內(nèi)ACTL8基因的SNPs突變位點(diǎn)與主要生長性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.1.2 夏南牛群體內(nèi)ACTL8基因的SNPs突變位點(diǎn)與主要生長性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.1.3 郟縣紅牛群體內(nèi)ACTL8基因的SNPs突變位點(diǎn)與主要生長性狀的關(guān)聯(lián)分析.414.1.4 德南牛群體內(nèi)ACTL8基因的SNPs突變位點(diǎn)與主要生長性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.1.5 南陽牛群體內(nèi)ACTL8基因的SNPs突變位點(diǎn)與主要生長性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.1.6 晉南牛群體內(nèi)ACTL8基因的SNPs突變位點(diǎn)與主要生長性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.2 討論
4.3 小結(jié)
第五章 黃牛ACTL8基因的組織表達(dá)規(guī)律
5.1 試驗(yàn)材料和方法
5.1.1 試驗(yàn)動物和所需組織
5.1.2 試驗(yàn)所需試劑及溶液的配制和儀器設(shè)備
5.1.3 試驗(yàn)方法
5.2 結(jié)果與分析
5.2.1 組織RNA質(zhì)量檢測結(jié)果
5.2.2 定量引物質(zhì)量檢驗(yàn)結(jié)果
5.2.3 ACTL8基因在秦川牛不同生長階段、不同組織的表達(dá)量
5.3 討論
5.3.1 內(nèi)參基因β-actin的選擇
5.3.2 牛ACTL8基因的組織表達(dá)譜分析
5.4 小結(jié)
結(jié)論和創(chuàng)新點(diǎn)
試驗(yàn)結(jié)論
創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡介
本文編號:3937774
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
引言
文獻(xiàn)綜述
第一章 黃牛ACTL8基因遺傳變異與功能的研究進(jìn)展
1.1 黃牛品種簡介
1.2 ACTL8基因的研究進(jìn)展
1.2.1 肌動蛋白概況
1.2.2 ACTL8基因研究進(jìn)展
1.2.3 ACTL8的生物學(xué)功能
1.2.4 ACTL8與細(xì)胞骨架
1.2.5 ACTL8與細(xì)胞運(yùn)動
1.2.6 ACTL8與細(xì)胞分裂
1.2.7 ACTL8與肌肉
1.2.8 ACTL8與腫瘤
1.3 基因的單核苷酸多態(tài)性
1.4 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)
1.5 全基因組選擇技術(shù)
試驗(yàn)研究
第二章 黃牛ACTL8基因的遺傳多樣性
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 黃牛血樣樣品
2.1.2 黃牛生長發(fā)育性狀
2.1.3 試驗(yàn)所需試劑及儀器設(shè)備
2.1.4 試驗(yàn)所需試劑及溶液的配置
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 ;蚪MDNA的提取
2.2.2 DNA質(zhì)量的檢測
2.2.3 PCR引物的設(shè)計(jì)
2.2.4 PCR反應(yīng)體系和擴(kuò)增條件
2.2.5 酵切引物的設(shè)計(jì)
2.2.6 對酵切位點(diǎn)進(jìn)行PCR擴(kuò)增
2.2.7 酵切分析
2.3 統(tǒng)計(jì)分析
2.3.1 相關(guān)統(tǒng)計(jì)分析
2.3.2 相關(guān)分析統(tǒng)計(jì)模型
2.3.3 相關(guān)分析軟件
2.4 結(jié)果與分析
2.4.1 ;蚪MDNA樣品質(zhì)量的檢測
2.4.2 牛ACTL8基因多態(tài)位點(diǎn)的檢測分析
2.4.3 牛ACTL8基因插入缺失位點(diǎn)的驗(yàn)證分析
2.4.4 牛ACTL8基因多態(tài)位點(diǎn)酶切引物的設(shè)計(jì)
2.4.5 牛ACTL8基因多態(tài)位點(diǎn)酶切的鑒定結(jié)果
2.5 討論
2.5.1 關(guān)于牛ACTL8基因多態(tài)位點(diǎn)檢測方法的選擇
2.5.2 牛ACTL8基因SNPs位點(diǎn)的分析
2.6 小結(jié)
第三章 黃牛ACTL8基因多態(tài)位點(diǎn)的群體遺傳學(xué)數(shù)據(jù)分析
3.1 牛ACTL8基因SNP 1 位點(diǎn)的遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)
3.2 牛ACTL8基因SNP 4 位點(diǎn)的遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)
3.3 牛ACTL8基因SNP 5 位點(diǎn)的遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)
3.4 牛ACTL8基因SNP 7 位點(diǎn)的遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)
3.5 牛ACTL8基因SNP 8 位點(diǎn)的遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)
3.6 牛ACTL8基因SNP 11位點(diǎn)的遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)
3.7 牛ACTL8基因SNP 12位點(diǎn)的遺傳多樣性統(tǒng)計(jì)
3.8 牛ACTL8基因SNPS位點(diǎn)的連鎖不平衡分析
3.8.1 秦川牛ACTL8基因SNPs位點(diǎn)的連鎖不平衡分析
3.8.2 夏南牛ACTL8基因SNPs位點(diǎn)的連鎖不平衡分析
3.8.3 德南牛ACTL8基因SNPs位點(diǎn)的連鎖不平衡分析
3.8.4 南陽牛ACTL8基因SNPs位點(diǎn)的連鎖不平衡分析
3.8.5 郟縣紅牛ACTL8基因SNPs位點(diǎn)的連鎖不平衡分析
3.8.6 晉南牛ACTL8基因SNPs位點(diǎn)的連鎖不平衡分析
3.9 討論
3.9.1 哈代-溫伯格平衡定律的生物學(xué)意義
3.9.2 連鎖不平衡分析的生物學(xué)意義
3.10 小結(jié)
第四章 ACTL8基因多態(tài)性與六個(gè)黃牛品種主要生長性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.1 黃牛部分生長性狀和ACTL8基因SNPS的關(guān)聯(lián)分析
4.1.1 秦川牛群體內(nèi)ACTL8基因的SNPs突變位點(diǎn)與主要生長性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.1.2 夏南牛群體內(nèi)ACTL8基因的SNPs突變位點(diǎn)與主要生長性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.1.3 郟縣紅牛群體內(nèi)ACTL8基因的SNPs突變位點(diǎn)與主要生長性狀的關(guān)聯(lián)分析.414.1.4 德南牛群體內(nèi)ACTL8基因的SNPs突變位點(diǎn)與主要生長性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.1.5 南陽牛群體內(nèi)ACTL8基因的SNPs突變位點(diǎn)與主要生長性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.1.6 晉南牛群體內(nèi)ACTL8基因的SNPs突變位點(diǎn)與主要生長性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.2 討論
4.3 小結(jié)
第五章 黃牛ACTL8基因的組織表達(dá)規(guī)律
5.1 試驗(yàn)材料和方法
5.1.1 試驗(yàn)動物和所需組織
5.1.2 試驗(yàn)所需試劑及溶液的配制和儀器設(shè)備
5.1.3 試驗(yàn)方法
5.2 結(jié)果與分析
5.2.1 組織RNA質(zhì)量檢測結(jié)果
5.2.2 定量引物質(zhì)量檢驗(yàn)結(jié)果
5.2.3 ACTL8基因在秦川牛不同生長階段、不同組織的表達(dá)量
5.3 討論
5.3.1 內(nèi)參基因β-actin的選擇
5.3.2 牛ACTL8基因的組織表達(dá)譜分析
5.4 小結(jié)
結(jié)論和創(chuàng)新點(diǎn)
試驗(yàn)結(jié)論
創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡介
本文編號:3937774
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