發(fā)布時間：2023-12-24 11:08

　　反芻動物是現存哺乳動物中唯一具有以骨質為核心的角的類群。角作為反芻動物關鍵形態(tài)特征是其進化過程中的一個器官創(chuàng)新。反芻動物角在長期的自然選擇過程中演化出了不同的形態(tài)特點:如牛科和叉角羚科演化出角質鞘,鹿科鹿茸的快速生長及周期性脫落和再生特性。牛、羊的角不利于畜牧生產管理,但其進化起源以及關鍵調控基因仍有待研究。此外鹿茸作為特種經濟動物產品是哺乳動物中具有完全再生能力的器官,并擁有極快的生長速度,其細胞分裂增殖速度甚至超過了癌細胞,由此推測鹿科物種低的癌癥發(fā)生率是其適應細胞快速分裂增殖的進化副產物。為此本研究通過比較基因組的方法對以上生物學問題進行解析。本研究組裝一個鹿科獐亞科物種和兩個麝科物種基因組,并結合反芻動物基因組項目收集到1個鼷鹿科物種,1個叉角羚科物種,2個長頸鹿科物種,8個鹿科物種,1個麝科物種以及38個�？莆锓N共計54種涵蓋所有現存反芻動物科的反芻動物基因組數據。此外,測序20個狍子轉錄組,20個梅花鹿轉錄組,68個山羊轉錄組,以及113個綿羊轉錄組,并下載了49個已發(fā)表的綿羊組織轉錄組數據,共計270個涵蓋16種不同組織的轉錄組數據。通過比較上述基因組和轉錄組數據并結合細...

【文章頁數】：162 頁

【學位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
縮略詞表
第一章 文獻綜述
    1.1 引言
    1.2 反芻動物角的概述
        1.2.1 反芻動物角形態(tài)特征
        1.2.2 反芻動物角進化起源探討
    1.3 角遺傳變異解析
        1.3.1 牛角相關變異研究
        1.3.2 羊角相關變異研究
        1.3.3 牛科角變異基因總結
    1.4 鹿茸再生的組織生理研究
        1.4.1 鹿茸的組織學特征
        1.4.2 鹿茸再生
        1.4.3 鹿茸的快速生長
    1.5 抗癌物種的進化研究
        1.5.1 抗癌能力的進化
        1.5.2 物種進化抗癌機制
    1.6 比較基因組學分析方法及研究進展
        1.6.1 比較基因組學的研究方法
        1.6.2 比較基因組學的研究進展
        1.6.3 比較基因組研究展望
    1.7 本研究的目的和意義
第二章 無角反芻動物獐子和兩個麝科物種基因組組裝
    2.1 材料與方法
        2.1.1 試驗材料
        2.1.2 試驗方法
    2.2 結果與分析
        2.2.1 獐子基因組
        2.2.2 兩個麝科物種基因組
        2.2.3 獐子和麝科物種基因組假基因的鑒定
    2.3 討論
    2.4 小結
第三章 反芻動物�？贫唇桥c鹿科鹿茸基因表達基礎
    3.1 材料與方法
        3.1.1 試驗材料
        3.1.2 試驗方法
    3.2 結果與分析
        3.2.1 牛科洞角特異的高表達基因
        3.2.2 鹿茸特異的高表達基因
        3.2.3 比較分析兩種反芻動物角特異高表達基因
        3.2.4 綿羊胚胎期角芽組織與臨近頭部皮膚組織差異基因
    3.3 討論
        3.3.1 �？贫唇呛吐箍坡谷椎钠鹪刺接�
        3.3.2 角作為反芻動物第二性征的進化
        3.3.3 神經組織在角發(fā)育過程中扮演重要角色
    3.4 小結
第四章 比較基因組解析反芻動物角的遺傳基礎
    4.1 材料與方法
        4.1.1 試驗材料
        4.1.2 試驗方法
    4.2 結果與分析
        4.2.1 有角反芻動物正選擇基因解析角的進化
        4.2.2 有角反芻動物特異保守元件
        4.2.3 角變異相關基因座位的比較基因組研究
        4.2.4 整合分析反芻動物角起源的細胞基礎
    4.3 討論
    4.4 小結
第五章 比較基因組分析鹿科鹿茸快速再生遺傳基礎
    5.1 材料與方法
        5.1.1 試驗材料
        5.1.2 試驗方法
    5.2 結果與分析
        5.2.1 鹿科正選擇基因
        5.2.2 鹿科加速進化元件
        5.2.3 神經組織對鹿茸的調控
        5.2.4 鹿茸快速生長與癌癥
        5.2.5 鹿科特異正選擇PML基因抑癌作用
    5.3 討論
    5.4 小結
第六章 總結與展望
參考文獻
附錄
致謝
個人簡歷



本文編號：3874388