鴨綠殼蛋表型與候選基因族及主選SLCO2B1基因關聯(lián)功效研究
發(fā)布時間:2024-01-24 14:04
家禽蛋殼顏色作為現(xiàn)代家禽育種的重要性狀之一廣受業(yè)界關注。試驗以鴨綠殼蛋為研究素材,利用轉錄組學和候選基因研究兩種技術手段分析鴨蛋的綠殼表型關鍵基因突變,為闡明鴨蛋綠殼表型形成的分子機理提供依據(jù)。試驗一鴨綠殼蛋表型調控候選基因與功能分析試驗分別從35周齡的2個金定鴨種群中,每個群隨機選取3只產(chǎn)綠殼蛋和3只產(chǎn)白殼蛋的鴨,共12只,利用轉錄組測序技術對蛋殼腺組織進行轉錄組測序分析。結果表明:(1)轉錄組測序共得到41000000個有效reads,其中55.9%的reads能夠匹配到鴨參考基因組,并且組裝成31542個轉錄本,平均長度為1839±86 bp。(2)綠殼表型候選基因共464個,其中230個基因在綠殼蛋性狀形成中表達下調,234個基因表達上調。(3)候選基因中,有359個基因被富集到1515條生物學過程,363個基因注釋到250條細胞組分,339個基因注釋到469條分子功能GO富集條目中。基因過度表達分析表明,其中9條生物學過程、6條細胞組分和1條分子功能條目顯著過度表達(P<0.05)。(4)候選基因中,有13個Ca2+,10個Na+,8個K+,5個H+,1個Cl-轉運蛋白...
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學位級別】:碩士
本文編號:3883944
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圖1-1血紅素代謝通路(Bonkovskyetal.2013)
圖1-2OATP基因家族系統(tǒng)進化樹
圖1-3人OATP1B1基因跨膜結構域(HagenbuchandGui2008)
圖2-112個轉錄本平均測序深度分布情況
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