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5株水禽細小病毒基因組的克隆與遺傳進化分析

發(fā)布時間:2023-10-30 18:23
  鵝細小病毒病是主要引起雛鵝和雛番鴨發(fā)生高致死性的病毒病。本病主要以消化道,尤其是腸道的卡他性和纖維素性炎癥為主要特征;番鴨細小病毒又稱“三周病”,是由于該病主要侵害三周齡以內(nèi)的雛番鴨。二者早先屬于細小病毒屬成員,在國際病毒分類委員會第八次分類報告中將二者分類于依賴病毒屬。本病以以腹瀉、喘氣、軟腳為主要癥狀的細小病毒病。這兩種病都具有較高的發(fā)病率和死亡率,嚴重危害著水禽業(yè)的發(fā)展。對付這兩種疾病沒有什么特異性的治療方法,多以接種疫苗來預防該病;診斷方法也多以血清學診斷或者分子生物學診斷為主。自首次發(fā)現(xiàn)以來,經(jīng)過國內(nèi)外多年的研究,雖然可以較好的控制本病的發(fā)生,但該病依舊危害著水禽業(yè)。為了更好的控制該病的發(fā)生,我們就要仔細的研究其分子水平上的特性,首要的就是其基因水平上的特性。鵝細小病毒基因組由5106個核苷酸構成,而番鴨細小病毒基因組有5132個核苷酸。他們的編碼區(qū)均由左右兩個開放閱讀框組成,左側(cè)閱讀框編碼的蛋白為非結(jié)構蛋白,包括NS1和NS2兩種;右側(cè)閱讀框編碼結(jié)構蛋白為結(jié)構蛋白,包括VP1、VP2和VP3三種。其中NS1蛋白主要參與病毒對細胞的毒性作用、病毒復制以及基因表達,NS2則能促...

【文章頁數(shù)】:48 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 引言
    1.1 病毒生物學特性
        1.1.1 GPV與MDPV的分類特征
        1.1.2 形態(tài)和理化特性
        1.1.3 宿主范圍與培養(yǎng)特性
    1.2 細小病毒成員之間的關系
        1.2.1 GPV與MDPV之間的關系
        1.2.2 與其他成員的關系
    1.3 分子生物學特性
        1.3.1 編碼區(qū)
        1.3.2 倒置末端重復序列
        1.3.3 基因組的復制
        1.3.4 基因編碼非結(jié)構蛋白與結(jié)構蛋白
    1.4 流行病學
        1.4.1 鵝細小病毒
        1.4.2 番鴨細小病毒
    1.5 癥狀與病理變化
        1.5.1 GPV主要癥狀
        1.5.2 GPV病理變化
        1.5.3 MDPV主要癥狀
        1.5.4 MDPV病理變化
    1.6 診斷
    1.7 防治措施
    1.8 研究的目的與意義
2 材料與方法
    2.1 材料
        2.1.1 病毒、細胞和載體
        2.1.2 分子生物學試劑及常用生化試劑
        2.1.3 引物設計軟件
        2.1.4 序列分析軟件
        2.1.5 主要儀器
    2.2 試驗方法
        2.2.1 感受態(tài)細胞制備
        2.2.2 接種病毒
        2.2.3 病毒基因組DNA提取
        2.2.4 基因擴增引物的設計
        2.2.5 PCR 擴增
        2.2.6 PCR產(chǎn)物的膠回收純化
        2.2.7 pMDlS-T載體克隆質(zhì)粒的構建及鑒定
3 試驗結(jié)果
    3.1 PCR擴增結(jié)果
    3.2 序列分析
        3.2.1 GPV與MDPV的同源性
        3.2.2 與其他成員的同源性
    3.3 水禽細小病毒5個毒株NS和VP區(qū)的糖基化位點特征
    3.4 進化分析
4 討論
5 結(jié)論
致謝
參考文獻
攻讀碩士學位期間發(fā)表的學術論文



本文編號:3858959

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