雞白痢是一種嚴重威脅現(xiàn)代家禽養(yǎng)殖業(yè)的細菌性疾病,該病不僅可造成雛雞的大規(guī)模死亡,同時隱性感染使得感染雞生長遲緩、生產性狀降低等,從而給養(yǎng)殖業(yè)造成重大的經濟損失。養(yǎng)殖場主要疫苗接種和添加抗生素等藥物的方法對其進行防治,同時也造成了致病菌耐藥升高和禽產品抗生素殘留等問題。隨著研究的不斷深入,人們發(fā)現(xiàn)雞白痢的發(fā)生與個體的遺傳因素相關。已有研究表明,NRAMP1、TLR4及MHC等基因多態(tài)性與抗雞白痢沙門氏菌性狀相關聯(lián)。MyD88基因作為先天免疫通路中的一種重要的銜接蛋白,在免疫應答反應中發(fā)揮著重要作用。但是MyD88基因的多態(tài)性與雞白痢疾病的關系卻尚未見報道。為了探究雞MyD88基因的多態(tài)性和雞白痢沙門氏菌易感性之間的關聯(lián)性分析。本試驗基于病例-對照試驗設計,以二郎山山地雞為試驗材料,采集陽性雞樣本血樣128份,陰性雞血樣156份,共284份血樣提取全基因組DNA,采用制作DNA池進行直接測序的方法篩選MyD88基因CDS區(qū)的變異位點,然后對采集的所有樣本進行直接測序來檢測MyD88基因CDS區(qū)的單核苷酸多態(tài)性,并進行基因分型,最后使用SPASS21.0軟件和Hploview 4.2軟件分別...

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【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
1. 文獻綜述
    1.1 選題背景
    1.2 雞白痢的流行特點
    1.3 雞白痢的臨床診斷
    1.4 雞白痢的剖檢變化
    1.5 雞白痢的檢測方法
    1.6 雞白痢的預防
    1.7 雞白痢沙門氏菌感染生物學
        1.7.1 胃腸道的侵入
        1.7.2 全身系統(tǒng)感染
        1.7.3 清除、持續(xù)感染或死亡
    1.8 先天免疫中的模式識別受體-TLR
        1.8.1 MyD88依賴性途徑
        1.8.2 TRIF依賴性途徑
    1.9 TLR間的協(xié)同作用
    1.10 雞TLR4/MyD88/NF-κB信號通路與沙門氏菌感染的關系
    1.11 MyD88基因研究現(xiàn)狀
        1.11.1 MyD88的發(fā)現(xiàn)
        1.11.2 MyD88的信號
    1.12 SNP的檢測方法
    1.13 本研究的內容及目的意義
2. 材料和方法
    2.1 試驗材料
    2.2 試劑與儀器
    2.3 主要生物學軟件
    2.4 試驗方法
        2.4.1 雞白痢檢測
        2.4.2 全基因組DNA提取與檢測
        2.4.3 目的基因擴增
        2.4.4 構建DNA池
        2.4.5 SNP引物的篩選
        2.4.6 統(tǒng)計分析
3. 結果與分析
    3.1 基因組DNA提取結果
    3.2 雞MyD88基因PCR擴增結果
    3.3 目的片段的確定與DNA池測序結果
    3.4 哈迪-溫伯格平衡
    3.5 MyD88基因多態(tài)位點的等位基因頻率與基因型頻率
    3.6 單倍型分析
        3.6.1 單倍型組的構建
        3.6.2 單倍型與抗雞白痢性狀的關聯(lián)性
4. 討論
    4.1 病例-對照研究分析
    4.2 雞MyD88基因CDS區(qū)的SNPs的分析
    4.3 MyD88基因的多態(tài)性與抗雞白痢性狀的關聯(lián)分析
    4.4 單倍型分析
5. 結論
參考文獻
致謝
攻讀碩士期間的研究成果



本文編號：3881729