發(fā)布時(shí)間：2023-08-08 18:33

　　豬流行性腹瀉病毒(PEDV)是引起豬病毒性腹瀉的主要病原之一。大量流行病學(xué)調(diào)查數(shù)據(jù)表明,S1基因的突變導(dǎo)致PEDV致病力的改變,S1蛋白的插入缺失突變對病毒致病性和組織嗜性的改變至關(guān)重要。因此,針對S1基因開展分子流行病學(xué)調(diào)查,對代表性變異毒株進(jìn)行分離,有利于闡明PEDV的遺傳演化規(guī)律,提供基礎(chǔ)防控信息。為調(diào)查2015-2016年中國PEDV毒株遺傳演化情況,在中國20個(gè)省、直轄市或自治區(qū)的78個(gè)規(guī)�；i場,收集疑似感染PEDV的仔豬腸道組織樣品。利用基于ORF3基因的RT-PCR方法對樣品進(jìn)行檢測,然后對PEDV陽性樣品S1基因進(jìn)行擴(kuò)增與測序,進(jìn)一步對S1基因序列進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析、S1蛋白插入缺失突變圖譜(S1-IDMP)、S1蛋白同源性建模以及重組性分析。結(jié)果顯示,共243份為PEDV陽性樣品,其中97個(gè)S1基因成功測序,覆蓋了中國18個(gè)省、直轄市或自治區(qū)。序列分析結(jié)果表明,S1基因的核苷酸同源性為95.9¹00%,推導(dǎo)氨基酸序列同源性為95.9¹00%;與PEDV CV777毒株進(jìn)行序列比對結(jié)果顯示核苷酸同源性為91.6⁹

【文章頁數(shù)】：74 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 文獻(xiàn)綜述
    1.1 PED概述
        1.1.1 PED流行病學(xué)
        1.1.2 臨床癥狀
        1.1.3 發(fā)病機(jī)理及病理變化
        1.1.4 診斷及預(yù)防
    1.2 PEDV生物學(xué)特征
        1.2.1 分類及形態(tài)結(jié)構(gòu)
        1.2.2 基因組結(jié)構(gòu)
        1.2.3 基因組編碼蛋白及功能
        1.2.4 遺傳變異現(xiàn)狀
    1.3 研究目的與意義
2 PEDV檢測及S1基因遺傳進(jìn)化分析
    2.1 材料
        2.1.1 樣品來源
        2.1.2 主要生化試劑
        2.1.3 主要儀器設(shè)備
    2.2 方法
        2.2.1 樣品的處理
        2.2.2 目的基因擴(kuò)增與測序
        2.2.3 S1基因序列分析及進(jìn)化樹構(gòu)建
    2.3 結(jié)果
        2.3.1 目的基因的擴(kuò)增
        2.3.2 PCR產(chǎn)物回收純化結(jié)果
        2.3.3 菌落PCR鑒定
        2.3.4 序列分析和系統(tǒng)進(jìn)化樹分析
    2.4 討論
3 PEDVS1基因插入缺失突變圖譜分析
    3.1 材料
        3.1.1 生物信息學(xué)軟件
    3.2 方法
        3.2.1 S1-IDMPs分析
        3.2.2 S1-IDMPs分子模型建立與分析
        3.2.3 重組分析
    3.3 結(jié)果
        3.3.1 S1-IDMPs分析
        3.3.2 S蛋白建模分析
        3.3.3 重組分析
    3.4 討論
4 PEDV變異毒株的分離與鑒定
    4.1 材料
        4.1.1 樣品來源、細(xì)胞
        4.1.2 主要試劑
        4.1.3 儀器設(shè)備
    4.2 方法
        4.2.1 樣品的處理
        4.2.2 病毒的分離
        4.2.3 病毒的鑒定
    4.3 結(jié)果
    4.4 討論
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄
個(gè)人簡歷



本文編號：3840269