過氧化物酶體增殖物激活受體γ (peroxisome proliferator-activatived receptors, PPARγ)在脂肪細胞分化、脂肪代謝、胰島素敏感性、糖代謝和能量平衡等過程中起重要的調(diào)節(jié)作用；而生肌因子5(myogenic factor 5, MYF5)調(diào)節(jié)肌肉定型、增殖、分化及生后肌肉生長。本試驗采用直接測序方法檢測PPARy和MYF5 2個基因編碼區(qū)的變異位點,并用飛行質(zhì)譜分型技術對235只家兔(伊拉兔93只,香檳兔81只,天府黑兔61只)候選SNPs進行基因分型,篩選出對經(jīng)濟性狀具有遺傳效應的SNPs,然后用271只新西蘭兔擴大樣本驗證關聯(lián)性,最后通過定量進一步研究PPARy基因的作用機制,以期篩選出可用于家兔分子育種的遺傳標記。試驗結果如下：1.通過直接測序在家兔PPARy基因編碼區(qū)檢測到1個同義突變(c.207A>C)；在MYF5基因編碼區(qū)檢測到2個同義突變(c.708C>T、c.66G>A)和1個非同義突變(c.571T>C),c.571T>C導致氨基酸由絲氨酸變?yōu)楦彼�；而c.708C>T位點的|ΔRSCU|...

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【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 文獻綜述
    1.1 國內(nèi)外兔業(yè)的發(fā)展現(xiàn)狀
    1.2 家兔生長發(fā)育特點及兔肉的營養(yǎng)價值
    1.3 影響家兔生長和兔肉質(zhì)量的因素
    1.4 PPARγ基因研究進展
        1.4.1 PPAR家族
        1.4.2 PPARγ基因簡介
        1.4.3 PPARγ生物學功能
        1.4.4 PPARγ基因在畜禽中的研究進展
    1.5 MYF5基因研究進展
        1.5.1 MYOD基因家族
        1.5.2 MYF5基因簡介
        1.5.3 MYF5生物學功能
        1.5.4 MYF5基因在畜禽中的研究進展
    1.6 Sequenom MassARRAY^TMSNP基因分型
    1.7 候選基因法在育種中的應用
    1.8 試驗研究目的和主要內(nèi)容
        1.8.1 試驗目的
        1.8.2 試驗主要內(nèi)容
        1.8.3 試驗技術方案流程
2 材料與方法
    2.1 試驗材料
        2.1.1 試驗動物
        2.1.2 耳組織及肝組織采集
    2.2 主要試劑與儀器
        2.2.1 主要試劑及試劑配制
        2.2.2 主要儀器
    2.3 試驗方法
        2.3.1 生長性狀測定
        2.3.2 全基因組DNA提取及檢測
        2.3.3 肝組織總RNA提取及檢測
        2.3.4 cDNA的合成
        2.3.5 目的基因擴增
        2.3.6 Sequenom MassARRAY^TMSNP基因分型
        2.3.7 PCR-RFLP基因分型
        2.3.8 熒光定量
        2.3.9 數(shù)據(jù)處理
3 試驗結果
    3.1 全基因組DNA提取以及肝臟組織總RNA提取結果
    3.2 變異位點檢測
    3.3 候選SNP篩選
    3.4 質(zhì)譜分型結果
    3.5 酶切分型結果
    3.6 遺傳結構分析結果
C位點基因型和等位基因頻率">        3.6.1 PPARγ c.207A>C位點基因型和等位基因頻率
C位點基因型和等位基因頻率">        3.6.2 MYF5 c.571T>C位點基因型和等位基因頻率
T位點基因型和等位基因頻率">        3.6.3 MYF5 c.708C>T位點基因型和等位基因頻率
    3.7 關聯(lián)性分析結果
C與家兔經(jīng)濟性狀的關聯(lián)分析">        3.7.1 PPARγ c.207A>C與家兔經(jīng)濟性狀的關聯(lián)分析
C與家兔經(jīng)濟性狀的關聯(lián)分析">        3.7.2 MYF5 c.571T>C與家兔經(jīng)濟性狀的關聯(lián)分析
T與家兔經(jīng)濟性狀的關聯(lián)分析">        3.7.3 MYF5 c.708C>T與家兔經(jīng)濟性狀的關聯(lián)分析
C位點不同基因型PPARγ基因mRNA相對表達量">    3.8 不同日齡階段和PPARγc.207A>C位點不同基因型PPARγ基因mRNA相對表達量
        3.8.1 標準曲線繪制和熔解曲線獲得
        3.8.2 不同日齡階段PPARγ基因mRNA表達量差異
C位點不同基因型mRNA表達量差異">        3.8.3 PPARγ c.207A>C位點不同基因型mRNA表達量差異
4 討論
    4.1 候選基因選擇
    4.2 基因多態(tài)性與家兔經(jīng)濟性狀相關
        4.2.1 PPARγ基因多態(tài)性與家兔經(jīng)濟性狀相關
        4.2.2 MYF5基因多態(tài)性與家兔經(jīng)濟性狀相關
    4.3 PPARγ基因mRNA表達量的變化
5 結論
6 展望
參考文獻
致謝
攻讀碩士期間發(fā)表文章情況



本文編號：3809826