不同綿羊品種的leptin基因多態(tài)性檢測及分析
發(fā)布時間:2023-11-24 19:22
本實驗是以104頭常年發(fā)情的湖羊和90頭季節(jié)性發(fā)情的阿勒泰羊,兩個綿羊品種為主要研究對象。利用PCR-SSCP技術(shù)對兩個品種綿羊的leptin基因多態(tài)性進行檢測,并對篩查到的leptin基因位點多態(tài)性與綿羊季節(jié)性發(fā)情進行相關(guān)分析。結(jié)果如下: 在Leptin外顯子2擴增片段上檢測到AA、AB、BB三種SSCP基因型,BB基因型在阿勒泰羊群體中屬于優(yōu)勢基因型,而AA基因型在湖羊中屬于優(yōu)勢基因型。對兩個群體進行基因型頻率獨立性χ2檢驗,差異極顯著(P<0.001),說明BB基因型是影響季節(jié)性發(fā)情的有利基因型,并且該位點基因型分布處于Hardy-Weinberg平衡。在leptin外顯子3擴增片段上檢測的到CC、CD、DD三種SSCP基因型。CC基因型在湖羊上是優(yōu)勢基因型,并且未檢測到DD基因型。對兩個群體進行基因型頻率獨立性χ2檢驗,差異顯著(P<0.01),該位點基因型分布處于Hardy-Weinberg平衡。 DNA測序結(jié)果表明,與湖羊相比,在阿勒泰羊leptin基因第一內(nèi)含子上發(fā)現(xiàn)有三個連續(xù)堿基TTG的插入和C/T堿基突變;而第三外顯子上發(fā)生G/T堿基突變,編碼氨基酸由纈氨...
【文章頁數(shù)】:47 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
石河子大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文導(dǎo)師評閱表
摘要
Abstract
中英文對照表
文獻綜述
1.Leptin 的研究進展
1.1 ob 基因的發(fā)現(xiàn)和起源
1.2 Leptin 的結(jié)構(gòu)
1.3 Leptin 受體
1.4 Leptin 基因的生物學(xué)功能
1.4.1 Leptin 對攝食的調(diào)控
1.4.2 Leptin 對糖代謝和胰島素作用的影響
1.4.3 Leptin 對能耗的調(diào)節(jié)
1.4.4 調(diào)節(jié)生殖和發(fā)育
1.5 Leptin 與綿羊季節(jié)性繁殖的相關(guān)聯(lián)系
1.5.1 季節(jié)性繁殖的生理調(diào)控通路
1.5.2 Leptin 與季節(jié)性發(fā)情的相關(guān)分析
1.6 Leptin 在畜牧業(yè)的應(yīng)用前景
2.湖羊和阿勒泰羊品種資源的簡介
2.1 常年發(fā)情綿羊品種——湖羊
2.2 季節(jié)性發(fā)情綿羊品種——阿勒泰羊
3.SNP 與 PCR-SSCP 技術(shù)
3.1 SNP 的概念及存在形式
3.2 SNP 檢測方法與手段
3.2.1 限制性片段長度多態(tài)性法
3.2.2 DNA 測序法
3.2.3 基因芯片技術(shù)
3.2.4 焦磷酸測序法
3.2.5 變性高效液相色譜
3.3 PCR-SSCP 技術(shù)原理
3.4 PCR-SSCP 技術(shù)發(fā)展歷程
3.5 PCR-SSCP 技術(shù)的應(yīng)用
4.研究目的和意義
第一章 綿羊 Leptin 基因第二、三外顯子 PCR-SSCP 檢測及序列分析
1.材料與方法
1.1 實驗動物
1.2 實驗試劑
1.3 實驗儀器
1.4 實驗方法
1.4.1 基因組 DNA 的提取
1.4.2 基因組濃度及純度測定
1.4.3 引物設(shè)計和 PCR 反應(yīng)程序
1.4.4 PCR-SSCP 檢測
1.4.5 DNA 測序
1.5 數(shù)據(jù)處理及方法
1.5.1 基因型頻率和基因頻率
1.5.2 Hardy-Weinberg 平衡檢測
1.5.3 位點純合度和雜合度
1.5.4 有效等位基因數(shù)
1.5.5 多態(tài)信息含量
2.結(jié)果與分析
2.1 PCR 產(chǎn)物檢測
2.2 SSCP 檢測及電泳結(jié)果分析
2.2.1 Leptin 第二外顯子擴增片段 SSCP 結(jié)果分析
2.2.2 Leptin 第三外顯子擴增片段 SSCP 結(jié)果分析
2.3 基因型頻率和等位基因頻率的統(tǒng)計和分析
2.3.1 基因型和基因頻率分析
2.3.2 基因型和基因頻率分析
第二章 綿羊 Leptin 基因多態(tài)性及其綿羊季節(jié)性發(fā)情的相關(guān)分析
1.材料與方法
1.1 實驗材料
1.2 數(shù)據(jù)處理方法和分析軟件
2.結(jié)果和分析
2.1 基因頻率和等位基因頻率差異性分析
2.2 兩個綿羊群體 leptin 基因遺傳特性分析
2.3 氨基酸理化性質(zhì)分析
2.3.1 分子式及等電點
2.3.2 蛋白二級結(jié)構(gòu)中蛋白結(jié)合位點
2.3.3 其他理化性質(zhì)參數(shù)
2.4 蛋白三維結(jié)構(gòu)比對分析
3.討論
全文結(jié)論
參考文獻
附錄Ⅰ 主要儀器設(shè)備
附錄Ⅱ 試劑配制
致謝
作者簡介
本文編號:3866438
【文章頁數(shù)】:47 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
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摘要
Abstract
中英文對照表
文獻綜述
1.Leptin 的研究進展
1.1 ob 基因的發(fā)現(xiàn)和起源
1.2 Leptin 的結(jié)構(gòu)
1.3 Leptin 受體
1.4 Leptin 基因的生物學(xué)功能
1.4.1 Leptin 對攝食的調(diào)控
1.4.2 Leptin 對糖代謝和胰島素作用的影響
1.4.3 Leptin 對能耗的調(diào)節(jié)
1.4.4 調(diào)節(jié)生殖和發(fā)育
1.5 Leptin 與綿羊季節(jié)性繁殖的相關(guān)聯(lián)系
1.5.1 季節(jié)性繁殖的生理調(diào)控通路
1.5.2 Leptin 與季節(jié)性發(fā)情的相關(guān)分析
1.6 Leptin 在畜牧業(yè)的應(yīng)用前景
2.湖羊和阿勒泰羊品種資源的簡介
2.1 常年發(fā)情綿羊品種——湖羊
2.2 季節(jié)性發(fā)情綿羊品種——阿勒泰羊
3.SNP 與 PCR-SSCP 技術(shù)
3.1 SNP 的概念及存在形式
3.2 SNP 檢測方法與手段
3.2.1 限制性片段長度多態(tài)性法
3.2.2 DNA 測序法
3.2.3 基因芯片技術(shù)
3.2.4 焦磷酸測序法
3.2.5 變性高效液相色譜
3.3 PCR-SSCP 技術(shù)原理
3.4 PCR-SSCP 技術(shù)發(fā)展歷程
3.5 PCR-SSCP 技術(shù)的應(yīng)用
4.研究目的和意義
第一章 綿羊 Leptin 基因第二、三外顯子 PCR-SSCP 檢測及序列分析
1.材料與方法
1.1 實驗動物
1.2 實驗試劑
1.3 實驗儀器
1.4 實驗方法
1.4.1 基因組 DNA 的提取
1.4.2 基因組濃度及純度測定
1.4.3 引物設(shè)計和 PCR 反應(yīng)程序
1.4.4 PCR-SSCP 檢測
1.4.5 DNA 測序
1.5 數(shù)據(jù)處理及方法
1.5.1 基因型頻率和基因頻率
1.5.2 Hardy-Weinberg 平衡檢測
1.5.3 位點純合度和雜合度
1.5.4 有效等位基因數(shù)
1.5.5 多態(tài)信息含量
2.結(jié)果與分析
2.1 PCR 產(chǎn)物檢測
2.2 SSCP 檢測及電泳結(jié)果分析
2.2.1 Leptin 第二外顯子擴增片段 SSCP 結(jié)果分析
2.2.2 Leptin 第三外顯子擴增片段 SSCP 結(jié)果分析
2.3 基因型頻率和等位基因頻率的統(tǒng)計和分析
2.3.1 基因型和基因頻率分析
2.3.2 基因型和基因頻率分析
第二章 綿羊 Leptin 基因多態(tài)性及其綿羊季節(jié)性發(fā)情的相關(guān)分析
1.材料與方法
1.1 實驗材料
1.2 數(shù)據(jù)處理方法和分析軟件
2.結(jié)果和分析
2.1 基因頻率和等位基因頻率差異性分析
2.2 兩個綿羊群體 leptin 基因遺傳特性分析
2.3 氨基酸理化性質(zhì)分析
2.3.1 分子式及等電點
2.3.2 蛋白二級結(jié)構(gòu)中蛋白結(jié)合位點
2.3.3 其他理化性質(zhì)參數(shù)
2.4 蛋白三維結(jié)構(gòu)比對分析
3.討論
全文結(jié)論
參考文獻
附錄Ⅰ 主要儀器設(shè)備
附錄Ⅱ 試劑配制
致謝
作者簡介
本文編號:3866438
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