芒草馴養(yǎng)牛瘤胃未培養(yǎng)微生物中CMCase的克
發(fā)布時(shí)間:2023-05-21 19:11
現(xiàn)代社會(huì)不斷發(fā)展,隨之出現(xiàn)的問(wèn)題是社會(huì)經(jīng)濟(jì)增長(zhǎng)與環(huán)境保護(hù)、生存發(fā)展與能源消耗之間的矛盾愈發(fā)突出。傳統(tǒng)能源的開(kāi)采力度不斷增加,使許多不可再生資源總量不斷減少,所帶來(lái)的污染問(wèn)題也愈發(fā)嚴(yán)重,目前最急迫需要解決的問(wèn)題便是努力探索和發(fā)展新能源,而生物質(zhì)能源作為新生代能源之一,將為人類社會(huì)解決能源與環(huán)境問(wèn)題做出卓越貢獻(xiàn)。本研究通過(guò)提取芒草馴養(yǎng)的湘西黃牛瘤胃內(nèi)容物總DNA,構(gòu)建宏基因組文庫(kù)并采用功能篩選法從文庫(kù)中挖掘新型纖維素酶基因資源,獲得研究結(jié)果如下: 應(yīng)用功能篩選法篩選宏基因組文庫(kù)中具有CMCase的克隆,得到一個(gè)功能活性克隆,編號(hào)為185C10。對(duì)此克隆包含的外源片段進(jìn)一步進(jìn)行亞克隆,最終獲得一段2162bp的核苷酸序列,經(jīng)過(guò)生物信息學(xué)軟件預(yù)測(cè)分析,該片段包含長(zhǎng)為1731bp的ORF,將該基因定名為uncel185C10,編碼576個(gè)氨基酸,該基因編碼蛋白Uncel185C10的分子質(zhì)量為62654.2Daltons,等電點(diǎn)pI為4.90,該編碼蛋白無(wú)信號(hào)肽序列,說(shuō)明uncel185C10可能編碼的是胞內(nèi)酶。通過(guò)SMART分析,結(jié)果預(yù)測(cè)該蛋白中第1-300個(gè)氨基酸是糖基水解酶家族8高度保守結(jié)...
【文章頁(yè)數(shù)】:56 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
目錄
第一章 文獻(xiàn)綜述及前言
1 能源植物—芒草的研究與發(fā)展戰(zhàn)略
1.1“綠金”代“黑金”的必然性
1.2 能源植物新秀—芒草
1.3 我國(guó)能源植物芒草的發(fā)展戰(zhàn)略
2 瘤胃未培養(yǎng)微生物及纖維素分解菌
2.1 未培養(yǎng)微生物
2.2 瘤胃微生物
2.2.1 瘤胃細(xì)菌
2.2.2 瘤胃原蟲(chóng)
2.2.3 瘤胃真菌
2.2.4 瘤胃微生物基因組信息
3 瘤胃微生物纖維素酶
3.1 瘤胃微生物纖維素酶的組成
3.2 芒草馴養(yǎng)對(duì)發(fā)掘牛瘤胃微生物纖維素酶的意義
4 宏基因組學(xué)——探索未培養(yǎng)微生物資源的重要途徑
4.1 宏基因組學(xué)研究策略
4.2 宏基因組學(xué)研究應(yīng)用進(jìn)展
4.2.1 在胃腸道微生物資源挖掘上的應(yīng)用
4.2.2 在口腔微生物研究領(lǐng)域中的應(yīng)用
4.2.3 在植物病害生物防治中的應(yīng)用
4.2.4 在自然環(huán)境微生物資源挖掘上的應(yīng)用
4.3 宏基因組技術(shù)存在的問(wèn)題及展望
5 本論文立題依據(jù)、研究目標(biāo)及技術(shù)路線
5.1 題依據(jù)
5.2 研究目標(biāo)
5.3 技術(shù)路線
第二章 材料與方法
1 材料
1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及飼養(yǎng)
1.2 實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備
1.3 實(shí)驗(yàn)藥品及試劑
2 方法
2.1 宏基因組Fosmid文庫(kù)克隆子的提取和保存
2.1.1 Fosmid文庫(kù)克隆子的提取
2.1.2 Fosmid文庫(kù)克隆子的保存
2.2 Fosmid文庫(kù)篩選
2.3 克隆文庫(kù)的構(gòu)建
2.3.1 Fosmid克隆質(zhì)粒的提取
2.3.2 pUC質(zhì)粒載體制備
2.3.3 目的片段酶切產(chǎn)物與pUC19載體的連接
2.3.4 連接產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化
2.3.5 克隆文庫(kù)的篩選
2.4 菌液PCR檢測(cè)
2.5 功能基因序列分析
2.6 原核表達(dá)載體的構(gòu)建
2.6.1 擴(kuò)增功能基因的編碼序列
2.6.2 PCR擴(kuò)增
2.6.3 pET30a(+)質(zhì)粒載體的提取
2.6.4 制備感受態(tài)
2.6.5 酶切體系
2.6.6 目的基因片段與表達(dá)載體DNA連接及轉(zhuǎn)化
2.7 誘導(dǎo)表達(dá)條件的優(yōu)化
2.7.1 最佳誘導(dǎo)劑劑量的確定
2.7.2 最佳誘導(dǎo)溫度的確定
2.7.3 最佳誘導(dǎo)時(shí)間的確定
2.8 CMCase酶學(xué)性質(zhì)初步研究
2.8.1 CMCase酶活力的測(cè)定
2.8.2 繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線
2.8.3 酶活測(cè)定
2.8.4 粗酶液最適pH值的測(cè)定
2.8.5 粗酶液最適反應(yīng)溫度的測(cè)定
2.8.6 熱穩(wěn)定性的研究
2.8.7 pH穩(wěn)定性的研究
2.8.8 金屬離子對(duì)酶活力的影響
第三章 結(jié)果與分析
1 Fosmid文庫(kù)的篩選
2 亞克隆文庫(kù)構(gòu)建與篩選
2.1 目的片段酶切產(chǎn)物與pUC19載體的連接
2.2 亞克隆文庫(kù)篩選結(jié)果
2.3 菌液PCR檢測(cè)
3 亞克隆序列分析
3.1 序列及其編碼氨基酸序列分析
3.2 理化性質(zhì)分析
3.3 功能結(jié)構(gòu)域分析
3.4 信號(hào)肽分析
3.5 Uncel185C10系統(tǒng)進(jìn)化分析
4 功能基因的原核表達(dá)
4.1 構(gòu)建目的基因表達(dá)載體
4.2 重組質(zhì)粒酶切驗(yàn)證
4.3 基因工程菌功能驗(yàn)證
5 誘導(dǎo)條件的優(yōu)化
5.1 最佳誘導(dǎo)劑劑量的確定
5.2 最佳誘導(dǎo)溫度的確定
5.3 最佳誘導(dǎo)時(shí)間的確定
6 CMCase酶學(xué)性質(zhì)分析
6.1 最適反應(yīng)pH的確定
6.2 最適反應(yīng)溫度的確定
6.3 CMCase的pH穩(wěn)定性
6.4 CMCase的溫度穩(wěn)定性
6.5 金屬離子對(duì)酶活力
第四章 討論
第五章 結(jié)論、創(chuàng)新點(diǎn)及下一步工作計(jì)劃
1 結(jié)論
2 創(chuàng)新點(diǎn)
3 下一步工作計(jì)劃
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡(jiǎn)介
本文編號(hào):3821287
【文章頁(yè)數(shù)】:56 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
目錄
第一章 文獻(xiàn)綜述及前言
1 能源植物—芒草的研究與發(fā)展戰(zhàn)略
1.1“綠金”代“黑金”的必然性
1.2 能源植物新秀—芒草
1.3 我國(guó)能源植物芒草的發(fā)展戰(zhàn)略
2 瘤胃未培養(yǎng)微生物及纖維素分解菌
2.1 未培養(yǎng)微生物
2.2 瘤胃微生物
2.2.1 瘤胃細(xì)菌
2.2.2 瘤胃原蟲(chóng)
2.2.3 瘤胃真菌
2.2.4 瘤胃微生物基因組信息
3 瘤胃微生物纖維素酶
3.1 瘤胃微生物纖維素酶的組成
3.2 芒草馴養(yǎng)對(duì)發(fā)掘牛瘤胃微生物纖維素酶的意義
4 宏基因組學(xué)——探索未培養(yǎng)微生物資源的重要途徑
4.1 宏基因組學(xué)研究策略
4.2 宏基因組學(xué)研究應(yīng)用進(jìn)展
4.2.1 在胃腸道微生物資源挖掘上的應(yīng)用
4.2.2 在口腔微生物研究領(lǐng)域中的應(yīng)用
4.2.3 在植物病害生物防治中的應(yīng)用
4.2.4 在自然環(huán)境微生物資源挖掘上的應(yīng)用
4.3 宏基因組技術(shù)存在的問(wèn)題及展望
5 本論文立題依據(jù)、研究目標(biāo)及技術(shù)路線
5.1 題依據(jù)
5.2 研究目標(biāo)
5.3 技術(shù)路線
第二章 材料與方法
1 材料
1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及飼養(yǎng)
1.2 實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備
1.3 實(shí)驗(yàn)藥品及試劑
2 方法
2.1 宏基因組Fosmid文庫(kù)克隆子的提取和保存
2.1.1 Fosmid文庫(kù)克隆子的提取
2.1.2 Fosmid文庫(kù)克隆子的保存
2.2 Fosmid文庫(kù)篩選
2.3 克隆文庫(kù)的構(gòu)建
2.3.1 Fosmid克隆質(zhì)粒的提取
2.3.2 pUC質(zhì)粒載體制備
2.3.3 目的片段酶切產(chǎn)物與pUC19載體的連接
2.3.4 連接產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化
2.3.5 克隆文庫(kù)的篩選
2.4 菌液PCR檢測(cè)
2.5 功能基因序列分析
2.6 原核表達(dá)載體的構(gòu)建
2.6.1 擴(kuò)增功能基因的編碼序列
2.6.2 PCR擴(kuò)增
2.6.3 pET30a(+)質(zhì)粒載體的提取
2.6.4 制備感受態(tài)
2.6.5 酶切體系
2.6.6 目的基因片段與表達(dá)載體DNA連接及轉(zhuǎn)化
2.7 誘導(dǎo)表達(dá)條件的優(yōu)化
2.7.1 最佳誘導(dǎo)劑劑量的確定
2.7.2 最佳誘導(dǎo)溫度的確定
2.7.3 最佳誘導(dǎo)時(shí)間的確定
2.8 CMCase酶學(xué)性質(zhì)初步研究
2.8.1 CMCase酶活力的測(cè)定
2.8.2 繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線
2.8.3 酶活測(cè)定
2.8.4 粗酶液最適pH值的測(cè)定
2.8.5 粗酶液最適反應(yīng)溫度的測(cè)定
2.8.6 熱穩(wěn)定性的研究
2.8.7 pH穩(wěn)定性的研究
2.8.8 金屬離子對(duì)酶活力的影響
第三章 結(jié)果與分析
1 Fosmid文庫(kù)的篩選
2 亞克隆文庫(kù)構(gòu)建與篩選
2.1 目的片段酶切產(chǎn)物與pUC19載體的連接
2.2 亞克隆文庫(kù)篩選結(jié)果
2.3 菌液PCR檢測(cè)
3 亞克隆序列分析
3.1 序列及其編碼氨基酸序列分析
3.2 理化性質(zhì)分析
3.3 功能結(jié)構(gòu)域分析
3.4 信號(hào)肽分析
3.5 Uncel185C10系統(tǒng)進(jìn)化分析
4 功能基因的原核表達(dá)
4.1 構(gòu)建目的基因表達(dá)載體
4.2 重組質(zhì)粒酶切驗(yàn)證
4.3 基因工程菌功能驗(yàn)證
5 誘導(dǎo)條件的優(yōu)化
5.1 最佳誘導(dǎo)劑劑量的確定
5.2 最佳誘導(dǎo)溫度的確定
5.3 最佳誘導(dǎo)時(shí)間的確定
6 CMCase酶學(xué)性質(zhì)分析
6.1 最適反應(yīng)pH的確定
6.2 最適反應(yīng)溫度的確定
6.3 CMCase的pH穩(wěn)定性
6.4 CMCase的溫度穩(wěn)定性
6.5 金屬離子對(duì)酶活力
第四章 討論
第五章 結(jié)論、創(chuàng)新點(diǎn)及下一步工作計(jì)劃
1 結(jié)論
2 創(chuàng)新點(diǎn)
3 下一步工作計(jì)劃
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡(jiǎn)介
本文編號(hào):3821287
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/3821287.html
最近更新
教材專著